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Sorangium cellulosum So0157-2木聚糖酶Xyn11B中特殊序列对其功能的影响

摘要第9-12页
Abstract第12-14页
符号说明及缩略词第15-16页
第一章 文献综述第16-30页
    1.1 粘细菌和纤维堆囊菌简介第16页
    1.2 木聚糖酶的组成及结构第16-19页
        1.2.1 半纤维素及木聚糖简介第16-17页
        1.2.2 木聚糖酶的分类第17页
        1.2.3 GH11家族木聚糖酶及其特点第17-18页
        1.2.4 木聚糖酶在生产中的应用研究第18-19页
    1.3 聚丝氨酸连接区(PSL)简介第19-22页
        1.3.1 不同微生物群体中PSL的分布及特征第19-21页
            1.3.1.1 Microbulbifer degradans中的PSL第19-20页
            1.3.1.2 Teredinibacter turnerae T7901中的PSL第20页
            1.3.1.3 Microbulbifer degradans 2-40中的PSL第20-21页
            1.3.1.4 其他生物的中的PSL第21页
        1.3.2 PSL区的功能研究第21-22页
    1.4 耐热酶及应用前景的概述第22-26页
        1.4.1 影响蛋白质热稳定性的因素第23-25页
            1.4.1.1 疏水相互作用第23页
            1.4.1.2 氢键第23-24页
            1.4.1.3 离子键第24页
            1.4.1.4 芳香环相互作用第24页
            1.4.1.5 二硫键第24-25页
        1.4.2 木聚糖酶的耐热性改造——N-末端氨基酸的替代第25-26页
    1.5 外切型木聚糖酶和内切型木聚糖酶概述第26-27页
        1.5.1 糖苷水解酶中的内切和外切酶第26页
        1.5.2 木聚糖中的外切和内切酶简述第26-27页
    1.6 本论文工作展开思路及研究内容第27-30页
第二章 Xyn11B聚丝氨酸区截短突变体的纯化和酶学性质研究第30-58页
    2.1 实验材料第31-34页
        2.1.1 使用的菌株和质粒第31-32页
        2.1.2 培养基的配置第32页
        2.1.3 常用试剂第32-33页
            2.1.3.1 溶液配置第32-33页
        2.1.4 实验所使用的主要仪器设备第33-34页
    2.2 实验方法第34-43页
        2.2.1 Xyn11B PSL位置的选择第34页
        2.2.2 表达载体的构建第34-39页
        2.2.3 目的蛋白的表达及纯化第39-41页
            2.2.3.1 目的蛋白的表达第39页
            2.2.3.2 目的蛋白的纯化第39-41页
        2.2.4 PSL截短体酶学性质的测定第41-43页
            2.2.4.1 截短体蛋白的浓度测定第41页
            2.2.4.2 最适温度的测定第41页
            2.2.4.3 温度耐受性的测定第41-42页
            2.2.4.4 最适pH的测定第42页
            2.2.4.5 pH耐受性的测定第42页
            2.2.4.6 Km及Vmax的测定第42页
            2.2.4.7 酶解产物的TLC分析第42-43页
    2.3 实验结果与讨论第43-56页
        2.3.1 不同长度PSL的Xyn11B突变体的构建第43-44页
        2.3.2 目的蛋白的诱导表达第44-46页
        2.3.3 PSL截短体酶学性质的分析第46-56页
            2.3.3.1 蛋白标准曲线的绘制第46-47页
            2.3.3.2 木糖标准曲线的绘制第47页
            2.3.3.3 PSL截短突变体蛋白最适温度的测定第47-48页
            2.3.3.4 截短体蛋白温度耐受性的测定第48-50页
            2.3.3.5 最适pH的测定第50-52页
            2.3.3.6 pH耐受性的测定第52-53页
            2.3.3.7 Km及Vmax的测定第53-55页
            2.3.3.8 酶解产物的TLC分析第55-56页
    2.4 本章小结第56-58页
第三章 Xyn11B催化域N-端序列影响热稳定性的机理研究第58-82页
    3.1 生物信息学预测Xyn11B的三级结构第59页
    3.2 实验材料第59-60页
        3.2.1 菌株及质粒第59页
        3.2.2 主要实验试剂第59-60页
            3.2.2.1 主要溶液第59-60页
            3.2.2.2 常用试剂盒、工具酶及试剂第60页
            3.2.2.3 主要仪器设备第60页
    3.3 实验方法第60-63页
        3.3.1 表达载体的构建第60-62页
        3.3.2 包涵体目的蛋白诱导表达及纯化第62-63页
        3.3.3 变性包涵体蛋白的复性第63页
    3.4 结果与讨论第63-80页
        3.4.1 D111与T131高温处理之后的产物分析第63-64页
        3.4.2 Y123的构建、纯化及最适温度的测定第64-67页
            3.4.2.1 Y123位置的选择和表达载体的构建第64-65页
            3.4.2.2 Y123蛋白的纯化及最适温度的测定第65-67页
        3.4.3 Xyn11B-S突变体的构建、纯化及最适温度的测定第67-69页
            3.4.3.1 Xyn11B-S突变体的构建第68页
            3.4.3.2 Xyn11B-S蛋白的纯化及最适温度的测定第68-69页
        3.4.4 Y126A/Y130A和Y130A的构建、纯化及最适温度的测定第69-72页
            3.4.4.1 Y126A/Y130A和Y130A突变体的构建第70-71页
            3.4.4.2 Y126A/Y130A和Y130A蛋白的纯化及最适温度测定第71-72页
        3.4.5 W346A突变体构建、纯化及最适温度测定第72-74页
            3.4.5.1 W346A突变体构建第72-73页
            3.4.5.2 W346A蛋白纯化及最适温度测定第73-74页
        3.4.6 截短体高温处理后的酶活测定及产物分析第74-75页
            3.4.6.1 截短体的热稳定性检测第74-75页
        3.4.7 耐热改造突变体的构建、纯化和最适温度的测定第75-80页
            3.4.7.1 耐热改造突变体的构建第76页
            3.4.7.2 耐热改造突变体蛋白的纯化及最适温度的测定第76-80页
    3.5 本章小结第80-82页
第四章 Xyn11B催化域中插入序列loop2对酶解产物谱的影响第82-90页
    4.1 实验材料第82-83页
        4.1.1 菌株及质粒第82-83页
        4.1.2 培养基第83页
        4.1.3 主要试剂第83页
        4.1.4 主要仪器设备第83页
    4.2 实验方法第83-86页
        4.2.1 表达载体的构建第83-86页
            4.2.1.1 引物设计及合成第83-84页
            4.2.1.2 目的片段的PCR扩增第84-85页
            4.2.1.3 PCR产物的切胶回收第85页
            4.2.1.4 质粒酶切及片段的胶回收第85页
            4.2.1.5 载体片段与基因片段的连接第85-86页
            4.2.1.6 重组表达载体的筛选第86页
        4.2.2 目的蛋白的表达及纯化第86页
            4.2.2.1 表达菌株的构建第86页
            4.2.2.2 目的蛋白纯化第86页
            4.2.2.3 酶解产物的TLC分析第86页
    4.3 实验结果与讨论第86-89页
        4.3.1 表达载体的构建第86-87页
        4.3.2 目的蛋白的诱导表达第87-88页
        4.3.3 Xyn11B-S2降解桦木木聚糖的产物图谱第88-89页
    4.4 本章小结第89-90页
总结与展望第90-92页
附录第92-96页
参考文献第96-104页
致谢第104-105页
学位论文评阅及答辩情况表第105页

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