| 中文摘要 | 第4-8页 |
| Abstract | 第8-11页 |
| 第一章 绪论 | 第20-34页 |
| 1.1 结直肠癌研究概况 | 第20-25页 |
| 1.1.1 结直肠癌的流行病学特征 | 第20-21页 |
| 1.1.2 结直肠癌的TNM分期 | 第21-22页 |
| 1.1.3 结直肠癌的危险因素 | 第22-23页 |
| 1.1.4 结直肠癌的诊断和治疗 | 第23-25页 |
| 1.2 基因芯片技术 | 第25-28页 |
| 1.2.1 基因芯片的产生背景 | 第25-26页 |
| 1.2.2 基因芯片的概念 | 第26页 |
| 1.2.3 基因芯片技术的基本原理 | 第26-27页 |
| 1.2.4 基因芯片技术的四个技术环节 | 第27-28页 |
| 1.2.5 基因芯片的分类 | 第28页 |
| 1.3 生物信息学分析 | 第28-31页 |
| 1.3.1 生物信息学的产生背景和主要内容 | 第28-30页 |
| 1.3.2 常用的数据库资源 | 第30-31页 |
| 1.4 芯片和生物信息学技术在结直肠癌中的应用 | 第31-32页 |
| 1.5 研究目的及意义 | 第32-34页 |
| 第二章 基于芯片数据的生物信息学分析来挖掘结直肠癌中的关键基因 | 第34-56页 |
| 2.1 研究目的及意义 | 第34页 |
| 2.2 材料和方法 | 第34-43页 |
| 2.2.1 芯片数据来源 | 第34-36页 |
| 2.2.2 芯片数据预处理 | 第36页 |
| 2.2.3 差异表达分析 | 第36-37页 |
| 2.2.4 结直肠癌基因搜索 | 第37-39页 |
| 2.2.5 PPI网络构建 | 第39-40页 |
| 2.2.6 重启型随机游走分析 | 第40-41页 |
| 2.2.7 富集分析 | 第41-42页 |
| 2.2.8 药物-基因相互作用分析 | 第42-43页 |
| 2.3 结果 | 第43-53页 |
| 2.3.1 差异基因和种子基因分析 | 第43-45页 |
| 2.3.2 差异表达基因的功能和通路富集分析 | 第45-47页 |
| 2.3.3 KEGG通路的调控 | 第47-48页 |
| 2.3.4 从CRC.PPI网站筛选到的前50个节点 | 第48-52页 |
| 2.3.5 药物-基因相互作用分析 | 第52-53页 |
| 2.4 本章小结 | 第53-56页 |
| 第三章 结直肠癌中关键基因的验证及功能分析 | 第56-76页 |
| 3.1 研究目的与意义 | 第56页 |
| 3.2 材料和方法 | 第56-66页 |
| 3.2.1 材料 | 第56-58页 |
| 3.2.2 实验方法 | 第58-66页 |
| 3.3 结果 | 第66-74页 |
| 3.3.1 qRT-PCR测定不同分期结直肠癌的CCND1，AURKA和NEDD9的表达情况 | 第66页 |
| 3.3.2 半定量RT-PCR和q RT-PCR检测细胞系中CCND1，AURKA和NEDD9的表达情况 | 第66-68页 |
| 3.3.3 siRNA转染SW480细胞沉默AURKA表达 | 第68页 |
| 3.3.4 AURKA沉默对SW480细胞增殖和细胞周期的影响 | 第68-70页 |
| 3.3.5 AURKA沉默对SW480细胞凋亡的影响 | 第70-71页 |
| 3.3.6 siRNA转染SW480细胞沉默CCND1表达 | 第71-72页 |
| 3.3.7 CCND1沉默对SW480细胞增殖和细胞周期的影响 | 第72-73页 |
| 3.3.8 CCND1沉默对SW480细胞凋亡的影响 | 第73-74页 |
| 3.4 本章小结 | 第74-76页 |
| 第四章 讨论 | 第76-86页 |
| 第五章 结论 | 第86-88页 |
| 参考文献 | 第88-100页 |
| 作者简介及科研成果 | 第100-102页 |
| 致谢 | 第102页 |
