| 摘要 | 第3-4页 |
| Abstract | 第4页 |
| 第一章 绪论 | 第7-13页 |
| 1.1 立题背景和意义 | 第7-8页 |
| 1.2 国内外研究进展 | 第8-11页 |
| 1.2.1 lncRNA的特性 | 第8页 |
| 1.2.2 lncRNA预测的方法 | 第8-9页 |
| 1.2.3 lncRNA功能的研究方法 | 第9页 |
| 1.2.4 lncRNA的作用方式 | 第9-10页 |
| 1.2.5 不同酵母中的lncRNA | 第10-11页 |
| 1.2.6 毕赤酵母转录组学的研究 | 第11页 |
| 1.3 本课题的研究思路和内容 | 第11-13页 |
| 1.3.1 课题研究思路 | 第11页 |
| 1.3.2 课题研究内容 | 第11-12页 |
| 1.3.3 课题来源 | 第12-13页 |
| 第二章 实验材料与方法 | 第13-21页 |
| 2.1 实验材料 | 第13-15页 |
| 2.1.1 菌株与质粒 | 第13页 |
| 2.1.2 培养基与溶液 | 第13-14页 |
| 2.1.3 主要试剂与仪器 | 第14-15页 |
| 2.2 实验方法 | 第15-21页 |
| 2.2.1 毕赤酵母转录组建库测序 | 第15页 |
| 2.2.2 毕赤酵母生物信息分析流程 | 第15页 |
| 2.2.3 毕赤酵母lncRNA预测 | 第15-16页 |
| 2.2.4 关键lncRNA的预测 | 第16页 |
| 2.2.5 荧光定量PCR | 第16页 |
| 2.2.6 菌株发酵方法 | 第16-17页 |
| 2.2.7 样品处理方法 | 第17页 |
| 2.2.8 酵母总RNA的提取 | 第17页 |
| 2.2.9 酵母cDNA文库的构建 | 第17页 |
| 2.2.10 lncRNA验证菌株的构建 | 第17-18页 |
| 2.2.11 lncRNA全长检测 | 第18-20页 |
| 2.2.12 酵母基因组的提取 | 第20页 |
| 2.2.13 酵母感受态的制备 | 第20-21页 |
| 第三章 结果与讨论 | 第21-46页 |
| 3.1 lncRNA预测及荧光定量PCR验证 | 第21-24页 |
| 3.1.1 lncRNA预测 | 第21-22页 |
| 3.1.2 荧光定量PCR验证 | 第22-23页 |
| 3.1.3 lncRNA的性质 | 第23-24页 |
| 3.2 关键lncRNA的预测 | 第24-34页 |
| 3.2.1 显著差异的lncRNA | 第24-25页 |
| 3.2.2 特异性表达的lncRNA | 第25-26页 |
| 3.2.3 反式调控的lncRNA的预测 | 第26-29页 |
| 3.2.4 顺式调控的聚类分析 | 第29-33页 |
| 3.2.5 lncRNA上相关基因作用位点的预测 | 第33-34页 |
| 3.2.6 小结 | 第34页 |
| 3.3 lncRNA的敲除及功能鉴定 | 第34-42页 |
| 3.3.1 构建lncRNA敲除菌株 | 第34-36页 |
| 3.3.2 lncRNA敲除菌株的摇瓶发酵 | 第36-37页 |
| 3.3.3 敲除菌株耐热性能的比较 | 第37-38页 |
| 3.3.4 lncRNA敲除菌株3L发酵罐发酵 | 第38-40页 |
| 3.3.5 lncRNA敲除菌株相关基因转录水平分析 | 第40-42页 |
| 3.4 lncRNA过表达菌株验证 | 第42-46页 |
| 3.4.1 lncRNA全长验证 | 第42页 |
| 3.4.2 构建lncRNA过表达菌株验证 | 第42-44页 |
| 3.4.3 lncRNA过表达菌株靶基因转录水平分析 | 第44-46页 |
| 主要结论与展望 | 第46-48页 |
| 致谢 | 第48-49页 |
| 参考文献 | 第49-53页 |
| 附录 | 第53-65页 |
| 附录：作者在攻读硕士期间发表的论文 | 第65页 |