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甘蓝型油菜应答干旱胁迫的组学研究

摘要第8-11页
Abstract第11-14页
缩略词表第15-16页
1 文献综述第16-32页
    1.1 干旱胁迫对植物生长的影响第16-17页
    1.2 植物耐旱的分子机制第17-23页
        1.2.1 植物感应干旱胁迫信号以及信号传导第17-18页
        1.2.2 植物耐旱相关的基因第18-23页
    1.3 转录组学技术在甘蓝型油菜研究中的应用第23-24页
    1.4 蛋白质组学技术在甘蓝型油菜研究中的应用第24-31页
        1.4.1 蛋白质组学技术简介第25-28页
        1.4.2 蛋白质组学技术在油菜研究中的应用第28-31页
    1.5 研究的目的与意义第31-32页
2 甘蓝型油菜响应干旱胁迫的形态结构和生理生化研究第32-39页
    2.1 引言第32页
    2.2 材料与方法第32-35页
        2.2.1 实验材料种植与干旱处理第32-33页
        2.2.2 甘蓝型油菜干旱处理的表型观察第33页
        2.2.3 植物离体叶片失水率的测定第33-34页
        2.2.4 相对含水量的测定第34页
        2.2.5 脯氨酸含量的测定第34页
        2.2.6 叶绿素含量的测定第34-35页
    2.3 结果与分析第35-38页
        2.3.1 干旱胁迫对甘蓝型油菜生长的影响第35页
        2.3.2 甘蓝型油菜离体叶片失水率的变化第35-36页
        2.3.3 干旱胁迫对油菜叶片相对含水量的影响第36-37页
        2.3.4 干旱处理对油菜渗透保护物质积累的影响第37页
        2.3.5 干旱处理对甘蓝型油菜叶绿素含量的影响第37-38页
    2.4 讨论第38-39页
        2.4.1 甘蓝型油菜通过控制营养生长适应干旱胁迫第38页
        2.4.2 甘蓝型油菜响应干旱胁迫的生理学复杂性第38-39页
3 甘蓝型油菜应答干旱胁迫的转录组学研究第39-51页
    3.1 引言第39-40页
    3.2 材料与方法第40-43页
        3.2.1 实验材料种植与处理第40页
        3.2.2 RNA提取、质量检测及浓度确定第40-41页
        3.2.3 RNA-seq文库构建和测序第41页
        3.2.4 测序数据的处理与筛选第41-42页
        3.2.5 差异表达基因功能分析第42-43页
    3.3 结果与分析第43-47页
        3.3.1 甘蓝型油菜应答干旱胁迫差异表达基因的筛选第43页
        3.3.2 差异表达基因的功能分析第43-44页
        3.3.3 差异表达基因的代谢通路分析第44-47页
        3.3.4 甘蓝型油菜转录因子基因在干旱胁迫下的表达分析第47页
    3.4 讨论第47-51页
        3.4.1 甘蓝型油菜响应干旱胁迫差异表达基因的分析第47-48页
        3.4.2 转录因子与蛋白激酶的调控分析第48-51页
4 甘蓝型油菜应答干旱胁迫的比较蛋白质组学研究第51-69页
    4.1 引言第51页
    4.2 材料与方法第51-54页
        4.2.1 实验材料种植与处理第51页
        4.2.2 蛋白质提取及浓度测定第51-52页
        4.2.3 甘蓝型油菜叶片蛋白 2-DE电泳第52-53页
        4.2.4 甘蓝型油菜叶片总蛋白 2D-DIGE电泳第53页
        4.2.5 蛋白质胶内酶解和质谱鉴定第53-54页
        4.2.6 蛋白质功能分类、聚类分析和pathway分析第54页
        4.2.7 qRT-PCR分析第54页
    4.3 结果与分析第54-59页
        4.3.1 甘蓝型油菜响应干旱胁迫的 2D-DIGE分析第54-55页
        4.3.2 甘蓝型油菜应答干旱胁迫差异蛋白的功能分析第55-57页
        4.3.3 甘蓝型油菜干旱应答蛋白表达丰度聚类及基因表达分析第57-59页
        4.3.4 甘蓝型油菜干旱应答蛋白参与的代谢途径第59页
    4.4 讨论第59-69页
        4.4.1 光合作用和能量代谢受到影响第59-61页
        4.4.2 甘蓝型油菜应答干旱胁迫的抗氧化机制第61-69页
5 甘蓝型油菜应答干旱胁迫的磷酸化蛋白组学研究第69-98页
    5.1 引言第69页
    5.2 材料与方法第69-71页
        5.2.1 实验材料种植与处理第69页
        5.2.2 甘蓝型油菜磷酸化蛋白的提取与定量第69-70页
        5.2.3 非胶内蛋白的酶解第70页
        5.2.4 磷酸肽的富集和纯化第70-71页
        5.2.5 磷酸肽的质谱鉴定和磷酸肽的定量第71页
        5.2.6 蛋白质功能分类、聚类分析和pathway分析第71页
    5.3 结果与分析第71-77页
        5.3.1 甘蓝型油菜响应干旱胁迫磷酸化蛋白及磷酸肽的差异分析第71-72页
        5.3.2 甘蓝型油菜应答干旱胁迫差异磷酸化蛋白的功能分析第72-74页
        5.3.3 甘蓝型油菜干旱胁迫响应磷酸化蛋白参与的代谢途径第74-75页
        5.3.4 整合差异表达蛋白及差异磷酸化蛋白数据分析第75-76页
        5.3.5 甘蓝型油菜应答干旱胁迫的调控机制第76-77页
    5.4 讨论第77-98页
        5.4.1 信号转导相关的磷酸化蛋白应答干旱胁迫第77-78页
        5.4.2 淀粉和蔗糖代谢相关的磷酸化蛋白参与油菜的耐旱反应第78-98页
6 βCA1的表达分析及功能验证第98-107页
    6.1 引言第98页
    6.2 材料与方法第98-99页
        6.2.1 干旱胁迫条件下甘蓝型油菜碳酸酐酶的酶活性测量第98页
        6.2.2 qRT-PCR分析第98-99页
        6.2.3 拟南芥苗期耐旱性分析第99页
        6.2.4 拟南芥植株离体叶片失水率的测量第99页
    6.3 结果与分析第99-105页
        6.3.1 干旱胁迫条件下甘蓝型油菜βCA1的表达分析第99-101页
        6.3.2 干旱胁迫下甘蓝型油菜碳酸酐酶活性分析第101-102页
        6.3.3 甘蓝型油菜中βCA1三维结构的预测和分析第102-103页
        6.3.4 甘蓝型油菜中βCA1序列的分离鉴定第103页
        6.3.5 拟南芥βCA1基因突变体的抗旱表型鉴定第103-104页
        6.3.6 拟南芥βCA1突变体植株离体叶片失水率的分析第104-105页
    6.4 讨论第105-107页
7 总结与展望第107-110页
参考文献第110-124页
附录I第124-134页
附录II第134-135页
致谢第135-137页

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