摘要 | 第4-6页 |
ABSTRACT | 第6-7页 |
第一章 绪论 | 第10-15页 |
1.1 DNA序列中k-mer的研究进展 | 第10-11页 |
1.1.1 DNA序列中k-mer的研究 | 第10-11页 |
1.1.2 DNA序列中k-mer分布图谱 | 第11页 |
1.2 CpG岛序列 | 第11-13页 |
1.2.1 CpG岛的研究现状 | 第11-12页 |
1.2.2 CGIs的序列特征 | 第12-13页 |
1.3 课题研究背景 | 第13页 |
1.4 论文结构安排 | 第13-15页 |
第二章 数据信息与研究方法 | 第15-20页 |
2.1 数据库 | 第15-17页 |
2.1.1 人类基因组DNA序列 | 第15页 |
2.1.2 CpG岛序列 | 第15-17页 |
2.2 研究方法 | 第17-20页 |
2.2.1 DNA序列中的8-mer频次 | 第17页 |
2.2.2 8-mer按照二核苷酸含量分类 | 第17-18页 |
2.2.3 8-mer中m核苷酸的相对频数 | 第18-19页 |
2.2.4 8-mer特征量K_(tri) | 第19-20页 |
第三章 人类基因组上8-mer频数分布特征 | 第20-24页 |
3.1 人类基因组上的8-mer频数分布 | 第20-21页 |
3.2 按照二核苷酸分类后的8-mer频数分布 | 第21-22页 |
3.3 三峰分布与进化的关系 | 第22-24页 |
第四章 CG_2模体子集与CpG岛序列的相关性 | 第24-35页 |
4.1 提取作为研究的序列 | 第24-26页 |
4.2 CpG岛和非CpG岛序列的K_(tri)值 | 第26-30页 |
4.3 以二核苷酸CG分类的K_(tri)分布 | 第30-31页 |
4.4 以16种二核苷分类的K_(tri)值分布比较 | 第31-35页 |
第五章 CpG岛序列结构分析 | 第35-44页 |
5.1 CpG岛序列上C+G含量分布 | 第35-38页 |
5.2 CpG岛中K_(tri)的分布 | 第38-40页 |
5.3 CpG岛序列中CG_2所对应的K_(tri)分布以及局域结构的分布特征 | 第40-44页 |
5.3.1 标准化后的CG_2所对应的K_(tri)分布 | 第40-42页 |
5.3.2 CG_2对应的K_(tri)形成的局域结构所对应的序列长度分布 | 第42-44页 |
第六章 总结和展望 | 第44-46页 |
6.1 总结 | 第44页 |
6.2 展望 | 第44-46页 |
参考文献 | 第46-51页 |
附录 | 第51-77页 |
致谢 | 第77页 |