| 摘要 | 第5-8页 |
| Abstract | 第8-10页 |
| 第1章 概述 | 第13-25页 |
| 1.1 禽传染性支气管炎病毒的研究进展 | 第13-17页 |
| 1.1.1 IBV的发现及其流行现状 | 第13-14页 |
| 1.1.2 IBV基因组结构 | 第14页 |
| 1.1.3 IBV结构蛋白及其功能 | 第14-16页 |
| 1.1.4 IBV的变异机制 | 第16页 |
| 1.1.5 IBV的诊断技术 | 第16-17页 |
| 1.2 非编码RNA的研究进展 | 第17-25页 |
| 1.2.1 ncRNA的发现 | 第17-18页 |
| 1.2.2 ncRNA的定义 | 第18页 |
| 1.2.3 ncRNA的分类 | 第18-19页 |
| 1.2.4 ncRNA的表达及序列保守性 | 第19-20页 |
| 1.2.5 ncRNA的功能 | 第20-25页 |
| 第2章 禽传染性支气管炎ncRNA的发现及形成机制 | 第25-38页 |
| 2.1 材料与方法 | 第25-33页 |
| 2.1.1 供试细胞、病毒及质粒 | 第25-26页 |
| 2.1.2 主要试剂及配制 | 第26页 |
| 2.1.3 主要试验仪器 | 第26-27页 |
| 2.1.4 试验方法 | 第27-33页 |
| 2.2 结果与分析 | 第33-36页 |
| 2.2.1 ncRNA的检测 | 第33页 |
| 2.2.2 IBVncRNA的生成机制 | 第33-35页 |
| 2.2.3 影响IBVncRNA形成的关键核苷酸 | 第35-36页 |
| 2.3 小结与讨论 | 第36-38页 |
| 第3章 禽传染性支气管炎ncRNA的生物学特性研究 | 第38-52页 |
| 3.1 材料与方法 | 第38-44页 |
| 3.1.1 细胞与病毒 | 第38页 |
| 3.1.2 主要试剂及配制 | 第38-39页 |
| 3.1.3 主要试验仪器 | 第39-40页 |
| 3.1.4 试验方法 | 第40-44页 |
| 3.2 结果与分析 | 第44-50页 |
| 3.2.1 病毒滴度测定结果 | 第44页 |
| 3.2.2 ncRNA对病毒复制的影响 | 第44-46页 |
| 3.2.3 ncRNA对宿主基因表达的影响 | 第46-50页 |
| 3.3 小结与讨论 | 第50-52页 |
| 第4章 突变体C27107G的转录组学分析 | 第52-79页 |
| 4.1 材料与方法 | 第52-57页 |
| 4.1.1 细胞与病毒 | 第52页 |
| 4.1.2 主要试剂 | 第52页 |
| 4.1.3 主要试验仪器 | 第52-53页 |
| 4.1.4 试验方法 | 第53-57页 |
| 4.2 结果与分析 | 第57-77页 |
| 4.2.1 样品总RNA质量检测 | 第57-58页 |
| 4.2.2 各重复之间的相关性 | 第58-59页 |
| 4.2.3 测序数据产出统计 | 第59-60页 |
| 4.2.4 SNP | 第60-61页 |
| 4.2.5 可变碱基事件预测 | 第61-63页 |
| 4.2.6 差异表达基因数目统计 | 第63-67页 |
| 4.2.7 差异表达基因聚类分析 | 第67-69页 |
| 4.2.8 差异表达基因功能注释 | 第69页 |
| 4.2.9 差异表达基因筛选 | 第69-70页 |
| 4.2.10 差异表达基因GO分类 | 第70-71页 |
| 4.2.11 .差异表达基因COG分类 | 第71-73页 |
| 4.2.12 差异表达基因KRGG通路分类 | 第73-75页 |
| 4.2.13 差异表达基因蛋白互作网络 | 第75-77页 |
| 4.3 小结与讨论 | 第77-79页 |
| 第5章 全文结论 | 第79-80页 |
| 致谢 | 第80-81页 |
| 参考文献 | 第81-98页 |
| 附录 | 第98-101页 |
| 个人简历 | 第101页 |