摘要 | 第4-6页 |
Abstract | 第6-7页 |
目录 | 第9-12页 |
1 前言 | 第12-21页 |
1.1 原核生物分类系统 | 第12-13页 |
1.1.1 分类、命名和鉴定 | 第12页 |
1.1.2 伯杰氏细菌分类系统 | 第12-13页 |
1.1.3 《原核生物》分类系统 | 第13页 |
1.2 芽胞杆菌分类的发展 | 第13-14页 |
1.3 原核生物的多相分类 | 第14-18页 |
1.3.1 传统分类方法 | 第14-15页 |
1.3.2 数值分类 | 第15页 |
1.3.3 化学分类 | 第15-16页 |
1.3.4 分子分类 | 第16-18页 |
1.3.4.1 16S rDNA序列分析 | 第16-17页 |
1.3.4.2 (G+C) mol%含量分析 | 第17-18页 |
1.4 芽胞杆菌的应用 | 第18-19页 |
1.5 本研究的目的和意义 | 第19-21页 |
2 材料与方法 | 第21-36页 |
2.1 实验材料 | 第21-25页 |
2.1.1 主要试剂 | 第21-22页 |
2.1.2 主要仪器设备 | 第22页 |
2.1.3 分析软件 | 第22-23页 |
2.1.4 本实验所选用的参考模式菌株 | 第23页 |
2.1.5 本实验待鉴定菌株 | 第23页 |
2.1.6 细菌鉴定培养基(/L) | 第23-25页 |
2.2 实验方法 | 第25-36页 |
2.2.1 培养与形态特征 | 第25页 |
2.2.2 生理生化特征 | 第25-27页 |
2.2.3 酶学特征实验 | 第27-28页 |
2.2.4 代谢产物实验 | 第28-30页 |
2.2.5 化学特征分析 | 第30-32页 |
2.2.6 16S rDNA序列测定及系统发育分析 | 第32-34页 |
2.2.7 基因组DNA(G+C)%含量分析 | 第34-35页 |
2.2.8 基因组DNA-DNA杂交实验 | 第35-36页 |
3 结果与分析 | 第36-60页 |
3.1 表型特征 | 第36-37页 |
3.1.1 培养特征与电子显微特征 | 第36页 |
3.1.2 革兰氏染色、芽孢染色和鞭毛染色 | 第36-37页 |
3.2 生理生化特征 | 第37-40页 |
3.2.1 细菌运动性 | 第37页 |
3.2.2 耐盐性分析 | 第37页 |
3.2.3 生长pH范围 | 第37-38页 |
3.2.4 生长温度范围 | 第38页 |
3.2.5 柠檬酸盐(丙酸盐)的利用 | 第38页 |
3.2.6 马尿酸盐水解 | 第38页 |
3.2.7 丙二酸盐利用 | 第38-39页 |
3.2.8 碳、氮源的利用 | 第39页 |
3.2.9 纤维素分解 | 第39-40页 |
3.3 酶学实验结果 | 第40-42页 |
3.3.1 明胶水解 | 第40页 |
3.3.2 氧化酶 | 第40页 |
3.3.3 接触酶(H_2O_2) | 第40页 |
3.3.4 淀粉水解 | 第40-41页 |
3.3.5 酪氨酸水解 | 第41页 |
3.3.6 色氨酸酶 | 第41页 |
3.3.7 氨基酸脱羧酶 | 第41页 |
3.3.8 脲酶 | 第41页 |
3.3.9 脂酶(Tween实验) | 第41-42页 |
3.3.10 苯丙氨酸脱氨 | 第42页 |
3.4 代谢产物 | 第42-44页 |
3.4.1 抗生素敏感 | 第42-43页 |
3.4.2 糖或醇类发酵 | 第43页 |
3.4.3 硝酸盐还原 | 第43-44页 |
3.4.4 H_2S产生 | 第44页 |
3.4.5 乙酰甲基甲醇(V.P) | 第44页 |
3.4.6 甲基红(M.R) | 第44页 |
3.5 化学成分分析 | 第44-49页 |
3.5.1 磷酸类脂成分分析 | 第44-45页 |
3.5.2 脂肪酸成分分析 | 第45-49页 |
3.6 分子鉴定 | 第49-60页 |
3.6.1 基因组DNA的提取 | 第49-50页 |
3.6.2 16S rDNA序列测定及其系统发育分析 | 第50-54页 |
3.6.3 DNA(G+C)mol%测定 | 第54-59页 |
3.6.4 基因组DNA-DNA杂交 | 第59-60页 |
4 讨论 | 第60-65页 |
4.1 菌株HB12575 | 第60-61页 |
4.2 菌株HB12576 | 第61-62页 |
4.3 菌株HB12037 | 第62页 |
4.4 菌株DB13031 | 第62-63页 |
4.5 菌株DB13260 | 第63-65页 |
5 结论 | 第65-73页 |
5.1 菌株HB12575的描述 | 第65-66页 |
5.2 菌株HB12576~T(PAENIBACILLUS DONGJIAOENSIS SP.NOV.)的描述 | 第66-68页 |
5.3 菌株HB12037~T(PAENIBACILLUS BAMENWANGENSIS SP.NOV.)的描述 | 第68-69页 |
5.4 菌株DB13031~T(PAENIBACILLUS JIAXIENSIS SP.NOV.)的描述 | 第69-71页 |
5.5 菌株DB13260~T(PAENIBACILLUS JIANFENGLINGENSIS SP.NOV.)的描述 | 第71-73页 |
附录 | 第73-80页 |
1. 五株芽胞杆菌的革兰氏染色效果 | 第73页 |
2. 五株芽胞杆菌的芽胞染色结果 | 第73-74页 |
3. 五株芽胞杆菌的电子显微照片 | 第74页 |
4. 五株芽胞杆菌的鞭毛染色结果 | 第74-75页 |
5. 五株芽胞杆菌的16S RDNA序列 | 第75-80页 |
参考文献 | 第80-87页 |
致谢 | 第87页 |