| 摘要 | 第8-11页 |
| ABSTRACT | 第11-14页 |
| 縮略词表 | 第15-16页 |
| 第一部分 文献综述 | 第16-44页 |
| 第一章 光合作用相关性状QTL分析研究进展 | 第17-26页 |
| 1 光合作用与作物产量 | 第17-19页 |
| 2 光合相关性状的QTL定位 | 第19-24页 |
| 2.1 气体交换参数 | 第19页 |
| 2.2 叶绿素含量 | 第19-20页 |
| 2.3 叶绿素荧光参数 | 第20-23页 |
| 2.4 耐光氧化性状 | 第23页 |
| 2.5 叶片性状 | 第23-24页 |
| 2.6 Rubisco含量及羧化活性 | 第24页 |
| 3 光合相关性状QTL定位存在的问题与展望 | 第24-26页 |
| 第二章 Rubisco活化酶研究进展 | 第26-38页 |
| 1 RCA的活性 | 第26-28页 |
| 1.1 活化Rubisco | 第26-27页 |
| 1.2 水解ATP | 第27页 |
| 1.3 RCA寡聚物和RCA活性的关系 | 第27-28页 |
| 2 RCA活性的调控 | 第28页 |
| 2.1 ADP/ATP比例对RCA活性的调控 | 第28页 |
| 2.2 硫氧还蛋白-f介导的氧化还原RCA活力调控 | 第28页 |
| 3 RCA的结构 | 第28-30页 |
| 3.1 RCA亚基构成 | 第28-29页 |
| 3.2 RCA属于AAA+蛋白家族 | 第29-30页 |
| 4 RCA的作用机制 | 第30-34页 |
| 4.1 参与调控ATP酶活性的关键氨基酸位点或区域及可能的作用机制 | 第30-31页 |
| 4.2 参与活化Rubisco的关键氨基酸位点或区域 | 第31-32页 |
| 4.3 RCA和Rubisco间的互作机制 | 第32-34页 |
| 5 高温条件下RCA对植物光合作用的影响及RCA的变化 | 第34-36页 |
| 5.1 RCA是高温条件下引起光合作用降低的主要因素 | 第34-35页 |
| 5.2 高温条件下RCA的变化 | 第35-36页 |
| 6 总结与展望 | 第36-38页 |
| 第三章 遗传基因组学及其研究应用 | 第38-44页 |
| 1 遗传基因组学的概念 | 第38-39页 |
| 2 遗传基因组学常用的eQTL作图方法 | 第39页 |
| 3 遗传基因组学的应用 | 第39-43页 |
| 3.1 阐明基因的顺式和反式调控变异 | 第39-40页 |
| 3.2 构建基因表达调控网络 | 第40-41页 |
| 3.3 发现调节基因表达的热点区 | 第41-42页 |
| 3.4 鉴定控制复杂性状的候选基因 | 第42-43页 |
| 4 存在问题与展望 | 第43-44页 |
| 第二部分 研究报告 | 第44-105页 |
| 本研究目的、意义及主要内容 | 第45-47页 |
| 1 本研究的目的意义 | 第45页 |
| 2 本研究的主要研究内容 | 第45-47页 |
| 2.1 大豆资源光合气体交换参数的遗传变异分析及种质鉴定 | 第45-46页 |
| 2.2 大豆光合相关性状的QTL分析 | 第46页 |
| 2.3 大Rubisco活化酶基因的克隆及eQTL分析 | 第46-47页 |
| 第四章 大豆资源光合气体交换参数的变异及重组自交系群体NJRIKY亲本光合性能的差异 | 第47-56页 |
| 1 材料与方法 | 第48-49页 |
| 1.1 试验材料 | 第48页 |
| 1.2 试验设计 | 第48页 |
| 1.3 性状测定 | 第48页 |
| 1.4 数据统计分析方法 | 第48-49页 |
| 2 结果分析 | 第49-54页 |
| 2.1 光合气体交换参数间的相关分析 | 第49-50页 |
| 2.2 供试品种(系)光合气体交换参数的遗传变异 | 第50-51页 |
