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仿刺参肠道菌群多样性研究

摘要第4-5页
Abstract第5-6页
第一章 综述第10-20页
    1.1 仿刺参第10-11页
        1.1.1 仿刺参概况第10页
        1.1.2 仿刺参的营养价值与功效第10-11页
    1.2 仿刺参的人工养殖第11-12页
        1.2.1 养殖现状第11页
        1.2.2 养殖中出现的问题第11-12页
        1.2.3 微生态制剂在水产养殖中的应用第12页
    1.3 肠道菌群第12-14页
        1.3.1 肠道菌群的作用第12-13页
        1.3.2 肠道菌群的研究现状第13-14页
    1.4 微生物的多样性的研究方法第14-18页
        1.4.1 培养依赖法第14-15页
            1.4.1.1 传统的分离培养方法第14页
            1.4.1.2 传统培养方法的缺陷第14-15页
            1.4.1.3 传统的细菌鉴定方法第15页
            1.4.1.4 基于16S rDNA序列分析的细菌鉴定方法第15页
        1.4.2 不依赖培养的分子技术第15-18页
            1.4.2.1 DNA提取技术第16页
            1.4.2.2 构建16S rDNA克隆文库的分析方法第16-17页
            1.4.2.3 变性梯度凝胶电泳(DGGE)和温度梯度凝胶电泳(TGGE)第17-18页
            1.4.2.4 限制性片段长度多态性(RFLP)分析第18页
    1.5 本论文的研究内容与意义第18-20页
第二章 传统细菌分离培养方法研究仿刺参肠道菌群多样性第20-37页
    2.1 前言第20页
    2.2 实验材料第20-22页
        2.2.1 实验样品第20页
        2.2.2 主要培养基第20页
        2.2.3 主要仪器第20-21页
        2.2.4 主要试剂第21-22页
    2.3 实验方法第22-25页
        2.3.1 样品的处理第22页
        2.3.2 可培养细菌的培养和分离第22-23页
        2.3.3 细菌的鉴定第23-25页
            2.3.3.1 细菌的菌落及菌体形态观察第23页
            2.3.3.2 生理生化试验第23-24页
            2.3.3.3 16S rDNA序列分析第24-25页
    2.4 结果与讨论第25-37页
        2.4.1 仿刺参肠道细菌的培养和分离第25-28页
        2.4.2 仿刺参肠道细菌的生理生化试验第28-29页
        2.4.3 16S rDNA序列分析第29-34页
            2.4.3.1 DNA的提取第29-30页
            2.4.3.2 16S rDNA片段的扩增第30-31页
            2.4.3.3 16S rDNA序列的测定及系统发育树的构建第31-34页
        2.4.4 仿刺参肠道细菌菌相分析第34-37页
            2.4.4.1 仿刺参前后肠道菌相组成第34-35页
            2.4.4.2 不同季节仿刺参肠道菌相组成第35-37页
第三章 16S RDNA克隆文库分析仿刺参肠道菌群多样性第37-52页
    3.1 前言第37页
    3.2 实验材料第37-39页
        3.2.1 实验样品第37页
        3.2.2 主要培养基第37页
        3.2.3 主要仪器第37-38页
        3.2.4 主要试剂第38-39页
    3.3 实验方法第39-45页
        3.3.1 样品处理第39页
        3.3.2 肠道总细菌DNA提取第39-40页
        3.3.3 16S rDNA片段的扩增第40-41页
        3.3.4 PCR产物的纯化第41页
        3.3.5 构建16S rDNA克隆文库第41-45页
            3.3.5.1 CaCl_2法制备感受态细胞第41-42页
            3.3.5.2 PCR产物与T载体的连接第42页
            3.3.5.3 转化第42-43页
            3.3.5.4 阳性克隆的筛选第43-45页
            3.3.5.5 限制性片段多态性分析和系统发育分析第45页
    3.4 结果与讨论第45-52页
        3.4.1 肠道总细菌DNA提取第45-46页
        3.4.2 16S rDNA片段的扩增及纯化第46-47页
        3.4.3 构建16S rDNA克隆文库第47-52页
            3.4.3.1 连接和克隆转化第47-48页
            3.4.3.2 阳性克隆的筛选第48-49页
            3.4.3.3 限制性片段多态性分析第49-50页
            3.4.3.4 构建16S rDNA克隆文库过程的探讨第50-52页
第四章 结论第52-53页
参考文献第53-57页
致谢第57页

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