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TEAD1基因功能研究及其新的转录调控靶基因的鉴定

中文摘要第8-10页
ABSTRACT第10-12页
缩略词表第13-14页
1 前言第14-29页
    1.1 研究问题的由来第14页
    1.2 文献综述第14-27页
        1.2.1 骨骼肌的发育过程第14-16页
        1.2.2 调节骨骼肌发育的重要转录因子第16-17页
        1.2.3 转录因子TEAD1家族的调控作用第17-20页
        1.2.4 CHIP-on-chip筛选出的TEAD1的靶基因分析第20-22页
        1.2.5 基因转录水平调控的研究方法第22-27页
            1.2.5.1 基因顺式作用元件的研究方法第23-24页
            1.2.5.2 DNA-蛋白质互作的研究方法第24-27页
    1.3 本研究的目的及意义第27-29页
2 材料与方法第29-50页
    2.1 材料第29-35页
        2.1.1 实验样品第29页
        2.1.2 细胞系、菌株和载体第29-31页
        2.1.3 主要试剂及配制第31-33页
            2.1.3.1 购买试剂、耗材及技术服务第31-32页
            2.1.3.2 配制试剂第32-33页
        2.1.4 实验所需仪器设备第33页
        2.1.5 生物信息学分析网站及软件第33-35页
    2.2 方法第35-50页
        2.2.1 本研究的技术路线第35页
        2.2.2 生物信息学分析第35页
        2.2.3 DNA,RNA和cDNA样品的制备第35-38页
            2.2.3.1 小鼠肌肉组织DNA的提取第35-36页
            2.2.3.2 组织和细胞RNA的提取第36-38页
        2.2.4 超表达载体和启动子载体构建第38-40页
            2.2.4.1 TEAD1超表达载体的构建第38-39页
            2.2.4.2 靶基因启动子载体的构建第39-40页
        2.2.5 目标基因的表达量检测第40-42页
            2.2.5.1 小鼠TEAD1基因的组织表达谱第40页
            2.2.5.2 靶基因表达量检测第40-42页
        2.2.6 细胞培养及转染第42-44页
            2.2.6.1 细胞复苏第42-43页
            2.2.6.2 细胞培养第43页
            2.2.6.3 细胞转染第43-44页
            2.2.6.4 细胞冻存第44页
        2.2.7 细胞周期检测方法第44-45页
        2.2.8 靶基因启动子活性测定第45-46页
        2.2.9 凝胶迁移实验(EMSA)第46-50页
            2.2.9.1 靶基因探针的设计第46-47页
            2.2.9.2 小鼠肌肉细胞核蛋白的提取第47-48页
            2.2.9.3 EMSA实验设计第48-49页
            2.2.9.4 EMSA操作步骤第49-50页
3 实验结果第50-65页
    3.1 芯片数据及靶基因分析第50-51页
    3.2 TEAD1基因功能研究第51-57页
        3.2.1 组织及细胞总RNA提取结果第51-52页
        3.2.2 TEAD1基因的表达谱第52-53页
            3.2.2.1 小鼠TEAD1基因的组织表达谱第52页
            3.2.2.2 在C2C12细胞不同分化时期TEAD1基因的表达量第52-53页
        3.2.3 TEAD1基因对C2C12细胞增殖分化的影响第53-57页
            3.2.3.1 TEAD1基因在C2C12细胞中的真核表达结果第53-54页
            3.2.3.2 C2C12细胞分化标记基因的表达量结果第54-55页
            3.2.3.3 TEAD1基因的超表达对细胞增殖的影响第55-57页
    3.3 靶基因验证结果第57-62页
        3.3.1 Mrpl21,Ndufa6,Ccne1为TEAD1的靶基因第57-60页
            3.3.1.1 Mrpl21,Ndufa6,Ccne1基因启动子序列预测第57-58页
            3.3.1.2 靶基因表达量变化第58-59页
            3.3.1.3 靶基因的启动子活性检测第59-60页
            3.3.1.4 EMSA实验验证靶基因第60页
        3.3.2 Ankrd42基因间接受TEAD1调控第60-62页
            3.3.2.1 Ankrd42受TEAD1调控的证据第60-62页
            3.3.2.2 Ankrd42基因不直接受TEAD1调控第62页
    3.4 靶基因功能初步研究第62-65页
        3.4.1 靶基因在分化的C2C12细胞中的表达结果第62-63页
        3.4.2 Mrpl21基因的启动子分析第63-65页
4 讨论第65-72页
    4.1 关于本研究的思路第65页
    4.2 实验结果的讨论第65-68页
        4.2.1 转录因子TEAD1对C2C12细胞增殖分化的影响分析第65-66页
        4.2.2 TEAD1如何实现对靶基因的调控第66-67页
        4.2.3 TEAD1对靶基因调控的意义第67-68页
        4.2.4 Mrpl21基因表达调控的深入理解第68页
    4.3 实验方法的讨论第68-72页
        4.3.1 关于基因启动子的生物信息学分析第68-69页
        4.3.2 超表达载体及启动子载体的构建第69-70页
        4.3.3 细胞周期检测实验的条件控制第70页
        4.3.4 成功的EMSA实验需要注意的事项第70-72页
5 小结第72-74页
    5.1 本研究的主要结果与结论第72-73页
    5.2 本研究的创新点与特色第73页
    5.3 本研究不足之处与进一步工作的建议第73-74页
参考文献第74-82页
附录第82-85页
攻研期间发表与接受的文章第85-86页
致谢第86页

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