| 符号说明 | 第5-8页 |
| 中文摘要 | 第8-10页 |
| ABSTRACT | 第10-11页 |
| 1 引言 | 第12-27页 |
| 1.1 家养动物微进化研究进展 | 第12-19页 |
| 1.1.1 微进化的概念 | 第12页 |
| 1.1.2 微进化的研究方法 | 第12-13页 |
| 1.1.3 不同家养动物微进化研究 | 第13-17页 |
| 1.1.4 绵羊起源与进化研究进展 | 第17-19页 |
| 1.2 中国短脂尾绵羊的起源与进化 | 第19-23页 |
| 1.2.1 蒙古羊的起源、进化与分布 | 第19-21页 |
| 1.2.2 短脂尾绵羊的遗传多样性 | 第21-22页 |
| 1.2.3 短脂尾绵羊各品种之间的差异 | 第22-23页 |
| 1.3 绵羊繁殖相关基因的研究进展 | 第23-27页 |
| 1.3.1 绵羊季节性繁殖相关基因的研究进展 | 第23-25页 |
| 1.3.2 绵羊多胎性状相关基因的研究进展 | 第25-27页 |
| 1.4 本研究的目的意义 | 第27页 |
| 2 材料与方法 | 第27-33页 |
| 2.1 试验材料 | 第27-28页 |
| 2.1.1 试验动物及样品采集 | 第27-28页 |
| 2.1.2 主要数据库及生物分析软件 | 第28页 |
| 2.2 试验方法 | 第28-30页 |
| 2.2.1 基因组DNA的提取与检测 | 第28-29页 |
| 2.2.2 绵羊基因组文库的构建及高通量测序 | 第29-30页 |
| 2.2.3 SNP准确性验证 | 第30页 |
| 2.3 数据分析 | 第30-33页 |
| 2.3.1 测序数据与参考基因组比对 | 第31-32页 |
| 2.3.2 变异检测与注释 | 第32页 |
| 2.3.3 选择进化分析 | 第32-33页 |
| 2.3.4 基因功能注释 | 第33页 |
| 3 结果与分析 | 第33-57页 |
| 3.1 DNA提取质量检测 | 第33-34页 |
| 3.2 高通量测序数据的生物信息学分析结果 | 第34-57页 |
| 3.2.1 数据产出概述 | 第34-35页 |
| 3.2.2 测序数据比对结果与测序深度分布 | 第35-36页 |
| 3.2.3 变异检测与注释 | 第36-39页 |
| 3.2.4 利用同义/非同义SNP预测进化基因 | 第39-41页 |
| 3.2.5 选择进化分析 | 第41-52页 |
| 3.2.6 选择进化基因的功能注释 | 第52-54页 |
| 3.2.7 繁殖相关基因的研究 | 第54-56页 |
| 3.2.8 SNP准确性验证 | 第56-57页 |
| 4 讨论 | 第57-60页 |
| 4.1 选择信号的检测 | 第57页 |
| 4.2 X染色体变异分布 | 第57-58页 |
| 4.3 选择进化区域与先前研究的比较 | 第58-59页 |
| 4.4 两种方法检测到的进化基因功能一致 | 第59页 |
| 4.5 绵羊繁殖相关QTL在中国短脂尾绵羊微进化中的作用 | 第59-60页 |
| 5 结论 | 第60-61页 |
| 参考文献 | 第61-72页 |
| 附录 | 第72-124页 |
| 致谢 | 第124-125页 |
| 攻读学位期间发表论文情况 | 第125页 |