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基于DNA适体的生物传感信号增强方法的设计与应用

ABSTRACT第1-10页
ACKNOWLEDGEMENTS第10-14页
LIST OF FIGURES AND SCHEMES第14-21页
LIST OF TABLES第21-22页
ABBREVIATIONS第22-24页
Chapter 1 General Introduction第24-48页
   ·Recognition Elements in Biosensing第26-29页
     ·Non-DNA-based Recognition Elements第26-27页
     ·DNA-based Recognition Elements第27-29页
   ·Reporting Strategies in Aptamer-based Biosensing第29-40页
     ·Colorimetric Strategies第30-35页
     ·Fluorescence Strategies第35-39页
     ·Electrochemical and Other Strategies第39-40页
   ·Signal Enhancement Strategies in Aptamer-based Biosensing第40-46页
     ·Catalytic Nucleic Acid (DNAzyme)-based Amplification第40-41页
     ·Nanoparticles-based Amplification第41-42页
     ·Enzyme-Assisted Target or DNA Strands Recycling第42-44页
     ·Rolling-Cycle Amplification (RCA)第44-45页
     ·Enzyme-Free Amplification Strategies第45-46页
   ·Objectives of This Thesis第46-48页
Chapter 2 Detection of Pb~(2+) using Unmodified AuNPs as SignalEnhancement and Transduction Element第48-62页
   ·Introduction第50-51页
   ·Experimental section第51-52页
     ·Materials and Apparatus第51页
     ·Synthesis of AuNPs第51-52页
     ·CD Measurements第52页
     ·Detection of Pb~(2+)第52页
   ·Results and Discussion第52-61页
     ·The principle of the Sensing System第52-53页
     ·Characterization of the G-quadruplex Formation using CD and Absorption Difference Spectra第53-55页
     ·Characterization of AuNPs第55-56页
     ·Optimization of the Sensing System第56-58页
     ·Performance of the Two Sensing System, TBA and PW17第58-61页
   ·Conclusion第61-62页
Chapter 3 The Unfolding of G-quadruplexes in the Presence of AuNPs第62-80页
   ·Introduction第64-65页
   ·Experimental Section第65-67页
     ·Materials and Apparatus第65-66页
     ·CD Measurements第66页
     ·Adsorption Kinetics of Random Coiled ssDNAs and G-quadruplexes onto AuNPs第66-67页
     ·Preparation of Samples for ICP-AES第67页
     ·Non-denaturing Polyacrylamide Gel Electrophoresis第67页
   ·Results and Discussion第67-77页
     ·The Study on the Interaction between G-quadruplexes and AuNPs第68-77页
     ·Effect of the Potential Unfolding of G-quadruplex to Sensing System第77页
   ·Conclusion第77-80页
Chapter 4 Double-Functionalized Gold Nanoparticles with SplitAptamer for the Detection of Adenosine Triphosphate第80-92页
   ·Introduction第82-83页
   ·Experimental Section第83-85页
     ·Materials and Apparatus第83-84页
     ·Preparation of AuNPs-DNA Conjugates第84-85页
     ·ATP Response第85页
   ·Results and Discussion第85-91页
     ·Design and Working Principle of the Double-Functionalized AuNP-DNA Sensing System第85-87页
     ·Effect of Mg~(2+) Concentrations and Aptamer Fragments Densities第87-89页
     ·Sensitivity and Selectivity第89-91页
   ·Conclusion第91-92页
Chapter 5 A Strand Displacement Reaction Cycle Catalyzed by ATP Aptamer and Its application in the Detection of ATP第92-106页
   ·Introduction第94-95页
   ·Experimental Section第95-98页
     ·Materials and Apparatus第95-96页
     ·Non-denaturing Polyacrylamide Gel Electrophoresis第96-97页
     ·Demonstration of the Catalytic SDR Cycle with Labeled Oligonucleotides第97页
     ·ATP Detection第97-98页
   ·Results and Discussion第98-104页
     ·Sequence design of the catalytic SDR cycle第98页
     ·Demonstration of the catalytic SDR cycle第98-101页
     ·Optimization of the Biosensing System第101-102页
     ·Sensitivity and Selectivity第102-104页
   ·Conclusion第104-106页
Chapter 6 A Target Triggered Strand Displacement Reaction Cycle:theDesign and Application in ATP Sensing第106-120页
   ·Introduction第108-109页
   ·Experimentl Section第109-112页
     ·Materials and Apparatus第109-110页
     ·Non-denaturing PAGE第110-111页
     ·Demonstration of the catalytic SDR cycle with labeled oligonucleotides第111页
     ·ATP Detection第111-112页
   ·Results and Discussion第112-119页
     ·Sequence Design of the Target Triggered Cycle第112页
     ·Demonstration of the Catalytic SDR Cycle第112-116页
     ·Effect of Mg~(2+) Concentration on the Sensing System第116-117页
     ·Sensitivity and Selectivity第117-119页
   ·Conclusion第119-120页
Chapter 7 Conclusion and Future work第120-124页
Chapter 8 References第124-146页
APPENDIX Ⅰ. ARTICLES第146-148页
APPENDIX Ⅱ. Simplified Version of This Thesis in Chinese第148-164页

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