| 摘要 | 第3-4页 |
| Abstract | 第4-5页 |
| 第1章 绪论 | 第9-13页 |
| 1.1 蛋白质耐热性研究进展 | 第9-10页 |
| 1.1.1 蛋白质耐热性概述 | 第9页 |
| 1.1.2 蛋白质耐热性的研究进展 | 第9-10页 |
| 1.2 残基相互作用网络的研究进展 | 第10页 |
| 1.2.1 残基相互作用网络概述 | 第10页 |
| 1.2.2 残基相互作用网络的研究进展 | 第10页 |
| 1.3 网络比对算法的研究进展 | 第10-11页 |
| 1.3.1 网络比对概述 | 第10页 |
| 1.3.2 网络比对算法的研究进展 | 第10-11页 |
| 1.4 本文的研究内容和意义 | 第11-13页 |
| 第2章 数据库、相关工具及网络比对数据集的构建 | 第13-21页 |
| 2.1 引言 | 第13页 |
| 2.2 数据库 | 第13-15页 |
| 2.2.1 PDB数据库 | 第13-14页 |
| 2.2.2 DSSP数据库 | 第14-15页 |
| 2.3 相关工具 | 第15-17页 |
| 2.3.1 BLAST序列比对 | 第15页 |
| 2.3.2 PyMOL软件与Cytoscape软件 | 第15-17页 |
| 2.4 网络比对数据集的构建 | 第17-18页 |
| 2.4.1 耐热性差异的水解酶 | 第17页 |
| 2.4.2 耐热性差异的抗冻蛋白 | 第17页 |
| 2.4.3 常温型与耐热型木聚糖酶 | 第17-18页 |
| 2.4.4 常温型脂肪酶与其耐热型突变体 | 第18页 |
| 2.5 本章小结 | 第18-21页 |
| 第3章 SI-MAGNA网络比对算法 | 第21-35页 |
| 3.1 引言 | 第21-22页 |
| 3.2 残基相互作用网络的构建 | 第22页 |
| 3.3 SI-MAGNA网络比对算法原理 | 第22-27页 |
| 3.3.1 交叉函数 | 第22-23页 |
| 3.3.2 适应度函数 | 第23-25页 |
| 3.3.3 算法框架 | 第25-26页 |
| 3.3.4 网络比对评价标准 | 第26-27页 |
| 3.4 结果与分析 | 第27-34页 |
| 3.4.1 比对结果 | 第27-28页 |
| 3.4.2 与MAGNA算法比较分析 | 第28-30页 |
| 3.4.3 SI-MAGNA方法的应用 | 第30-34页 |
| 3.5 本章小结 | 第34-35页 |
| 第4章 SI-MAGNA算法与GRAAL、MI-GRAAL、GEDEVO算法的比较研究 | 第35-43页 |
| 4.1 引言 | 第35页 |
| 4.2 GRAAL算法 | 第35-37页 |
| 4.2.1 代价函数 | 第35-36页 |
| 4.2.2 Graphlet度特征与Graphlet度特征相似性 | 第36-37页 |
| 4.3 MI-GRAAL算法 | 第37-38页 |
| 4.3.1 相似性特征 | 第37-38页 |
| 4.3.2 算法框架 | 第38页 |
| 4.4 CytoGEDEVO算法 | 第38-40页 |
| 4.4.1 图编辑距离 | 第38-39页 |
| 4.4.2 算法框架 | 第39-40页 |
| 4.4.3 CytoGEDEVO的优越性 | 第40页 |
| 4.5 与SI-MAGNA算法的比较分析 | 第40-42页 |
| 4.6 本章小结 | 第42-43页 |
| 第5章 基于SI-MAGNA算法的木聚糖酶耐热性研究 | 第43-53页 |
| 5.1 引言 | 第43页 |
| 5.2 木聚糖酶的网络比对 | 第43-46页 |
| 5.2.1 网络比对 | 第43-44页 |
| 5.2.2 比对结果 | 第44-46页 |
| 5.3 耐热性因素分析 | 第46-51页 |
| 5.3.1 总体结构比对分析 | 第46-49页 |
| 5.3.2 影响木聚糖酶耐热性的因素 | 第49-51页 |
| 5.4 本章小结 | 第51-53页 |
| 第6章 总结 | 第53-55页 |
| 6.1 论文总结 | 第53-54页 |
| 6.2 工作展望 | 第54-55页 |
| 致谢 | 第55-57页 |
| 参考文献 | 第57-63页 |
| 附录：氨基酸中英文对照及缩写 | 第63-64页 |
| 附录：作者在攻读硕士学位期间发表的论文 | 第64页 |
