| 摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-11页 |
| 第1章 计算机辅助药物设计的基本原理与方法 | 第11-24页 |
| ·基于配体的药物设计 | 第13-15页 |
| ·药效团方法 | 第13-15页 |
| ·定量构效关系(QSAR) | 第15页 |
| ·基于受体的药物设计 | 第15-23页 |
| ·同源模建 | 第16-18页 |
| ·分子对接 | 第18-23页 |
| ·全新药物设计 | 第23页 |
| ·论文整体安排 | 第23-24页 |
| 第2章 肝素酶的结构和功能关系研究 | 第24-38页 |
| ·引言 | 第24-26页 |
| ·肝素酶Ⅱ中钙离子的作用是什么? | 第25页 |
| ·肝素酶Ⅲ能否裂解肝素? | 第25-26页 |
| ·肝素酶Ⅱ中钙离子结合位点的研究 | 第26-32页 |
| ·钙离子结合位点的确定 | 第26页 |
| ·肝素及硫酸乙酰肝素的分子对接 | 第26页 |
| ·生物实验方法 | 第26页 |
| ·重组肝素酶Ⅲ的表达和纯化结果 | 第26-27页 |
| ·二价金属离子对酶活性的影响 | 第27页 |
| ·对预测的7个钙离子结合位点的分析 | 第27-29页 |
| ·_(307)DVDY_(310)是钙离子结合位点的一部分 | 第29-31页 |
| ·不同金属离子时的不同裂解机理 | 第31-32页 |
| ·小结与展望 | 第32页 |
| ·肝素酶Ⅲ的同源模建和分子对接 | 第32-37页 |
| ·序列比对和同源模建、优化与验证 | 第32页 |
| ·分子对接过程 | 第32页 |
| ·生物实验方法 | 第32-33页 |
| ·同源模建的结果 | 第33-34页 |
| ·分子对接结果 | 第34-36页 |
| ·生物实验的结果 | 第36-37页 |
| ·小结与展望 | 第37页 |
| ·本章小结 | 第37-38页 |
| 第3章 组蛋白去乙酰化酶的结构和功能研究 | 第38-56页 |
| ·引言 | 第38-42页 |
| ·沉默信息调整蛋白的结构和功能研究 | 第42-51页 |
| ·同源模建和分子对接 | 第42页 |
| ·生物实验方法 | 第42-43页 |
| ·结合了P53小肽和NAD~+的SIRT1的结构特点 | 第43-45页 |
| ·SER265和ASP348之间的极性相互作用 | 第45-46页 |
| ·ASN346与NAD~+有相互作用但与P53无作用 | 第46-47页 |
| ·SER275位于NAD~+结合口袋的入口处 | 第47页 |
| ·烟酰胺结合于SIRT1的C口袋处 | 第47-51页 |
| ·小结与展望 | 第51页 |
| ·组蛋白去乙酰化酶Ⅰ的一类活性分子的特点 | 第51-55页 |
| ·4氢-γ-咔啉异羟肟酸衍生物的化学合成和生物测试 | 第51-52页 |
| ·用于对接的分子准备和分子对接 | 第52-53页 |
| ·生物活性测试结果 | 第53页 |
| ·分子对接结果 | 第53-55页 |
| ·小结与展望 | 第55页 |
| ·本章小结 | 第55-56页 |
| 第4章 全文总结 | 第56-57页 |
| 参考文献 | 第57-69页 |
| 攻读硕士学位期间撰写的论文 | 第69-71页 |
| 致谢 | 第71页 |
