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五株芽胞杆菌鉴定

摘要第4-6页
Abstract第6-7页
目录第9-12页
1 前言第12-21页
    1.1 原核生物分类系统第12-13页
        1.1.1 分类、命名和鉴定第12页
        1.1.2 伯杰氏细菌分类系统第12-13页
        1.1.3 《原核生物》分类系统第13页
    1.2 芽胞杆菌分类的发展第13-14页
    1.3 原核生物的多相分类第14-18页
        1.3.1 传统分类方法第14-15页
        1.3.2 数值分类第15页
        1.3.3 化学分类第15-16页
        1.3.4 分子分类第16-18页
            1.3.4.1 16S rDNA序列分析第16-17页
            1.3.4.2 (G+C) mol%含量分析第17-18页
    1.4 芽胞杆菌的应用第18-19页
    1.5 本研究的目的和意义第19-21页
2 材料与方法第21-36页
    2.1 实验材料第21-25页
        2.1.1 主要试剂第21-22页
        2.1.2 主要仪器设备第22页
        2.1.3 分析软件第22-23页
        2.1.4 本实验所选用的参考模式菌株第23页
        2.1.5 本实验待鉴定菌株第23页
        2.1.6 细菌鉴定培养基(/L)第23-25页
    2.2 实验方法第25-36页
        2.2.1 培养与形态特征第25页
        2.2.2 生理生化特征第25-27页
        2.2.3 酶学特征实验第27-28页
        2.2.4 代谢产物实验第28-30页
        2.2.5 化学特征分析第30-32页
        2.2.6 16S rDNA序列测定及系统发育分析第32-34页
        2.2.7 基因组DNA(G+C)%含量分析第34-35页
        2.2.8 基因组DNA-DNA杂交实验第35-36页
3 结果与分析第36-60页
    3.1 表型特征第36-37页
        3.1.1 培养特征与电子显微特征第36页
        3.1.2 革兰氏染色、芽孢染色和鞭毛染色第36-37页
    3.2 生理生化特征第37-40页
        3.2.1 细菌运动性第37页
        3.2.2 耐盐性分析第37页
        3.2.3 生长pH范围第37-38页
        3.2.4 生长温度范围第38页
        3.2.5 柠檬酸盐(丙酸盐)的利用第38页
        3.2.6 马尿酸盐水解第38页
        3.2.7 丙二酸盐利用第38-39页
        3.2.8 碳、氮源的利用第39页
        3.2.9 纤维素分解第39-40页
    3.3 酶学实验结果第40-42页
        3.3.1 明胶水解第40页
        3.3.2 氧化酶第40页
        3.3.3 接触酶(H_2O_2)第40页
        3.3.4 淀粉水解第40-41页
        3.3.5 酪氨酸水解第41页
        3.3.6 色氨酸酶第41页
        3.3.7 氨基酸脱羧酶第41页
        3.3.8 脲酶第41页
        3.3.9 脂酶(Tween实验)第41-42页
        3.3.10 苯丙氨酸脱氨第42页
    3.4 代谢产物第42-44页
        3.4.1 抗生素敏感第42-43页
        3.4.2 糖或醇类发酵第43页
        3.4.3 硝酸盐还原第43-44页
        3.4.4 H_2S产生第44页
        3.4.5 乙酰甲基甲醇(V.P)第44页
        3.4.6 甲基红(M.R)第44页
    3.5 化学成分分析第44-49页
        3.5.1 磷酸类脂成分分析第44-45页
        3.5.2 脂肪酸成分分析第45-49页
    3.6 分子鉴定第49-60页
        3.6.1 基因组DNA的提取第49-50页
        3.6.2 16S rDNA序列测定及其系统发育分析第50-54页
        3.6.3 DNA(G+C)mol%测定第54-59页
        3.6.4 基因组DNA-DNA杂交第59-60页
4 讨论第60-65页
    4.1 菌株HB12575第60-61页
    4.2 菌株HB12576第61-62页
    4.3 菌株HB12037第62页
    4.4 菌株DB13031第62-63页
    4.5 菌株DB13260第63-65页
5 结论第65-73页
    5.1 菌株HB12575的描述第65-66页
    5.2 菌株HB12576~T(PAENIBACILLUS DONGJIAOENSIS SP.NOV.)的描述第66-68页
    5.3 菌株HB12037~T(PAENIBACILLUS BAMENWANGENSIS SP.NOV.)的描述第68-69页
    5.4 菌株DB13031~T(PAENIBACILLUS JIAXIENSIS SP.NOV.)的描述第69-71页
    5.5 菌株DB13260~T(PAENIBACILLUS JIANFENGLINGENSIS SP.NOV.)的描述第71-73页
附录第73-80页
    1. 五株芽胞杆菌的革兰氏染色效果第73页
    2. 五株芽胞杆菌的芽胞染色结果第73-74页
    3. 五株芽胞杆菌的电子显微照片第74页
    4. 五株芽胞杆菌的鞭毛染色结果第74-75页
    5. 五株芽胞杆菌的16S RDNA序列第75-80页
参考文献第80-87页
致谢第87页

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