摘要 | 第6-8页 |
ABSTRACT | 第8-10页 |
缩略词表 | 第11-12页 |
1 文献综述 | 第12-30页 |
1.1 苎麻 | 第12-22页 |
1.1.1 苎麻纤维生产 | 第12-14页 |
1.1.2 苎麻育种 | 第14-17页 |
1.1.3 分子生物学手段在苎麻中的应用 | 第17-22页 |
1.2 细胞壁生物合成的分子调控 | 第22-25页 |
1.3 Expansin基因家族研究进展 | 第25-29页 |
1.4 研究目的与意义 | 第29-30页 |
2 苎麻纤维发育相关转录组测序 | 第30-59页 |
2.1 前言 | 第30-31页 |
2.2 材料与方法 | 第31-37页 |
2.2.1 RNA提取方法优化 | 第31-33页 |
2.2.2 苎麻纤维发育相关转录组分析 | 第33-37页 |
2.3 结果与分析 | 第37-53页 |
2.3.1 RNA提取方法优化 | 第37-40页 |
2.3.2 苎麻纤维发育相关转录组分析 | 第40-53页 |
2.4 讨论 | 第53-59页 |
2.4.1 苎麻总RNA提取 | 第53-54页 |
2.4.2 苎麻转录组样品制备 | 第54-55页 |
2.4.3 与苎麻纤维发育相关的三个基因家族 | 第55-56页 |
2.4.4 在苎麻茎皮上部样品中具有全上调表达特性基因的qRT-PCR结果 | 第56-58页 |
2.4.5 转录组测序结果中的其它数据 | 第58-59页 |
3 Expansin家族基因克隆与表达分析 | 第59-91页 |
3.1 前言 | 第59页 |
3.2 材料与方法 | 第59-62页 |
3.2.1 基于同源序列进行克隆及表达分析 | 第60-61页 |
3.2.2 基于转录组测序信息进行克隆及表达分析 | 第61-62页 |
3.3 结果与分析 | 第62-82页 |
3.3.1 基于同源序列进行克隆及表达分析 | 第62-73页 |
3.3.2 基于转录组测序信息进行克隆及表达分析 | 第73-82页 |
3.4 讨论 | 第82-91页 |
3.4.1 使用简并引物进行基因克隆 | 第82-84页 |
3.4.2 使用UFW方法克隆侧翼序列 | 第84-86页 |
3.4.3 苎麻expansin基因全长克隆 | 第86-88页 |
3.4.4 对苎麻expansin家族基因进行表达分析 | 第88-91页 |
4 小结与展望 | 第91-94页 |
4.1 苎麻分子生物学研究 | 第91-92页 |
4.2 苎麻纤维发育相关研究 | 第92-94页 |
参考文献 | 第94-109页 |
附录I 无意义注释结果unigene重新生成 15条注释说明(随机选取 10条unigene) | 第109-114页 |
附录II 人工筛选更改前后unigene注释(随机选取40条unigene) | 第114-116页 |
附录III 转录组测序结果中具有差异表达特性基因详情 | 第116-121页 |
附录IV 转录组测序结果中不同密码子使用频率 | 第121-122页 |
附录V 拟南芥和水稻expansin家族氨基酸序列 | 第122-128页 |
附录VI 改进后的UFW操作步骤 | 第128-129页 |
附录VII 使用转录组信息克隆苎麻expansin家族基因过程中用到的引物 | 第129-132页 |
附录VIII 苎麻expansin基因在三季麻不同生长发育时期不同茎皮部位样品中的相对表达量 | 第132-133页 |
发表文章 | 第133-134页 |
致谢 | 第134-136页 |