牦牛基因组数据库建设
| 中文摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 第一章 研究背景 | 第12-37页 |
| 1.1 基因组学概述 | 第12-18页 |
| 1.1.1 基因组 | 第12-13页 |
| 1.1.2 基因组测序技术 | 第13-15页 |
| 1.1.3 第二代测序技术推动多物种全基因组测序 | 第15-18页 |
| 1.2 牦牛基因组研究进展 | 第18-20页 |
| 1.3 基因组数据库研究进展 | 第20-26页 |
| 1.3.1 基因组数据库的功能 | 第20-21页 |
| 1.3.2 基因组数据库的分类及特点 | 第21-24页 |
| 1.3.3 基因组浏览器 | 第24-26页 |
| 1.4 牦牛基因组数据库相关数据 | 第26-35页 |
| 1.4.1 重复序列 | 第26-29页 |
| 1.4.2 基因功能注释 | 第29页 |
| 1.4.3 比较基因组数据 | 第29-34页 |
| 1.4.4 群体基因组数据 | 第34-35页 |
| 1.5 研究目的和意义 | 第35-37页 |
| 第二章 材料和方法 | 第37-53页 |
| 2.1 数据准备 | 第37-43页 |
| 2.1.1 注释重复序列 | 第37-38页 |
| 2.1.2 基因功能注释 | 第38-39页 |
| 2.1.3 比较基因组数据 | 第39-43页 |
| 2.1.4 牦牛群体基因组 | 第43页 |
| 2.2 数据库平台构建 | 第43-48页 |
| 2.2.1 硬件与软件平台 | 第43-45页 |
| 2.2.2 数据库的结构 | 第45-47页 |
| 2.2.3 创建数据库 | 第47-48页 |
| 2.3 数据库网页构建 | 第48-53页 |
| 2.3.1 注释检索 | 第49页 |
| 2.3.2 基因信息 | 第49-50页 |
| 2.3.3 序列搜索 | 第50页 |
| 2.3.4 基因组浏览器 | 第50-51页 |
| 2.3.5 引物设计 | 第51页 |
| 2.3.6 共线性浏览器 | 第51-53页 |
| 第三章 结果 | 第53-64页 |
| 3.1 数据库数据 | 第53-56页 |
| 3.1.1 重复序列注释 | 第53-54页 |
| 3.1.2 基因功能注释 | 第54-55页 |
| 3.1.3 全基因组比对 | 第55-56页 |
| 3.2 数据库网页 | 第56-64页 |
| 3.2.1 文本搜索 | 第56-59页 |
| 3.2.2 基因组浏览器 | 第59-60页 |
| 3.2.3 序列搜索 | 第60页 |
| 3.2.4 全基因组比对浏览器 | 第60-61页 |
| 3.2.5 数据下载 | 第61页 |
| 3.2.6 群体基因组 | 第61-64页 |
| 第四章 讨论 | 第64-72页 |
| 4.1 数据库数据 | 第64-66页 |
| 4.1.1 重复序列注释 | 第64-65页 |
| 4.1.2 基因功能注释 | 第65页 |
| 4.1.3 全基因组比对 | 第65-66页 |
| 4.2 牦牛基因组数据库 | 第66-69页 |
| 4.3 对数据库分析平台的展望 | 第69-72页 |
| 参考文献 | 第72-80页 |
| 在学期间的研究成果 | 第80-81页 |
| 致谢 | 第81-82页 |
| 作者简历 | 第82-83页 |
| 附录 | 第83-92页 |