| 2.3 高光合性能种质的筛选 | 第51-53页 |
| 2.4 科丰1号和南农1138-2光合性能比较 | 第53-54页 |
| 3 小结与讨论 | 第54-56页 |
| 第五章 大豆光合气体交换参数的QTL分析 | 第56-67页 |
| 1 材料与方法 | 第56-58页 |
| 1.1 试验材料与遗传连锁图 | 第56-57页 |
| 1.2 试验设计 | 第57页 |
| 1.3 气体交换参数测定 | 第57页 |
| 1.4 统计分析与QTL定位方法 | 第57-58页 |
| 2 结果与分析 | 第58-65页 |
| 2.1 光合气体交换参数的表型变异 | 第58页 |
| 2.2 光合气体交换参数间的相关 | 第58-61页 |
| 2.3 光合气体交换参数的QTL检测 | 第61-65页 |
| 3 讨论 | 第65-67页 |
| 第六章 大豆叶绿素荧光参数的QTL分析 | 第67-80页 |
| 1 材料与方法 | 第68-70页 |
| 1.1 试验材料与遗传连锁图 | 第68页 |
| 1.2 试验设计 | 第68-69页 |
| 1.3 性状测定 | 第69页 |
| 1.4 统计分析与QTL定位方法 | 第69-70页 |
| 2 结果与分析 | 第70-77页 |
| 2.1 叶绿素荧光参数的表型变异 | 第70页 |
| 2.2 叶绿素荧光淬灭参数、JIP-test参数及光合速率间的相关 | 第70-72页 |
| 2.3 叶绿素荧光参数的QTL检测 | 第72-77页 |
| 3 讨论 | 第77-80页 |
| 第七章 大豆Rubisco活化酶基因的克隆及eQTL分析 | 第80-105页 |
| 1 材料与方法 | 第81-86页 |
| 1.1 试验材料与田间试验条件 | 第81-82页 |
| 1.2 DNA提取 | 第82页 |
| 1.3 RNA提取与cDNA第一链合成 | 第82页 |
| 1.4 RCA基因的cDNA和基因组DNA克隆 | 第82-84页 |
| 1.5 PCR产物的序列分析 | 第84页 |
| 1.6 GmRCAα和GmRCAβ的原核表达 | 第84-85页 |
| 1.7 叶片蛋白提取 | 第85页 |
| 1.8 Western-blot分析 | 第85页 |
| 1.9 性状测定 | 第85-86页 |
| 1.10 QTL(eQTL)定位方法 | 第86页 |
| 2 结果与分析 | 第86-98页 |
| 2.1 大豆NJRIKY群体总RNA提取及cDNA合成 | 第86-87页 |
| 2.2 GmRCAα和GmRCAβ的cDNA | 第87-90页 |
| 2.3 GmRCAα和GmRCAβ的基因组DNA分析 | 第90-91页 |
| 2.4 大豆叶片RCA及GmRCAα和GmRCAβ重组蛋白的Western-blot分析 | 第91-93页 |
| 2.5 其它三个大豆RCA候选基因的序列分析 | 第93-94页 |
| 2.6 RCA基因表达量、光合相关性状及籽粒产量间的相关 | 第94-95页 |
| 2.7 QTL(eQTL)分析 | 第95-98页 |
| 3 讨论 | 第98-105页 |
| 3.1 GmRCAα和GmRCAβ的mRNA来源于染色体上不同基因的转录产物 | 第98-99页 |
| 3.2 RCA基因的表达水平可调节植株的光合作用和生长 | 第99-101页 |
| 3.3 eQTL定位可为调控RCA基因表达提供新的思路 | 第101-102页 |
| 3.4 大豆RCA基因的非选择性剪切、多拷贝形式和表达模式分化与其基因组多倍化有关 | 第102-105页 |
| 全文结论 | 第105-107页 |
| 本研究的主要创新之处 | 第107-109页 |
| 参考文献 | 第109-129页 |
| 附录 | 第129-139页 |
| 攻读博士期间发表及待发表的论文 | 第139-141页 |
| 致谢 | 第141页 |
