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牦牛钙激活蛋白酶(CAPN1)基因多态性与肉质性状的相关性研究

摘要第1-6页
SUMMARY第6-11页
第一章 文献综述第11-25页
 第一节 钙激活蛋白酶的研究进展第11-17页
  1 钙激活蛋白酶的命名与分类第11-12页
  2 钙激活蛋白酶的结构及其在肉类嫩化中的作用机理第12-15页
   ·钙激活蛋白酶的结构第12-14页
   ·钙激活蛋白酶在肉类嫩化中的作用机理第14-15页
  3 钙激活蛋白酶的活性调节第15-17页
   ·Ca~(2+)对Calpain的调节作用第15页
   ·Calpain的自溶作用第15页
   ·磷酸化作用第15-16页
   ·磷脂结合第16页
   ·避开内源抑制剂的作用第16页
   ·其它影响因素第16-17页
 第二节 CAPN1基因及其与肉质性状的相关性研究进展第17-18页
  1 CAPN1基因的结构和定位第17页
  2 CAPN1基因多态性与肉质性状的相关性研究第17-18页
 第三节 SNPS分子标记及其应用第18-23页
  1 SNPs简述和特点第19-20页
  2 SNPs检测方法第20-21页
   ·以酶或PCR为基础的方法第20页
   ·以构象为基础的方法第20页
   ·以杂交为基础的方法第20页
   ·直接测序法第20-21页
  3 聚合酶链式反应-单链构象多态性(PCR-SSCP)第21-22页
  4 SNPs在家畜遗传育种中的应用第22-23页
   ·在家畜遗传图谱构建中的应用第22页
   ·在家畜基因组研究与基因定位的应用第22页
   ·群体遗传学和生物进化第22-23页
 第四节 本项目研究的目的和意义第23-25页
第二章 材料和方法第25-35页
 第一节 肉质性状测定第25-27页
  1 实验材料第25页
   ·样品采集第25页
   ·实验仪器设备第25页
   ·实验指标测定第25页
  2 实验方法第25-27页
   ·蒸煮损失和剪切力的测定第26页
   ·失水率的测定第26页
   ·熟肉损失的测定第26页
   ·pH值测定方法第26-27页
   ·水分含量、脂肪含量和蛋白含量的测定第27页
 第二节 CAPN1基因多态性检测第27-35页
  1 实验材料第27-28页
   ·样品采集第27页
   ·实验药品第27页
   ·主要仪器设备第27-28页
   ·主要软件第28页
  2 实验方法第28-33页
   ·主要溶液及试剂配制第28-29页
   ·牦牛基因组DNA的提取第29-30页
   ·引物设计及PCR扩增第30-31页
   ·聚合酶链式反应-单链构象多态性(PCR-SSCP)第31-32页
   ·PCR产物回收纯化第32-33页
  3 数据统计分析方法第33-35页
   ·基因频率和基因型频率第33页
   ·遗传纯合度(Ho)、杂合度(He)和有效等位基因数(Ne)第33-34页
   ·多态信息含量(PolymorphismInformation content,PIC)第34页
   ·统计分析模型第34-35页
第三章 结果与分析第35-52页
 第一节 牦牛CAPN1基因SNPS检测结果第35-40页
  1 DNA提取检测结果第35页
  2 PCR扩增结果第35-36页
  3 SSCP检测及测序结果第36-39页
  4 CAPN1基因四个SNPs位点遗传特性分析第39-40页
 第二节 牦牛CAPN1基因SNPs与肉质性状的相关性分析第40-52页
  1 CAPN1基因3F位点多态性与肉质性状的相关性分析第40-44页
   ·3F位点不同基因型对蒸煮损失的影响第41页
   ·3F位点不同基因型对失水率的影响第41-42页
   ·3F位点不同基因型对pH值的影响第42-44页
   ·3F位点不同基因型对粗脂肪含量的影响第44页
  2 CAPN1基因4F位点多态性与肉质性状的相关性分析第44-46页
   ·4F位点不同基因型对熟肉损失的影响第45页
   ·4F位点不同基因型对失水率的影响第45页
   ·4F位点不同基因型对蛋白质和粗脂肪含量的影响第45-46页
  3 CAPN1基因5F位点多态性与肉质性状的相关性分析第46-50页
   ·5F位点不同基因型对剪切力的影响第47-49页
   ·5F位点不同基因型对pH值的影响第49页
   ·5F位点不同基因型对粗脂肪含量的影响第49-50页
  4 CAPN1基因6F位点多态性与肉质性状的相关性分析第50-52页
   ·6F位点不同基因型对剪切力的影响第50-51页
   ·6F位点不同基因型对熟肉损失的影响第51页
   ·6F位点不同基因型对蛋白质含量的影响第51-52页
第四章 分析与讨论第52-61页
 1 牦牛基因组DNA的提取第52页
 2 影响PCR-SSCP的因素第52-55页
   ·PCR扩增第52-53页
   ·聚丙烯酰胺凝胶浓度和交联度第53-54页
   ·电泳条件第54页
   ·染色方法第54页
   ·SSCP的带型判定第54-55页
 3 牦牛CAPN1基因多态性分析第55-56页
   ·CAPN1基因的多态性检测第55-56页
   ·CAPN1基因的遗传特征分析第56页
 4 CAPN1基因多态性与牦牛肉质性状的相关性第56-61页
   ·SNPs位点与剪切力的关系第57-58页
   ·SNPs位点与系水力WHC(water holding capacity)的关系第58-59页
   ·SNPs位点与肌肉pH值的关系第59页
   ·SNPs位点与营养成分的关系第59-61页
第五章 结论第61-62页
参考文献第62-68页
致谢第68-69页
个人简介第69-70页
导师简介第70-73页

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