首页--农业科学论文--农业基础科学论文--土壤学论文--土壤生物学论文

土壤宏基因组文库PKS基因的筛选及其代谢物杀线虫活性测定

摘要第1-6页
Abstract第6-17页
第一章 文献综述第17-34页
 1 西藏高寒草甸土壤的基本特征第17页
 2 土壤宏基因组文库策略第17-24页
   ·土壤宏基因组文库的研究内容第17-18页
   ·土壤宏基因组文库的研究方法第18-23页
     ·样品DNA的提取第18-19页
     ·宏基因组宿主菌株第19-20页
     ·宏基因组文库的载体第20页
     ·宏基因组文库的筛选第20-21页
     ·宏基因组学的应用第21-22页
     ·宏基因组文库存在的问题第22-23页
   ·测序技术为基础的宏基因组体系第23-24页
 3 PKS基因的研究进展第24-28页
   ·Ⅰ型PKS第24-25页
   ·Ⅱ型PKS第25页
   ·Ⅲ型PKS第25-26页
   ·NRPS及杂合PKS/NRPS第26-28页
     ·异源表达聚酮化合物的培养基第27-28页
     ·异源表达宿主第28页
 4 南方根结线虫生物防治研究进展第28-30页
   ·线虫天敌微生物第28-30页
     ·线虫天敌细菌第28-29页
     ·线虫生防真菌第29页
     ·线虫天敌线虫第29页
     ·杀线虫放线菌第29-30页
   ·生物防治根结线虫的前景第30页
 5 松材线虫防治研究进展第30-31页
 6 研究的目的和意义第31-32页
 7 科学问题、研究内容和预期结果第32-34页
   ·科学问题第32页
   ·研究内容第32-33页
   ·预期结果第33-34页
第二章 土壤总DNA的提取方法的比较第34-43页
 1 材料与方法第34-38页
   ·材料第34-36页
     ·土壤样品第34-35页
     ·实验试剂及仪器第35-36页
   ·方法第36-38页
     ·直接法提取土壤微生物总DNA第36页
     ·间接法提取土壤微生物总DNA第36-37页
     ·DNA的纯度及效率检测第37页
     ·16S rDNA验证第37页
     ·PKS基因验证第37-38页
 2 结果与分析第38-41页
   ·DNA纯度的检测第38页
   ·不同土壤样品DNA产率的比较第38-39页
   ·PCR扩增效率检测第39-41页
 3 讨论第41-42页
 4 小结第42-43页
第三章 土壤宏基因组PKS基因和NRPS基因多样性及系统发育分析第43-56页
 1 材料与方法第44-46页
   ·材料第44页
     ·土壤样品第44页
     ·仪器及试剂第44页
   ·方法第44-46页
     ·土壤总DNA的提取第44页
     ·PCR扩增第44-45页
     ·克隆第45页
     ·测序及序列分析第45-46页
 2 结果与分析第46-55页
   ·土壤总DNA的提取第46页
   ·PCR扩增PKS基因KS域、序列分析及系统发育分析第46-51页
   ·NRPS基因A域系统发育分析第51-55页
 3 讨论第55页
 4 小结第55-56页
第四章 土壤宏基因组文库的构建第56-65页
 1 材料与方法第56-58页
   ·材料第56-57页
     ·土壤样品第56页
     ·仪器及试剂第56-57页
   ·方法第57-58页
     ·总DNA提取第57页
     ·Fosmid文库的构建第57-58页
     ·Fosmid宏基因组文库的特征分析第58页
 2 结果与分析第58-63页
   ·土壤微生物DNA的电泳检测第58-59页
   ·Fosmid文库特征分析第59-63页
     ·Fosmid文库插入片段分析第59-60页
     ·Fosmid文库插入片段Not Ⅰ酶切电泳检测第60-61页
     ·克隆的稳定性检测第61-63页
 3 讨论第63-64页
 4 小结第64-65页
第五章 土壤宏基因组文库PKS基因的筛选及杀南方根结线虫活性评价第65-82页
