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维吉尼亚链霉菌IBL14中sviscsn基因簇功能分析

摘要第3-5页
Abstract第5-6页
缩略词表第7-11页
第一章 概述第11-17页
    1.1 CRISPR-Cas系统第11-13页
    1.2 维吉尼亚链霉菌IBL14(streptomyces virginiae IBL14)中的次级代谢与CYP450基因第13-15页
    1.3 一氧化氮与瓜氨酸代谢功能第15-16页
    1.4 研究内容,研究意义和研究方案第16-17页
第二章 S. virginiae IBL14中sviscsn基因簇鉴定与遗传分析第17-23页
    2.1 前言第17页
    2.2 材料和方法第17-18页
        2.2.1 菌株第17页
        2.2.2 分析软件和网址第17-18页
        2.2.3 方法第18页
    2.3 结果与讨论第18-22页
        2.3.1 IBL14菌株的全基因组测序结果与注释第18页
        2.3.2 IBL14菌株中的sviscsn基因簇第18-20页
        2.3.3 IBL14中的sviscsn基因簇中的基因的进化关系第20-22页
    2.4 结论第22-23页
第三章 I-B-svi型CRISPR-Cas系统对sviscsn基因簇的基因编辑第23-66页
    3.1 前言第23页
    3.2 材料与方法第23-44页
        3.2.1 菌株和质粒第23-25页
        3.2.2 主要试剂和实验仪器第25-28页
        3.2.3 培养基第28-30页
        3.2.4 主要仪器第30-31页
        3.2.5 实验方法第31-44页
    3.3 svu001、svicup02、svu015、svinos01基因及sviscsn基因簇的敲除第44-46页
    3.4 结果与讨论第46-65页
        3.4.1 S.virginiae IBL14菌株基因组的提取第46-47页
        3.4.2 基因上下游同源臂的克隆第47-51页
        3.4.3 基因编辑质粒的构建第51-54页
        3.4.4 基因编辑质粒的筛选与验证第54-55页
        3.4.5 svu001、svicup02、svu015、svinos01基因以及sviscsn基因簇的敲除第55-60页
        3.4.6 菌株IBL14敲除重组子在CGM培养集中的生长曲线第60-61页
        3.4.7 CGM液体培养基中菌株IBL14及其重组子在对数期菌丝体形态第61-63页
        3.4.8 CGM固体培养基上菌株IBL14及其重组子菌落形态第63-65页
    3.5 结论第65-66页
第四章 sviscsn基因簇蛋白表达与功能分析第66-85页
    4.1 前言第66页
    4.2 材料和方法第66-76页
        4.2.1 菌株与质粒第66-67页
        4.2.2 主要试剂,试剂盒和试剂配制第67-69页
        4.2.3 培养基第69-70页
        4.2.4 实验方法第70-76页
    4.3 结果与讨论第76-84页
        4.3.1 基因的克隆第76-78页
        4.3.2 重组质粒的构建第78-79页
        4.3.3 重组子的筛选和鉴定第79-80页
        4.3.4 SDS-PAGE检测蛋白表达以及底物的投料第80-82页
        4.3.5 CYP蛋白质的功能进行鉴定第82-84页
    4.4 结论第84-85页
第五章 结论与展望第85-87页
    5.1 结论第85-86页
    5.2 展望第86-87页
参考文献第87-90页
附录第90-93页
致谢第93-94页
文章与专利第94页

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