| 摘要 | 第4-5页 |
| ABSTRACT | 第5页 |
| 第1章 绪论 | 第8-18页 |
| 1.1 课题背景及研究的目的和意义 | 第8-9页 |
| 1.2 国内外阿尔兹海默病研究现状 | 第9-13页 |
| 1.3 基因芯片技术的发展及应用 | 第13-14页 |
| 1.4 高通量测序技术的发展及应用 | 第14-16页 |
| 1.5 本文主要研究内容 | 第16-18页 |
| 第2章 基于GWAS数据的候选阿尔兹海默病相关miRNA的识别研究 | 第18-26页 |
| 2.1 引言 | 第18页 |
| 2.2 GWAS数据及miRNA数据的获取 | 第18-19页 |
| 2.3 候选AD相关miRNA的识别方法 | 第19-21页 |
| 2.3.1 基因组位置比对 | 第19-20页 |
| 2.3.2 miRNA-based分析 | 第20-21页 |
| 2.4 区域关联分析 | 第21-25页 |
| 2.5 本章小结 | 第25-26页 |
| 第3章 候选miRNA在阿尔兹海默病人大脑组织中的差异表达研究 | 第26-38页 |
| 3.1 引言 | 第26页 |
| 3.2 RNA-seq数据的获取 | 第26页 |
| 3.3 基于R包的miRNA差异表达分析 | 第26-36页 |
| 3.3.1 DESeq包分析 | 第27-31页 |
| 3.3.2 edgeR包分析 | 第31-36页 |
| 3.4 本章小结 | 第36-38页 |
| 第4章 miR2185p的靶基因在阿尔兹海默病人大脑中的差异表达研究 | 第38-45页 |
| 4.1 引言 | 第38页 |
| 4.2 CLIP-seq数据、基因组注释数据及基因芯片数据的获取 | 第38-39页 |
| 4.3 候选miRNA靶基因的预测研究 | 第39-40页 |
| 4.3.1 基于TargetScan工具的靶基因预测 | 第39页 |
| 4.3.2 候选miRNA靶基因的筛选 | 第39-40页 |
| 4.4 基于GEO2R工具的靶基因差异表达分析 | 第40-43页 |
| 4.5 本章小结 | 第43-45页 |
| 第5章 miR2185p靶基因的功能及通路富集分析研究 | 第45-50页 |
| 5.1 引言 | 第45页 |
| 5.2 靶基因的准备及预处理 | 第45页 |
| 5.3 miR2185p靶基因集的功能及通路富集分析 | 第45-49页 |
| 5.3.1 GO功能富集分析 | 第46-48页 |
| 5.3.2 KEGG通路富集分析 | 第48-49页 |
| 5.4 本章小结 | 第49-50页 |
| 结论 | 第50-51页 |
| 参考文献 | 第51-59页 |
| 附录 | 第59-77页 |
| 攻读硕士学位期间发表的论文及其它成果 | 第77-79页 |
| 致谢 | 第79页 |
