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甘蓝型油菜“丙409”光周期敏感性QTLs定位及转录组分析

摘要第6-8页
Abstract第8-9页
缩略词表第10-11页
1 前言第11-25页
    1.1 光周期对油菜广适性的影响第11-12页
    1.2 拟南芥中开花的调控网络第12-18页
        1.2.1 春化途径第13-14页
        1.2.2 光周期途径第14-16页
        1.2.3 自主途径第16页
        1.2.4 赤霉素途径第16页
        1.2.5 年龄途径第16-17页
        1.2.6 温度途径第17页
        1.2.7 PHD锌指蛋白在拟南芥春化和光周期中的作用第17-18页
    1.3 开花时间是复杂的数量性状第18-19页
    1.4 开花性状遗传模式的研究第19页
    1.5 油菜开花期QTL定位的研究进展第19-21页
    1.6 光周期敏感基因的克隆第21-22页
    1.7 水稻中光周期现象的研究第22-23页
    1.8 转录组测序技术及其应用第23-24页
        1.8.1 转录组测序技术的含义第23页
        1.8.2 转录组技术的应用研究第23-24页
    1.9 研究目的和意义第24-25页
2 材料和方法第25-31页
    2.1 试验材料第25页
    2.2 试验材料的种植与花期的统计第25页
    2.3 数据处理第25页
    2.4 QTL定位及QTL的命名第25-26页
    2.5 人工气候箱材料种植及生长条件第26页
    2.6 总RNA的提取第26-27页
    2.7 RNA的纯度测定和电泳检测第27页
    2.8 转录组测序第27-29页
    2.9 差异表达基因的筛选第29页
    2.10 GO和KEGG的分析第29-31页
3 结果分析第31-51页
    3.1 表型变异第31-32页
    3.2 亲本光周期敏感性的分析第32-33页
    3.3 DH群体在6个环境下的开花期QTL信息第33-34页
    3.4 光周期敏感性的分析第34-36页
    3.5 RNA-seq转录组测序结果与分析第36-51页
        3.5.1 数据处理第36-38页
        3.5.2 两个重复之间的比较第38页
        3.5.3 差异表达基因的分析第38-40页
        3.5.4 差异表达基因GO功能注释第40-44页
        3.5.5 差异表达基因通路分析第44-45页
        3.5.6 在QTL区段内的差异基因第45-47页
        3.5.7 开花相关基因的表达分析第47-51页
4 讨论第51-54页
    4.1 QTL定位结果的分析第51页
    4.2 QTL区段内基因的分析第51-52页
    4.3 转录组数据的讨论第52页
    4.4 丙409广适应性的分析第52-53页
    4.5 关于进一步研究的设想第53-54页
参考文献第54-64页
附录第64-68页
致谢第68页

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