| 摘要 | 第7-9页 |
| ABSTRACT | 第9-10页 |
| 缩略语表 | 第11-12页 |
| 1 前言 | 第12-21页 |
| 1.1 香菇概况 | 第12-17页 |
| 1.1.1 香菇生物学特性 | 第12-13页 |
| 1.1.2 香菇的食用与药用价值 | 第13页 |
| 1.1.3 香菇风味物质 | 第13-14页 |
| 1.1.4 香菇在环境重金属污染方面的生物治理 | 第14页 |
| 1.1.5 香菇栽培技术 | 第14-16页 |
| 1.1.6 香菇常规育种技术 | 第16页 |
| 1.1.7 香菇分子标记辅助育种 | 第16-17页 |
| 1.2 关联分析 | 第17-20页 |
| 1.2.1 关联分析概述 | 第17-18页 |
| 1.2.2 关联分析的基础 | 第18-19页 |
| 1.2.3 关联分析的方法与策略 | 第19页 |
| 1.2.4 全基因组关联分析的优势和不足 | 第19-20页 |
| 1.2.5 全基因组关联分析在真菌中的应用 | 第20页 |
| 1.3 课题的研究目的与意义 | 第20-21页 |
| 2 材料与方法 | 第21-32页 |
| 2.1 实验材料 | 第21-25页 |
| 2.1.1 野生群体材料 | 第21页 |
| 2.1.2 混合群体材料 | 第21-25页 |
| 2.1.3 供试培养基 | 第25页 |
| 2.2 农艺性状测定 | 第25-29页 |
| 2.2.1 香菇子实体性状测定 | 第25-27页 |
| 2.2.2 香菇菌丝体抗逆性状测定 | 第27-29页 |
| 2.3 单核苷酸多态性标记开发 | 第29-30页 |
| 2.3.1 香菇菌丝培养 | 第29页 |
| 2.3.2 基因组DNA提取与检测 | 第29-30页 |
| 2.3.3 基因组重测序和单核苷酸多态性标记开发 | 第30页 |
| 2.3.4 单核苷酸多态性标记开发、群体结构分析、连锁不平衡分析 | 第30页 |
| 2.4 数据分析 | 第30-32页 |
| 2.4.1 野生香菇群体农艺性状统计分析 | 第30页 |
| 2.4.2 香菇混合群体菌丝体抗逆性状统计分析 | 第30-31页 |
| 2.4.3 全基因组关联分析 | 第31-32页 |
| 3 结果与分析 | 第32-52页 |
| 3.1 子实体性状结果分析 | 第32-36页 |
| 3.1.1 子实体性状表型变异结果分析 | 第32-33页 |
| 3.1.2 子实体农艺性状简单相关性结果分析 | 第33-36页 |
| 3.1.3 子实体农艺性状基因型与环境互作结果分析 | 第36页 |
| 3.1.4 农艺性状广义遗传力结果分析 | 第36页 |
| 3.2 菌丝体抗性性状结果分析 | 第36-42页 |
| 3.2.1 重金属砷处理浓度参数的筛选结果分析 | 第36-40页 |
| 3.2.2 重金属镉处理浓度参数的筛选结果分析 | 第40页 |
| 3.2.3 高温胁迫处理温度参数的筛选结果分析 | 第40页 |
| 3.2.4 香菇菌丝体抗逆性状表型变异分析 | 第40-42页 |
| 3.2.5 香菇菌丝体抗逆性状简单相关 | 第42页 |
| 3.3 子实体农艺性状全基因组关联分析结果 | 第42-48页 |
| 3.3.1 子实体生育期性状关联结果 | 第43-44页 |
| 3.3.2 子实体菇形性状关联结果 | 第44-45页 |
| 3.3.3 子实体产量性状关联结果 | 第45-48页 |
| 3.4 香菇菌丝体抗逆性状全基因组关联分析结果 | 第48-49页 |
| 3.5 子实体农艺性状及菌丝体抗逆性状候选基因功能注释 | 第49-52页 |
| 4 讨论 | 第52-59页 |
| 4.1 香菇子实体农艺性状结果 | 第52-53页 |
| 4.2 香菇菌丝体抗逆性状结果 | 第53-55页 |
| 4.3 全基因组关联分析结果 | 第55页 |
| 4.4 关联标记候选基因功能分析 | 第55-59页 |
| 4.4.1 子实体农艺性状候选基因功能分析 | 第55-57页 |
| 4.4.2 香菇菌丝体重金属镉抗逆性候选基因功能分析 | 第57-59页 |
| 参考文献 | 第59-67页 |
| 附录 1：部分香菇菌丝体照片 | 第67-68页 |
| 附录 2：部分香菇菌株出菇图片 | 第68-69页 |
| 附录 3：位于重金属镉抗逆性状关联位点上下游 500bp内的基因 | 第69-71页 |
| 附录 4：2014 年出菇试验中子实体农艺性状关联位点上下游 500bp内的基因 | 第71-77页 |
| 附录 5：2015 年出菇试验中子实体农艺性状关联位点上下游 500bp内的基因 | 第77-85页 |
| 致谢 | 第85-86页 |
