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籼粳稻杂种不育系统S5的蛋白互作及转录组研究

摘要第7-9页
Abstract第9-11页
缩略词表第12-13页
1 前言第13-36页
    1.1 研究问题的由来第13页
    1.2 文献综述第13-35页
        1.2.1 水稻籼粳亚种间的生殖隔离第13-14页
        1.2.2 籼粳杂种不育基因的定位第14-16页
        1.2.3 籼粳杂种不育基因的克隆第16-17页
        1.2.4 杂种不育的分子演化机制第17-21页
        1.2.5 籼粳杂种不育位点S5的研究进展第21-23页
        1.2.6 植物天冬氨酸蛋白酶研究进展第23-25页
        1.2.7 植物细胞壁研究进展第25-32页
        1.2.8 植物内质网胁迫第32-34页
        1.2.9 水稻花粉绒毡层程序性死亡第34-35页
    1.3 研究的目的和意义第35-36页
2 材料和方法第36-46页
    2.1 材料第36-37页
        2.1.1 植物材料和细胞系第36页
        2.1.2 载体和菌株第36-37页
        2.1.3 实验试剂第37页
    2.2 实验方法第37-44页
        2.2.1 基因蛋白信息查询相关网站第37-38页
        2.2.2 酵母双杂交文库的筛选第38-39页
        2.2.3 烟草BY-2 稳定表达细胞系的构建第39-40页
        2.2.4 植物细胞瞬时表达第40页
        2.2.5 组织切片染色第40-41页
        2.2.6 水稻DNA抽提和转基因植株阳性检测第41页
        2.2.7 水稻蛋白抽提和Western Blot第41-42页
        2.2.8 利用原生质体确定膜拓扑结构第42页
        2.2.9 病菌接种和病斑测量第42页
        2.2.10 表达量以及OsbZIP50的检测第42-43页
        2.2.11 取样和转录组文库构建第43页
        2.2.12 数据分析第43-44页
    2.3 载体第44-46页
3 结果与分析第46-90页
    3.1 ORF3-5 互作蛋白的寻找第46-52页
        3.1.1 穗组织酵母双杂交文库的构建第46页
        3.1.2 酵母双杂交文库的筛选第46-49页
        3.1.3 ORF4+互作蛋白推测与验证第49-52页
    3.2 ORF4和ORF5稳定悬浮细胞系的构建与处理第52-54页
    3.3 ORF4和ORF5的共定位研究第54-55页
    3.4 ORF5在拟南芥中影响PR基因的表达第55-56页
    3.5 ORF5+的天冬氨酸蛋白酶活性位点诱变第56-58页
    3.6 Balilla,BalillaORF5+和BalillaORF3+ORF5+胚囊发育过程第58-60页
    3.7 败育胚囊MAPK6含量分析第60页
    3.8 ORF3+的功能研究第60-61页
    3.9 转录组数据分析第61-80页
        3.9.1 RNAseq文库的构建与测序第61-62页
        3.9.2 BL5+/BL差异表达基因分析第62-67页
        3.9.3 BL5+/BL中内质网胁迫和PCD相关基因分析第67-68页
        3.9.4 BL5+/BL中细胞壁重构相关基因分析第68-70页
        3.9.5 BL5+中纤维素的积累第70-72页
        3.9.6 BL5+中胼胝质的积累第72-74页
        3.9.7 BL5+/BL中驱动蛋白表达量变化分析第74-75页
        3.9.8 BL3+5+/BL差异表达基因分析第75-78页
        3.9.9 BL3+5+/BL5+差异表达基因分析第78-80页
        3.9.10 基于转录组分析推测的S5位点作用模式第80页
    3.10 ORF4功能研究第80-90页
        3.10.1 ORF4+的跨膜拓扑结构第80-82页
        3.10.2 ORF4+内吞位点分析第82-84页
        3.10.3 ORF4+影响株高和分蘖数第84-85页
        3.10.4 假病斑与胼胝质的积累第85-86页
        3.10.5 ORF4+的抗病性第86-87页
        3.10.6 ORF4+的敲除第87-90页
4 讨论第90-96页
    4.1 S5位点控制的胚囊败育是一个复杂的过程第90-91页
    4.2 ORF4和ORF5的表达模式与胚囊败育第91页
    4.3 S5诱导的PCD第91页
    4.4 细胞壁相关基因与S5介导的胚囊败育第91-92页
    4.5 ORF5功能探讨第92-93页
    4.6 ORF4功能探讨第93-94页
    4.7 ORF3功能探讨第94页
    4.8 不同系统对S5筛选互作蛋白的影响第94-95页
    4.9 总结与展望第95-96页
参考文献第96-115页
附录第115-138页
    附录I 附表第115-123页
        附表 1 细胞壁相关基因的log2表达量变化第115-119页
        附表 2 Real-time PCR引物第119-123页
    附录II 部分实验的详细步骤第123-137页
        Protocol 1 水稻原生质体瞬时表达第123-125页
        Protocol 2 利用拟南芥悬浮细胞系做原生质体瞬时表达第125-126页
        Protocol 3 苯酚-氯仿纯化获取高纯度质粒第126-128页
        Protocol 4 转基因BY-2 悬浮细胞系的构建第128-129页
        Protocol 5 植物组织石蜡切片第129-132页
        Protocol 6 大肠杆菌感受态的制备第132-133页
        Protocol 7 农杆菌感受态制备第133-134页
        Protocol 8 酵母试剂配方第134-135页
        Protocol 9 RNA抽提和反转录第135-136页
        Protocol 10 SDs-PAGE和Western Blot配方第136-137页
    附录III 作者简介第137-138页
致谢第138-139页

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