 1 材料与方法第65-70页
   ·材料第65-66页
     ·文库和菌株第65-66页
     ·供试线虫和黄瓜品种第66页
     ·引物第66页
   ·方法第66-70页
     ·超级池和二级池文库的构建第66页
     ·PKS基因的筛选第66-67页
     ·KS DNA序列与氨基酸序列系统进化关系的分析第67页
     ·杀线虫活性测定第67页
     ·亚克隆文库的构建和测序第67-69页
     ·K99培养时间对杀线虫活性的影响第69页
     ·K99对南方根结线虫温室盆栽防效实验第69-70页
     ·K99发酵液对松材线虫生长的影响第70页
 2 结果与分析第70-80页
   ·PKS基因的筛选第70-72页
   ·PKS基因杀线虫室内生物测定第72-74页
   ·Fosmid克隆K99亚克隆文库的构建和测序第74-78页
   ·K99培养时间对杀线虫活性的影响第78-79页
   ·K99温室盆栽实验第79-80页
   ·K99在灰霉上对松材线虫生长发育的影响第80页
 3 讨论第80-81页
 4 小结第81-82页
第六章 K99活性物质的理化性质初步研究第82-90页
 1 材料与方法第82-85页
   ·材料第82-83页
     ·菌株及线虫第82页
     ·仪器和试剂第82-83页
   ·方法第83-85页
     ·克隆菌K99发酵菌液的制备第83页
     ·发酵液初提物的制备第83页
     ·初提物热稳定性测定第83页
     ·初提物活性测定第83-84页
     ·粗提物薄层层析物质分析第84页
     ·粗提物薄层层析活性追踪第84-85页
 2 结果与分析第85-88页
   ·K99粗提物杀线虫活性测定第85页
     ·溶剂的筛选第85页
   ·粗提物的热稳定性测定第85-86页
   ·薄层层析物质分析第86-87页
   ·薄层层析活性物质追踪第87-88页
 3 讨论第88-89页
 4 小结第89-90页
第七章 放线菌F001对松材线虫致死活性研究第90-103页
 1 材料与方法第90-93页
   ·材料第90-91页
     ·菌株第90页
     ·供试线虫第90-91页
     ·仪器及试剂第91页
   ·方法第91-93页
     ·杀线虫活性的测定第91页
     ·杀线虫放线菌发酵液发酵条件的优化第91-92页
     ·10L发酵罐条件的优化第92页
     ·放线菌DNA提取第92页
     ·PCR扩增16s rDNA、KS、NRPS基因第92-93页
     ·放线菌发酵液热稳定性第93页
     ·放线菌发酵液对在小生境中对松材线虫生长的影响第93页
 2 结果与分析第93-101页
   ·放线菌对南方根结线虫的杀线活性的测定第93页
   ·放线菌对松材线虫的杀线虫活性的测定第93-94页
   ·放线菌的培养条件优化第94-98页
     ·培养时间第94-95页
     ·培养温度第95-96页
     ·起始pH值第96页
     ·摇床转速的优化第96-97页
     ·摇瓶装液量的优化第97页
     ·10L发酵罐条件的优化第97-98页
   ·放线菌的PKS和NRPS基因的克隆和16S rRNA的分析第98-100页
   ·放线菌发酵菌液的热稳定性第100页
   ·放线菌在松材线虫生境的杀线虫活性第100-101页
 3 讨论第101-102页
 4 小结第102-103页
第八章 全文总结第103-105页
 1 结论第103-104页
 2 需要继续研究的内容第104-105页
参考文献第105-112页
附录第112-115页
 1 英文缩略表第112-113页
 2 对南方根结线虫盆栽防效试验第113-114页
 3 对松材线虫小生境防效试验第114-115页
致谢第115-116页
作者简介第116页

论文共116页,点击 下载论文
上一篇:中国农村环境保护社区机制研究
下一篇:基于产权制度安排的我国自然文化遗产开发保护研究--以湘西为例