| 摘要 | 第5-7页 |
| ABSTRACT | 第7-9页 |
| 第1章 关联分析及其在玉米遗传育种中的研究进展 | 第10-29页 |
| 摘要 | 第10页 |
| Abstract | 第10-11页 |
| 1.1 玉米复杂性状的研究现状和对策 | 第11-13页 |
| 1.2 关联分析 | 第13-16页 |
| 1.2.1 关联分析的理论 | 第13-14页 |
| 1.2.2 影响连锁不平衡的因素和LD的衰减 | 第14页 |
| 1.2.3 关联分析的特点 | 第14-15页 |
| 1.2.4 关联分析的策略 | 第15-16页 |
| 1.3 关联分析在玉米遗传育种中的应用 | 第16-20页 |
| 1.3.1 基于全基因组扫描的关联分析 | 第16-18页 |
| 1.3.2 基于候选基因的关联分析 | 第18-20页 |
| 1.4 关联分析在玉米应用中存在的问题及策略 | 第20-22页 |
| 1.5 关联分析在玉米应用中前景和展望 | 第22-23页 |
| 参考文献 | 第23-29页 |
| 第2章 玉米LEAFY基因序列变异及其与产量相关性状的关联分析 | 第29-53页 |
| 摘要 | 第29页 |
| Abstract | 第29-31页 |
| 2.1. 材料与方法 | 第31-32页 |
| 2.1.1 试验材料和田间试验设计 | 第31-32页 |
| 2.1.2 产量相关性状的测定 | 第32页 |
| 2.1.3 DNA提取以及LEAFY基因的测序 | 第32页 |
| 2.1.4 序列分析 | 第32页 |
| 2.1.5 群体遗传结构分析 | 第32页 |
| 2.1.6 基于候选基因的关联分析 | 第32页 |
| 2.2 结果分析 | 第32-39页 |
| 2.2.1 玉米LEAFY基因的核苷酸序列变异 | 第32-37页 |
| 2.2.2 核苷酸多态性以及杂种优势群中的选择 | 第37-38页 |
| 2.2.3 玉米LEAFY基因的单倍体型分析 | 第38-39页 |
| 2.2.4 玉米LEAFY基因的遗传重组 | 第39页 |
| 2.3 产量相关性状的统计分析 | 第39页 |
| 2.4 玉米LEAFY基因多态性位点的连锁不平衡分析 | 第39-45页 |
| 2.5 玉米LEAFY基因编码区多态性位点与产量相关性状的关联分析 | 第45页 |
| 2.6 讨论与结论 | 第45-51页 |
| 参考文献 | 第51-53页 |
| 第3章 玉米RTCS基因序列变异及其与产量相关性状的关联分析 | 第53-71页 |
| 摘要 | 第53页 |
| Abstract | 第53-56页 |
| 3.1 材料与方法 | 第56-58页 |
| 3.1.1 试验材料和田间试验设计 | 第56页 |
| 3.1.2 产量相关性状的测定 | 第56页 |
| 3.1.3 DNA的提取和RTCS基因重测序 | 第56页 |
| 3.1.4 序列分析 | 第56页 |
| 3.1.5 群体遗传结构分析 | 第56页 |
| 3.1.6 基于候选基因的关联分析 | 第56-58页 |
| 3.2 结果分析 | 第58-63页 |
| 3.2.1 玉米RTCS基因核苷酸序列变异 | 第58-59页 |
| 3.2.2 每个杂种优势群的核苷酸多样性和选择 | 第59-60页 |
| 3.2.3 玉米RTCS基因的单倍型分析 | 第60页 |
| 3.2.4 玉米RTCS基因的遗传重组 | 第60-63页 |
| 3.3 产量相关性状的统计分析 | 第63页 |
| 3.4 玉米RTCS基因多态性位点的连锁不平衡分析 | 第63-67页 |
| 3.5 玉米RTCS基因编码区多态性位点与产量相关性状的关联分析 | 第67-68页 |
| 3.6 结论与讨论 | 第68页 |
| 参考文献 | 第68-71页 |
| 第4章 玉米dbf1基因序列变异及其与产量相关性状的关联分析 | 第71-87页 |
| 摘要 | 第71页 |
| Abstract | 第71-72页 |
| 4.1 材料和方法 | 第72-75页 |
| 4.1.1 试验材料 | 第72页 |
| 4.1.2 产量相关性状的测定 | 第72页 |
| 4.1.3 DNA提取和dbf1基因测序 | 第72-74页 |
| 4.1.4 数据分析 | 第74页 |
| 4.1.5 LD结构分析 | 第74页 |
| 4.1.6 基于候选基因的关联分析 | 第74-75页 |
| 4.2 结果与分析 | 第75-80页 |
| 4.2.1 核苷酸序列变异 | 第75-77页 |
| 4.2.2 玉米dbf1基因的单倍型分析 | 第77页 |
| 4.2.3 玉米dbf1基因的遗传重组 | 第77页 |
| 4.2.4 玉米dbf1基因序列变异的中性检测 | 第77-80页 |
| 4.3 产量相关性状的统计分析 | 第80页 |
| 4.4 玉米dbf1基因多态性位点的连锁不平衡和关联分析 | 第80-81页 |
| 4.5 讨论 | 第81-85页 |
| 参考文献 | 第85-87页 |
| 附表 | 第87-95页 |
| 攻读博士学位期间发表的论文 | 第95-96页 |
| 致谢 | 第96-97页 |
| 缩略词表 | 第97-98页 |
