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刺槐中参与共生固氮的结瘤相关基因的分离鉴定和功能分析

摘要第5-8页
ABSTRACT第8-11页
第一章 文献综述第15-33页
    1.1 生物固氮第15页
    1.2 豆科植物与根瘤菌共生固氮第15-23页
        1.2.1 豆科植物根瘤的形成过程第16-17页
        1.2.2 根瘤的类型-定型瘤和不定型瘤第17-18页
        1.2.3 豆科植物结瘤分子机制第18-23页
    1.3 转录水平上的差异表达基因分离方法第23-27页
        1.3.1 cDNA-AFLP技术第23-24页
        1.3.2 cDNA微阵列和DNA微阵列第24页
        1.3.3 转录组测序第24页
        1.3.4 抑制差减杂交(Suppressive Subtractive Hybridization, SSH第24-27页
    1.4 RNA干扰第27-30页
        1.4.1 RNAi的发现及机理第27-29页
        1.4.2 RNAi在植物基因功能研究中应用第29-30页
        1.4.3 豆科植物RNAi的研究现状第30页
    1.5 本研究的目的意义及技术路线第30-33页
        1.5.1 目的意义第30-31页
        1.5.2 技术路线第31-33页
第二章 中慢生根瘤菌的eGFP标记及其侵染观察第33-41页
    2.1 引言第33页
    2.2 材料、试剂和仪器第33-34页
        2.2.1 材料第33页
        2.2.2 试剂第33页
        2.2.3 仪器第33-34页
    2.3 实验方法第34-37页
        2.3.1 pMP2444 质粒的提取与检测第34页
        2.3.2 M.amorphae CCNWGS0123 感受态细胞的制备与转化第34-35页
        2.3.3 转化子的检测第35-36页
        2.3.4 刺槐的种植与根瘤菌的侵染观察第36-37页
    2.4 结果与分析第37-40页
        2.4.1 质粒提取结果分析第37页
        2.4.2 转化子的检测第37-38页
        2.4.3 eGFP基因的扩增与检测第38页
        2.4.4 侵染过程观察与分析第38-40页
    2.5 讨论第40-41页
第三章 刺槐结瘤相关基因SSH文库的构建及质量检测第41-56页
    3.1 引言第41页
    3.2 材料、试剂和仪器第41-42页
        3.2.1 材料第41页
        3.2.2 试剂第41-42页
        3.2.3 仪器第42页
    3.3 实验方法第42-51页
        3.3.1 植物材料与根瘤菌培养第42页
        3.3.2 RNA提取及去除基因组DNA第42-43页
        3.3.3 植物基因组DNA提取第43页
        3.3.4 mRNA分离纯化第43-44页
        3.3.5 抑制差减杂交第44-49页
        3.3.6 差减cDNA文库的构建第49-50页
        3.3.7 差示筛选第50-51页
    3.4 结果与分析第51-55页
        3.4.1 刺槐根部提取的总RNA质量检测第51-52页
        3.4.2 抑制差减杂交结果分析第52-53页
        3.4.3 差减cDNA文库的构建第53-54页
        3.4.4 斑点杂交的结果第54-55页
    3.5 讨论第55-56页
第四章 刺槐结瘤相关基因克隆及表达谱分析第56-76页
    4.1 引言第56-57页
    4.2 材料、试剂和仪器第57页
        4.2.1 材料第57页
        4.2.2 试剂第57页
        4.2.3 仪器第57页
    4.3 实验方法第57-63页
        4.3.1 测序及序列的生物信息学分析第57-58页
        4.3.2 候选基因半定量RT-PCR分析第58-59页
        4.3.3 候选基因荧光定量RT-PCR分析第59-61页
        4.3.4 候选基因的cDNA末端快速扩增(RACE)第61-63页
        4.3.5 序列分析第63页
    4.4 结果与分析第63-72页
        4.4.1 序列测定及提交第63页
        4.4.2 正反交文库中ESTs的比对和功能分类第63-65页
        4.4.3 候选基因的时空表达分析第65-69页
        4.4.4 RACE产物的克隆测序及目的基因全长cDNA的获取第69-72页
    4.5 讨论第72-76页
        4.5.1 参与转录调节的候选基因第72-74页
        4.5.2 参与到翻译后修饰的候选基因第74-75页
        4.5.3 候选的参与信号通路的膜蛋白基因第75-76页
第五章 五个晚期结瘤素基因的鉴定及功能验证第76-96页
    5.1 引言第76页
    5.2 材料、试剂和仪器第76-77页
        5.2.1 材料第76页
        5.2.2 试剂第76-77页
        5.2.3 仪器第77页
    5.3 实验方法第77-81页
        5.3.1 五个候选晚期结瘤素基因第77页
        5.3.2 刺槐发根农杆菌转化体系建立第77-81页
    5.4 结果与分析第81-95页
        5.4.1 候选基因的时空表达及分析第81-86页
        5.4.2 RNA干扰载体的构建第86-88页
        5.4.3 RNA干扰效果鉴定第88-95页
    5.5 讨论第95-96页
第六章 结论与创新第96-100页
    6.1 结论第96-98页
        6.1.1 记录刺槐结瘤过程第96页
        6.1.2 差减cDNA文库的构建第96页
        6.1.3 刺槐结瘤相关ESTs生物信息学分析与qRT-PCR验证第96-97页
        6.1.4 五个结瘤特异性基因的鉴定及功能验证第97-98页
    6.2 创新点第98-100页
参考文献第100-115页
附录第115-134页
缩略词第134-135页
致谢第135-136页
个人简介第136页

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