| 致谢 | 第4-7页 |
| 摘要 | 第7-9页 |
| 微缩词表 | 第9-10页 |
| 1 文献综述 | 第10-15页 |
| 1.1 植原体研究 | 第10-12页 |
| 1.1.1 植原体的发现 | 第10页 |
| 1.1.2 植原体的特征 | 第10页 |
| 1.1.3 植原体的传播 | 第10-11页 |
| 1.1.4 植原体侵入后寄主的主要症状 | 第11页 |
| 1.1.5 植原体检测与诊断 | 第11-12页 |
| 1.1.6 植原体病害的防治 | 第12页 |
| 1.2 miRNA概述 | 第12-15页 |
| 1.2.1 miRNA的特点 | 第12-13页 |
| 1.2.2 miRNA调控功能 | 第13-15页 |
| 1.2.2.1 miRNA调控植物生长发育 | 第13页 |
| 1.2.2.2 miRNA调节植物激素及调控信号传导过程 | 第13-14页 |
| 1.2.2.3 miRNA与逆境胁迫 | 第14-15页 |
| 2 材料与方法 | 第15-20页 |
| 2.1 试验材料 | 第15页 |
| 2.2 试验用主要试剂及仪器 | 第15页 |
| 2.2.1 试验用主要试剂 | 第15页 |
| 2.2.2 试验用主要仪器 | 第15页 |
| 2.3 总RNA提取与检测 | 第15-16页 |
| 2.4 SRNA文库的构建和测序 | 第16页 |
| 2.5 测序结果的信息分析 | 第16-18页 |
| 2.5.1 小RNA测序的数据处理 | 第16-17页 |
| 2.5.2 已知miRNA和novel miRNA及其靶基因的鉴定 | 第17-18页 |
| 2.6 MIRNA的差异表达分析 | 第18页 |
| 2.7 降解组测序鉴定MIRNA的靶基因及其功能注释 | 第18-19页 |
| 2.8 差异表达MIRNA及其靶基因的QRT-PCR验证 | 第19-20页 |
| 3 结果与分析 | 第20-39页 |
| 3.1 sRNA库构建 | 第20页 |
| 3.2 小RNA长度分布 | 第20-21页 |
| 3.3 小RNA分类 | 第21-22页 |
| 3.4 已知miRNA的鉴定 | 第22-23页 |
| 3.5 新miRNA的鉴定 | 第23-24页 |
| 3.6 MIRNA的差异表达分析 | 第24页 |
| 3.6.1 白花泡桐中差异miRNA的筛选 | 第24页 |
| 3.6.2 毛泡桐中差异miRNA的筛选 | 第24页 |
| 3.6.3 豫杂一号泡桐中差异miRNA的筛选 | 第24页 |
| 3.7 MIRNA的共表达差异分析 | 第24-26页 |
| 3.7.1 健康苗与丛枝病苗间，三个泡桐种miRNA的共表达差异分析 | 第24-25页 |
| 3.7.2 DMS处理条件下，三个泡桐种间miRNA的共表达差异分析 | 第25-26页 |
| 3.7.3 丛枝病相关miRNA差异表达分析 | 第26页 |
| 3.8 差异表达MIRNA靶基因的预测 | 第26-27页 |
| 3.9 丛枝病发生相关MIRNAS靶基因的GO功能分类和功能注释 | 第27-37页 |
| 3.9.1 白花泡桐差异miRNAs靶基因的GO功能分类和功能注释 | 第27-30页 |
| 3.9.2 毛泡桐差异miRNA靶基因的GO功能分类和功能注释 | 第30-32页 |
| 3.9.3 豫杂一号泡桐差异miRNAs靶基因的GO功能分类和功能注释 | 第32-34页 |
| 3.9.4 三个种共有的miRNAs靶基因的GO功能分类和注释 | 第34-37页 |
| 3.10 MIRNAS的QRT-PCR验证 | 第37-38页 |
| 3.11 MIRNAS靶基因的QRT-PCR验证 | 第38-39页 |
| 4 结论 | 第39-40页 |
| 5 讨论 | 第40-46页 |
| 5.1 泡桐与植原体互作相关MIRNA | 第40-42页 |
| 5.2 泡桐与形态发生相关基因 | 第42-43页 |
| 5.3 三个泡桐种共有的相关基因 | 第43-46页 |
| 参考文献 | 第46-52页 |
| Abstract | 第52-53页 |
| 附录 | 第54-81页 |
