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三种泡桐幼苗丛枝病发生相关的miRNA筛选及验证

致谢第4-8页
摘要第8-10页
1 文献综述第10-19页
    1.1 泡桐丛枝病概述第10-13页
        1.1.1 泡桐丛枝病病原——植原体的概述第11页
        1.1.2 植原体的发现和主要的特征第11页
        1.1.3 丛枝病和植原体研究进展第11-13页
    1.2 植物microRNA概述第13-16页
        1.2.1 植物miRNA的生物合成过程第14-15页
        1.2.2 植物miRNA研究进展第15-16页
        1.2.3 植物miRNA的靶基因鉴定第16页
    1.3 降解组的研究进展第16-17页
    1.4 实验设计技术路线第17-18页
    1.5 本研究的目的意义第18-19页
2 引言第19页
3 材料与方法第19-28页
    3.1 植物材料及处理第19-20页
    3.2 本试验所需的主要试剂和仪器耗材第20页
        3.2.1 主要试剂第20页
        3.2.2 主要仪器设备耗材第20页
    3.3 泡桐总RNA的提取和质量检测第20-21页
        3.3.1 泡桐总RNA的提取第20-21页
        3.3.2 总RNA的质量检测第21页
    3.4 泡桐高通量测序以及数据分析第21-24页
        3.4.1 数据库第21页
        3.4.2 小分子RNA文库构建及测序第21-22页
        3.4.3 小分子RNA的测序数据分析流程第22-23页
        3.4.4 miRNA的鉴定第23页
        3.4.5 泡桐中miRNAs差异表达鉴定第23-24页
        3.4.6 鉴定响应泡桐丛枝病的miRNAs第24页
        3.4.7 miRNA生物信息预测靶基因和功能注释第24页
    3.5 降解组测序文库构建以及分析第24-26页
        3.5.1 降解组文库构建原理第24-25页
        3.5.2 降解组数据分析预测miRNA的靶基因第25-26页
        3.5.3 降解组测序靶基因的功能分析第26页
    3.6 差异表达miRNA及其靶基因的验证第26-28页
4 结果与分析第28-51页
    4.1 泡桐sRNA测序文库构建和高通量测序分析第28-31页
    4.2 泡桐miRNA的鉴定第31-37页
        4.2.1 白花泡桐已知miRNAs、新miRNAs的鉴定第32-33页
        4.2.2 毛泡桐已知miRNAs、新miRNAs的鉴定第33页
        4.2.3 豫杂一号泡桐已知miRNAs、新miRNAs的鉴定第33-35页
        4.2.4 三种泡桐间鉴定的已知miRNAs、新miRNAs的分析第35-37页
    4.3 三种泡桐的miRNA差异表达分析第37-39页
        4.3.1 白花泡桐miRNAs差异表达分析第37-38页
        4.3.2 毛泡桐miRNAs差异表达分析第38页
        4.3.3 豫杂一号泡桐miRNAs差异表达分析第38-39页
        4.3.4 三种泡桐间miRNAs的差异表达分析第39页
    4.4 降解组测序鉴定miRNA靶基因第39-50页
        4.4.1 数据分析第39-41页
        4.4.2 miRNAs降解位点的鉴定第41-43页
        4.4.3 三种泡桐miRNA的靶基因预测与功能注释第43-47页
            4.4.3.1 白花泡桐miRNA的靶基因预测与功能注释第43-44页
            4.4.3.2 毛泡桐miRNA的靶基因预测与功能注释第44-47页
        4.4.4 三种泡桐响应丛枝病miRNAs的靶基因第47-48页
            4.4.4.1 白花泡桐丛枝病发生相关miRNAs的靶基因第47页
            4.4.4.2 毛泡桐丛枝病发生相关miRNA的靶基因鉴定第47页
            4.4.4.3 豫杂一号泡桐丛枝病发生相关miRNA的靶基因鉴定第47-48页
            4.4.4.4 三种泡桐共同与丛枝病发生相关miRNA的靶基因鉴定第48页
        4.4.5 三种泡桐与丛枝病发生相关的miRNAs靶基因GO功能分类和KEGG分析第48-50页
    4.5 miRNAs和靶基因的qRT-PCR验证第50-51页
5 讨论与结论第51-56页
    5.1 全基因组水平研究泡桐miRNA的重要性第51页
    5.2 不同种泡桐间miRNA的差异分析第51-52页
    5.3 泡桐与丛枝病发生相关的miRNAs及其靶基因功能分析第52-56页
参考文献第56-65页
ABSTRACT第65-66页
附录第67-97页

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