转录机器的工作原理研究
| 前言 | 第4-6页 |
| 摘要 | 第6-8页 |
| Abstract | 第8-10页 |
| 目录 | 第10-11页 |
| 第一章 绪论转录研究的现状与问题 | 第11-48页 |
| 1.1 转录研究简史 | 第11-12页 |
| 1.2 基因转录的物质基础 | 第12-21页 |
| 1.2.1 DNA的双螺旋结构 | 第12-14页 |
| 1.2.2 基因的DNA序列特征 | 第14-16页 |
| 1.2.3 核小体的结构与功能 | 第16-19页 |
| 1.2.4 转录机器的架构 | 第19-21页 |
| 1.3 细胞信号转导与转录响应 | 第21-26页 |
| 1.3.1 细胞信号转导与系统生物学 | 第21-23页 |
| 1.3.2 真核转录响应的经典模型 | 第23-24页 |
| 1.3.3 真核生物转录的精确性与不确定性的矛盾 | 第24-26页 |
| 1.4 转录动力学的研究现状与问题 | 第26-29页 |
| 1.4.1 未知的转录机器工作原理 | 第26页 |
| 1.4.2 “转录钟”矛盾及其传统解读 | 第26-29页 |
| 1.5 染色质免疫沉淀技术的理论计算 | 第29-31页 |
| 1.6 Gillespie算法的基本步骤 | 第31-32页 |
| 1.7 本章小结 | 第32-33页 |
| 1.8 参考文献 | 第33-48页 |
| 第二章 真核生物转录机器运转的动力学原理 | 第48-68页 |
| 2.1 真核生物转录响应的一般模型 | 第48-50页 |
| 2.2 真核生物转录机器运转的数学方程式 | 第50-52页 |
| 2.3 真核生物转录激活子浓度的编码机制 | 第52-60页 |
| 2.4 真核生物转录响应的约束条件 | 第60-62页 |
| 2.5 真核生物转录机器运转的动力学原理 | 第62-63页 |
| 2.6 本章小结 | 第63-64页 |
| 2.7 参考文献 | 第64-68页 |
| 第三章 真核生物转录机器运转的动力学行为 | 第68-86页 |
| 3.1 真核生物机器运转的随机模型 | 第68-73页 |
| 3.2 转录爆发的本质 | 第73-74页 |
| 3.3 转录响应的输入输出关系 | 第74-78页 |
| 3.4 mRNA在细胞群体内的分布 | 第78页 |
| 3.5 真核转录机器对时变信号的响应 | 第78-82页 |
| 3.6 本章小结 | 第82-83页 |
| 3.7 参考文献 | 第83-86页 |
| 第四章 蛋白质-启动子相互作用的动力学 | 第86-105页 |
| 4.1 同时发生的转录快循环与慢循环 | 第86-87页 |
| 4.2 启动子状态演化的数学模型 | 第87-94页 |
| 4.3 转录进程同步化的极限条件 | 第94-95页 |
| 4.4 蛋白质在启动子上的频繁相互作用 | 第95-96页 |
| 4.5 快慢循环同时发生的根源 | 第96-99页 |
| 4.6 快慢循环现象的模拟再现 | 第99-100页 |
| 4.7 本章小结 | 第100-102页 |
| 4.8 参考文献 | 第102-105页 |
| 第五章 原核生物转录机器运转的动力学机制 | 第105-120页 |
| 5.1 原核转录机器的研究新进展 | 第106-108页 |
| 5.2 glnAp2基因转录机器的可能架构 | 第108-110页 |
| 5.3 glnAp2基因转录的随机模型 | 第110-112页 |
| 5.4 重建的glnAp2转录动力学与理论预言 | 第112-114页 |
| 5.5 本章小结 | 第114-116页 |
| 5.6 参考文献 | 第116-120页 |
| 第六章 结论与总结 | 第120-123页 |
| 论文列表 | 第123-125页 |
| 致谢 | 第125-126页 |
