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大肠杆菌辐射损伤适应性机制及耐辐射球菌γ-射线诱导蛋白质组研究

致谢第1-7页
摘要第7-9页
ABSTRACT第9-15页
第一章 文献综述第15-44页
 第一节 极端微生物(EXTREMOPHILES)研究进展第15-32页
   ·极端微生物研究背景第15-17页
   ·嗜酸微生物(ACIDOPHILIC MICROORGANISMS)第17-18页
   ·嗜热微生物(THERMOPHILIC MICROORGANISMS)第18-20页
   ·深海嗜压微生物(BAROPHILIC MICROORGANISMS)第20-22页
   ·嗜冷微生物(PSYCHROPHILE MICROORGANISMS)第22-24页
   ·嗜盐微生物(HALOPHILIC MICROORGANISMS)第24-25页
   ·嗜碱微生物(ALKALIPHILIC MICROORGANISMS)第25-27页
   ·辐射抗性微生物(RADIATION RESISTANT MICROORGANISMS)第27-30页
   ·极端微生物研究进展总结第30-32页
 第二节 极端微生物辐射抗性起源假说第32-37页
   ·火星来客说(THE ACCIDENTAL SPACE TOURIST)第33-34页
   ·协同进化说(FORTUITOUS INCIDENTAL EVOLUTION)第34页
   ·适应进化说(ADAPTIVE CONVERTED EVOLUTION)第34-36页
   ·小结与展望第36-37页
 参考文献第37-44页
第二章 辐射抗性菌株实验性进化筛选第44-55页
 1 引言第44-46页
 2 材料与方法第46-49页
   ·菌株与培养方法第46页
   ·原始菌株与辐照条件第46-47页
   ·反复辐照与快速辐照抗性鉴定第47-48页
   ·辐照抗性菌株筛选第48-49页
   ·抗性生存率的测定第49页
 3 结果与分析第49-52页
   ·辐射抗性的提高第50页
   ·生长速率的测定第50页
   ·辐射条件下的生存率第50-51页
   ·UV压力下的生存率第51-52页
   ·MITOMYCIN C处理下的生存率第52页
 4 小结与讨论第52-53页
 参考文献第53-55页
第三章 辐射抗性菌株基因组测序比较分析第55-88页
 1 引言第55-58页
   ·第一代测序技术(SANGER测序技术)第55-56页
   ·第二代测序技术(SEQUENCING BY SYNTHESIS)第56-58页
 2 材料与方法第58-67页
   ·仪器与试剂第58-59页
   ·DNA提取第59页
   ·DNA的随机断裂与回收第59页
   ·DNA片段的末端修复第59-60页
   ·3'末端接头的连接第60-61页
   ·DNA片段的PCR扩增第61-62页
   ·SBS基因组测序(SBS-SEQUENCING BY SYNTHESIS)第62页
   ·图像处理和数据拼接第62页
   ·序列比对第62-67页
 3 结果与分析第67-81页
   ·基因组染色体DNA比较的结果第67-69页
   ·SNP分析结果第69-75页
   ·DNA修复相关基因序列分析结果第75-81页
 4 小结与讨论第81-84页
 参考文献第84-88页
第四章 辐射抗性菌株差异蛋白质组分析第88-107页
 1 引言第88-92页
 2 材料与方法第92-98页
   ·仪器与试剂第92页
   ·样品制备试剂配置第92-93页
   ·细胞辐照处理与样品收集第93页
   ·细胞样品蛋白的提取与定量第93-94页
   ·蛋白质的二维液相色谱分离第94-97页
   ·蛋白质组图谱的获取与图像分析第97页
   ·目标蛋白的酶切第97-98页
   ·质谱鉴定第98页
 3 结果与分析第98-104页
   ·二维液相色谱分离第98-100页
   ·蛋白表达水平差异比较第100-104页
 4 小结与讨论第104-105页
 参考文献第105-107页
第五章 辐射抗性菌株基因转录水平及蛋白质氧化损伤分析第107-120页
 1 引言第107-108页
 2 材料预防法与方法第108-113页
   ·RNA的制备与反转录第108-109页
   ·荧光实时定量PCR第109-112页
   ·细胞体内羰基含量测定第112-113页
 3 结果与分析第113-116页
   ·DNA修复相关基因转录水平的分析第113-115页
   ·蛋白质羰基含量的测定第115-116页
 4 小结与讨论第116-118页
 参考文献第118-120页
第六章 耐辐射球菌γ-射线诱导的蛋白质组分析第120-137页
 1 引言第120-121页
 2 材料与方法第121-127页
   ·试剂与仪器第121-122页
   ·细胞培养第122页
   ·细胞内蛋白提取第122-123页
   ·细胞外蛋白提取第123-124页
   ·二维电泳第124-125页
   ·银染及图像处理第125页
   ·胶内酶切第125-126页
   ·质谱鉴定第126页
   ·数据库搜索第126-127页
 3 结果与分析第127-133页
   ·辐照处理前后的胞内蛋白分析第127页
   ·辐照处理前后的胞外蛋白分析第127-133页
 4 小结与讨论第133-134页
 参考文献第134-137页
结论第137-140页
作者简历第140页

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