弱信号模体检测的图搜索算法
| 摘要 | 第1-4页 |
| Abstract | 第4-7页 |
| 第一章 绪论 | 第7-13页 |
| ·问题的研究背景 | 第7-9页 |
| ·研究目的和意义 | 第9-11页 |
| ·本文的主要研究内容和结构 | 第11-13页 |
| 第二章 DNA序列模体发现问题 | 第13-19页 |
| ·模体发现问题的定义 | 第13-15页 |
| ·模体发现问题 | 第13-14页 |
| ·弱信号模体发现问题 | 第14-15页 |
| ·弱信号模体发现问题的分类 | 第15-16页 |
| ·PMP问题 | 第15页 |
| ·EMP问题 | 第15-16页 |
| ·DNA序列模体的表示 | 第16-19页 |
| ·矩阵表示 | 第16-17页 |
| ·串的表示 | 第17-19页 |
| 第三章 DNA序列模体发现算法 | 第19-31页 |
| ·模体发现算法设计 | 第19-21页 |
| ·动态规划方法 | 第19页 |
| ·贪心算法 | 第19-20页 |
| ·数学统计方法 | 第20-21页 |
| ·现有模体发现算法 | 第21-27页 |
| ·统计模型发现算法 | 第21-25页 |
| ·一致序列模型发现算法 | 第25-27页 |
| ·算法性能比较分析 | 第27-31页 |
| 第四章 噪声数据集中弱信号模体的图搜索算法 | 第31-47页 |
| ·问题的提出 | 第31-32页 |
| ·算法的基本思想 | 第32-33页 |
| ·算法步骤 | 第33-37页 |
| ·图的构造 | 第33-35页 |
| ·团的搜索算法 | 第35页 |
| ·模体恢复 | 第35-37页 |
| ·算法复杂度分析 | 第37-38页 |
| ·实验结果及分析 | 第38-47页 |
| ·合成数据验证与分析 | 第38-43页 |
| ·LexA真实数据验证与分析 | 第43-44页 |
| ·比较与分析 | 第44-47页 |
| 第五章 总结与展望 | 第47-49页 |
| 致谢 | 第49-51页 |
| 参考文献 | 第51-55页 |
| 研究成果 | 第55页 |