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EPSP合酶活性及其耐草甘膦分子对接的研究

摘要第4-6页
Abstract第6-8页
第一章 绪论第12-30页
    1.1 除草剂草甘膦第12-14页
        1.1.1 草甘膦的结构及理化性质第12-13页
        1.1.2 草甘膦应用的优缺点第13-14页
        1.1.3 草甘膦的作用机理第14页
    1.2 EPSP 合酶及其基因的研究现状第14-22页
        1.2.1 莽草酸途经简介第14-16页
        1.2.2 EPSP 合酶及其基因研究史第16页
        1.2.3 EPSP 合酶的分类、细胞中定位及不同组织中的分布第16-17页
        1.2.4 EPSP 合酶的三维结构及活性区第17-19页
        1.2.5 EPSP 合酶的催化机制第19页
        1.2.6 EPSP 合酶新型抑制剂第19-20页
        1.2.7 EPSP 合酶基因及表达第20-22页
    1.3 EPSP 合酶及其基因的应用第22-24页
        1.3.1 抗草甘膦 EPSP 合酶基因来源第22-24页
        1.3.2 在抗菌素和抗寄生虫药物上的应用第24页
        1.3.3 EPSP 合酶对莽草酸代谢的影响第24页
    1.4 分子对接第24-29页
        1.4.1 分子对接理论第25页
        1.4.2 分子对接方法的分类第25-26页
        1.4.3 Autodock 分子对接软件第26-27页
        1.4.4 Autodock 分子对接计算方法第27-28页
        1.4.5 分子对接的应用第28页
        1.4.6 反向分子对接第28-29页
    1.5 本论文的研究内容及研究意义第29-30页
        1.5.1 本论文的主要研究内容第29页
        1.5.2 本论文的研究意义第29-30页
第二章 EPSP 合酶与草甘膦及底物 PEP 的分子对接第30-58页
    2.1 试验材料第30页
    2.2 计算平台第30-31页
        2.2.1 硬件平台第30-31页
        2.2.2 软件平台第31页
    2.3 对接步骤第31-34页
        2.3.1 EPSP 合酶受体的准备第31-32页
        2.3.2 配体的准备第32-33页
        2.3.3 格点对接第33-34页
        2.3.4 分子对接第34页
    2.4 EPSP 合酶与草甘膦及底物 PEP 的对接结果分析第34-56页
        2.4.1 最佳对接构象的选取第34-43页
        2.4.2 EPSP 合酶与草甘膦的对接分析第43-50页
        2.4.3 EPSP 合酶与 PEP 的对接分析第50-56页
    2.5 EPSP 合酶抗草甘膦强弱及催化活性对比第56-57页
    2.6 结论第57-58页
第三章 EPSP 合酶突变体的设计及与草甘膦、底物 PEP 的分子对接第58-83页
    3.1 EPSP 合酶突变体的设计理论及方法第58页
    3.2 计算平台第58页
    3.3 对接步骤第58-60页
        3.3.1 受体的准备第58-59页
        3.3.2 配体的准备第59页
        3.3.3 格点对接第59-60页
        3.3.4 分子对接第60页
    3.4 EPSP 合酶突变体与草甘膦及底物 PEP 的对接结果分析第60-81页
        3.4.1 最佳对接构象的选取第60-69页
        3.4.2 EPSP 合酶突变体与草甘膦的对接分析第69-75页
        3.4.3 EPSP 合酶突变体与 PEP 的对接分析第75-81页
    3.5 EPSP 合酶突变体抗草甘膦强弱及催化活性对比第81-82页
    3.6 结论第82-83页
第四章 结论与展望第83-87页
    4.1 结论第83-84页
        4.1.1 EPSP 合酶与草甘膦及底物 PEP 的分子对接第83页
        4.1.2 EPSP 合酶突变体与草甘膦及底物 PEP 的分子对接第83-84页
    4.2 创新点第84-85页
    4.3 展望第85-87页
参考文献第87-93页
发表论文情况第93-94页
致谢第94页

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