| 摘要 | 第7-9页 |
| Abstract | 第9-10页 |
| 第一章 稻种资源抗旱性评价、基因发掘 | 第11-76页 |
| 1 前言 | 第11-27页 |
| 1.1 研究问题的由来 | 第11-12页 |
| 1.2 抗旱性 | 第12-15页 |
| 1.3 抗旱相关QTL定位 | 第15-16页 |
| 1.4 抗旱相关基因研究进展 | 第16-17页 |
| 1.5 数量性状研究方法 | 第17-23页 |
| 1.6 基因组编辑技术 | 第23-26页 |
| 1.7 本研究的目的和意义 | 第26-27页 |
| 2 材料与方法 | 第27-35页 |
| 2.1 试验材料 | 第27-29页 |
| 2.2 实验方法 | 第29-32页 |
| 2.3 群体表型性状测定 | 第32-33页 |
| 2.4 群体基因型鉴定 | 第33页 |
| 2.5 OsGNA1序列多样性分析 | 第33页 |
| 2.6 数据分析软件 | 第33-35页 |
| 3 结果与分析 | 第35-67页 |
| 3.1 抗旱鉴定岛土壤含水量变化 | 第35-36页 |
| 3.2 群体表型性状的变异 | 第36-44页 |
| 3.3 群体表型性状相关性分析 | 第44-47页 |
| 3.4 不同抗旱类型材料划分 | 第47-51页 |
| 3.5 群体结构分析 | 第51-52页 |
| 3.6 全基因组关联分析（GWAS） | 第52-58页 |
| 3.7 抗旱系数相关候选基因发掘 | 第58-62页 |
| 3.8 OsGNA1突变体表型分析和基因序列多样性分析 | 第62-64页 |
| 3.9 OsRLK5表达分析和突变体功能初步分析 | 第64-67页 |
| 4 讨论 | 第67-74页 |
| 4.1 抗旱性鉴定的方法和指标评价 | 第67-69页 |
| 4.2 抗旱性分类 | 第69-70页 |
| 4.3 关联分析与候选基因发掘 | 第70-73页 |
| 4.4 CRISPR/Cas9与功能研究 | 第73-74页 |
| 小结与展望 | 第74-76页 |
| 第二章 水稻耐旱性机制研究 | 第76-122页 |
| 1. 前言 | 第76-85页 |
| 1.1 研究问题的由来 | 第76页 |
| 1.2 耐旱性 | 第76-77页 |
| 1.3 响应水分亏缺的生理性状 | 第77-79页 |
| 1.4 转录组学 | 第79-82页 |
| 1.5 代谢组学 | 第82-84页 |
| 1.6 本研究的目的和意义 | 第84-85页 |
| 2 材料与方法 | 第85-91页 |
| 2.1 实验材料 | 第85页 |
| 2.2 试验方法 | 第85页 |
| 2.3 表型性状调查 | 第85-86页 |
| 2.4 转录组测序和数据分析 | 第86-89页 |
| 2.5 代谢组分析 | 第89-91页 |
| 3 结果与分析 | 第91-116页 |
| 3.1 土壤含水量变化 | 第91页 |
| 3.2 IAC1246和IRAT109的耐旱性评价 | 第91-92页 |
| 3.3 在干旱胁迫期间IAC1246和IRAT109的叶片含水量、渗透压、总抗氧化能力和光合速率变化 | 第92-94页 |
| 3.4 转录组测序结果 | 第94-98页 |
| 3.5 差异基因比较分析 | 第98-101页 |
| 3.6 Real-Time PCR验证转录组数据 | 第101-102页 |
| 3.7 差异基因KEGG、GO富集分析 | 第102-106页 |
| 3.8 与渗透压和T-AOC显著相关的差异基因的富集分析 | 第106-108页 |
| 3.9 与渗透压、抗氧化能力和光合作用相关的差异基因的调控模式分析 | 第108-109页 |
| 3.10 IAC1246 和 IRAT109 差异代谢物分析 | 第109-110页 |
| 3.11 差异代谢物与渗透压、抗氧化能力和差异基因相关性分析 | 第110-112页 |
| 3.12 差异代谢物在干旱期间的时序模式分析 | 第112-113页 |
| 3.13 基于差异代谢物的候选基因发掘 | 第113-116页 |
| 4 讨论 | 第116-121页 |
| 4.1 耐旱性的分子和生理基础 | 第116-118页 |
| 4.2 维持较强的光合作用是保证耐旱性的重要原因 | 第118-119页 |
| 4.3 水分利用效率与耐旱性 | 第119-120页 |
| 4.4 基于差异代谢物的耐旱候选基因发掘 | 第120-121页 |
| 小结与展望 | 第121-122页 |
| 参考文献 | 第122-137页 |
| 附录 | 第137-140页 |
| 作者简介 | 第140-142页 |
| 致谢 | 第142-143页 |
