| 中文摘要 | 第8-10页 |
| Abstract | 第10-11页 |
| 1 引言 | 第12-22页 |
| 1.1 小麦族概述 | 第12-16页 |
| 1.1.1 小麦族系统分类 | 第12-14页 |
| 1.1.2 小麦族物种的起源与进化 | 第14-16页 |
| 1.1.2.1 小麦族二倍体物种的进化 | 第15-16页 |
| 1.1.2.2 小麦族多倍体物种的进化 | 第16页 |
| 1.2 植物抗病性 | 第16-18页 |
| 1.2.1 抗病蛋白的结构 | 第16-17页 |
| 1.2.2 抗病蛋白的分类 | 第17-18页 |
| 1.2.2.1 NBS-LRR类抗病蛋白 | 第17页 |
| 1.2.2.2 LRR-TM类抗病蛋白 | 第17页 |
| 1.2.2.3 STK类抗病蛋白 | 第17-18页 |
| 1.2.2.4 RLK类抗病蛋白 | 第18页 |
| 1.2.2.5 SA-CC类抗病蛋白 | 第18页 |
| 1.3 基因家族 | 第18-19页 |
| 1.3.1 基因家族形成的分子机制 | 第18-19页 |
| 1.3.1.1 基因复制和点突变 | 第18页 |
| 1.3.1.2 自然选择和随机漂变 | 第18-19页 |
| 1.3.2 NBS基因家族研究现状 | 第19页 |
| 1.4 高通量测序技术 | 第19-21页 |
| 1.4.1 第二代测序技术 | 第19-20页 |
| 1.4.2 第三代测序技术 | 第20-21页 |
| 1.4.3 高通量转录组测序技术 | 第21页 |
| 1.5 本课题的研究目的和意义 | 第21-22页 |
| 2 材料和方法 | 第22-29页 |
| 2.1 实验材料 | 第22页 |
| 2.2 实验方法 | 第22-29页 |
| 2.2.1 RNA提取前准备工作 | 第22-23页 |
| 2.2.1.1 试剂准备 | 第22-23页 |
| 2.2.1.2 器材处理 | 第23页 |
| 2.2.2 RNA提取过程 | 第23-25页 |
| 2.2.2.1 利用RNAprepPure试剂盒提取RNA | 第23-24页 |
| 2.2.2.2 利用多糖多酚植物试剂盒提取RNA | 第24-25页 |
| 2.2.3 RNA检测 | 第25页 |
| 2.2.3.1 RNA浓度测定 | 第25页 |
| 2.2.3.2 RNA凝胶电泳检测 | 第25页 |
| 2.2.4 二代转录组建库测序和组装 | 第25-26页 |
| 2.2.4.1 RNA建库测序 | 第25页 |
| 2.2.4.2 质控及无参组装 | 第25-26页 |
| 2.2.5 三代全长转录组建库测序和校正 | 第26-27页 |
| 2.2.5.1 RNA建库测序 | 第26-27页 |
| 2.2.5.2 全长转录组数据质控及校正 | 第27页 |
| 2.2.6 预测转录本编码区 | 第27页 |
| 2.2.7 NBS基因家族同源序列查找 | 第27页 |
| 2.2.8 NBS基因家族同源序列鉴定 | 第27-28页 |
| 2.2.9 NBS蛋白序列的保守结构域检查和分类 | 第28页 |
| 2.2.10 序列比对和保守结构域分析 | 第28页 |
| 2.2.11 系统进化分析 | 第28-29页 |
| 2.2.12 进化压力计算 | 第29页 |
| 2.2.13 保守基序结构分析 | 第29页 |
| 3 结果与分析 | 第29-49页 |
| 3.1 转录组测序结果 | 第29-30页 |
| 3.2 NBS基因家族同源序列搜索与鉴定 | 第30-31页 |
| 3.3 NBS基因家族同源序列的分类 | 第31页 |
| 3.4 序列比对和保守结构域分析 | 第31-33页 |
| 3.5 系统进化分析 | 第33-38页 |
| 3.6 进化压力计算 | 第38-42页 |
| 3.7 保守基序结构分析 | 第42-49页 |
| 4 讨论 | 第49-52页 |
| 4.1 转录组数据 | 第49-50页 |
| 4.2 NBS基因家族同源序列搜索与鉴定 | 第50页 |
| 4.3 NBS蛋白序列分类 | 第50-51页 |
| 4.4 系统进化分析 | 第51页 |
| 4.5 进化压力计算 | 第51-52页 |
| 5 结论 | 第52-53页 |
| 参考文献 | 第53-61页 |
| 致谢 | 第61页 |