| 摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-8页 |
| 第一章 绪论 | 第12-30页 |
| 1.1 除草剂草甘膦 | 第12-14页 |
| 1.1.1 草甘膦的结构及理化性质 | 第12-13页 |
| 1.1.2 草甘膦应用的优缺点 | 第13-14页 |
| 1.1.3 草甘膦的作用机理 | 第14页 |
| 1.2 EPSP 合酶及其基因的研究现状 | 第14-22页 |
| 1.2.1 莽草酸途经简介 | 第14-16页 |
| 1.2.2 EPSP 合酶及其基因研究史 | 第16页 |
| 1.2.3 EPSP 合酶的分类、细胞中定位及不同组织中的分布 | 第16-17页 |
| 1.2.4 EPSP 合酶的三维结构及活性区 | 第17-19页 |
| 1.2.5 EPSP 合酶的催化机制 | 第19页 |
| 1.2.6 EPSP 合酶新型抑制剂 | 第19-20页 |
| 1.2.7 EPSP 合酶基因及表达 | 第20-22页 |
| 1.3 EPSP 合酶及其基因的应用 | 第22-24页 |
| 1.3.1 抗草甘膦 EPSP 合酶基因来源 | 第22-24页 |
| 1.3.2 在抗菌素和抗寄生虫药物上的应用 | 第24页 |
| 1.3.3 EPSP 合酶对莽草酸代谢的影响 | 第24页 |
| 1.4 分子对接 | 第24-29页 |
| 1.4.1 分子对接理论 | 第25页 |
| 1.4.2 分子对接方法的分类 | 第25-26页 |
| 1.4.3 Autodock 分子对接软件 | 第26-27页 |
| 1.4.4 Autodock 分子对接计算方法 | 第27-28页 |
| 1.4.5 分子对接的应用 | 第28页 |
| 1.4.6 反向分子对接 | 第28-29页 |
| 1.5 本论文的研究内容及研究意义 | 第29-30页 |
| 1.5.1 本论文的主要研究内容 | 第29页 |
| 1.5.2 本论文的研究意义 | 第29-30页 |
| 第二章 EPSP 合酶与草甘膦及底物 PEP 的分子对接 | 第30-58页 |
| 2.1 试验材料 | 第30页 |
| 2.2 计算平台 | 第30-31页 |
| 2.2.1 硬件平台 | 第30-31页 |
| 2.2.2 软件平台 | 第31页 |
| 2.3 对接步骤 | 第31-34页 |
| 2.3.1 EPSP 合酶受体的准备 | 第31-32页 |
| 2.3.2 配体的准备 | 第32-33页 |
| 2.3.3 格点对接 | 第33-34页 |
| 2.3.4 分子对接 | 第34页 |
| 2.4 EPSP 合酶与草甘膦及底物 PEP 的对接结果分析 | 第34-56页 |
| 2.4.1 最佳对接构象的选取 | 第34-43页 |
| 2.4.2 EPSP 合酶与草甘膦的对接分析 | 第43-50页 |
| 2.4.3 EPSP 合酶与 PEP 的对接分析 | 第50-56页 |
| 2.5 EPSP 合酶抗草甘膦强弱及催化活性对比 | 第56-57页 |
| 2.6 结论 | 第57-58页 |
| 第三章 EPSP 合酶突变体的设计及与草甘膦、底物 PEP 的分子对接 | 第58-83页 |
| 3.1 EPSP 合酶突变体的设计理论及方法 | 第58页 |
| 3.2 计算平台 | 第58页 |
| 3.3 对接步骤 | 第58-60页 |
| 3.3.1 受体的准备 | 第58-59页 |
| 3.3.2 配体的准备 | 第59页 |
| 3.3.3 格点对接 | 第59-60页 |
| 3.3.4 分子对接 | 第60页 |
| 3.4 EPSP 合酶突变体与草甘膦及底物 PEP 的对接结果分析 | 第60-81页 |
| 3.4.1 最佳对接构象的选取 | 第60-69页 |
| 3.4.2 EPSP 合酶突变体与草甘膦的对接分析 | 第69-75页 |
| 3.4.3 EPSP 合酶突变体与 PEP 的对接分析 | 第75-81页 |
| 3.5 EPSP 合酶突变体抗草甘膦强弱及催化活性对比 | 第81-82页 |
| 3.6 结论 | 第82-83页 |
| 第四章 结论与展望 | 第83-87页 |
| 4.1 结论 | 第83-84页 |
| 4.1.1 EPSP 合酶与草甘膦及底物 PEP 的分子对接 | 第83页 |
| 4.1.2 EPSP 合酶突变体与草甘膦及底物 PEP 的分子对接 | 第83-84页 |
| 4.2 创新点 | 第84-85页 |
| 4.3 展望 | 第85-87页 |
| 参考文献 | 第87-93页 |
| 发表论文情况 | 第93-94页 |
| 致谢 | 第94页 |
