蛋白质主链二面角相关性研究
| 中文摘要 | 第4-6页 |
| ABSTRACT | 第6-7页 |
| 第一章 绪论 | 第10-20页 |
| 1.1 前言 | 第10-11页 |
| 1.2 蛋白质结构 | 第11-13页 |
| 1.3 蛋白质运动 | 第13-14页 |
| 1.4 分子动力学模拟 | 第14-15页 |
| 1.5 相关性 | 第15-17页 |
| 1.6 蛋白质运动相关性研究 | 第17-18页 |
| 1.7 本文的主要研究内容 | 第18-20页 |
| 第二章 蛋白质主链二面角相关性研究 | 第20-46页 |
| 2.1 前言 | 第20页 |
| 2.2 数据准备 | 第20-27页 |
| 2.2.1 蛋白质主链二面角 | 第20-21页 |
| 2.2.2 概率分布 | 第21-22页 |
| 2.2.3 分子动力学模拟数据 | 第22-24页 |
| 2.2.4 线性相关系数的计算 | 第24-25页 |
| 2.2.5 互信息的计算 | 第25页 |
| 2.2.6 随机重排分析 | 第25-26页 |
| 2.2.7 二面角分布收敛性分析 | 第26-27页 |
| 2.3 方法与结果 | 第27-44页 |
| 2.3.1 线性相关与非线性相关 | 第28-29页 |
| 2.3.2 二面角相关性矩阵 | 第29-31页 |
| 2.3.3 相关性与空间距离和二级结构 | 第31-35页 |
| 2.3.4 非线性相关与二面角构象转换 | 第35-38页 |
| 2.3.5 线性相关的混合 | 第38-40页 |
| 2.3.6 轨迹分段分析 | 第40-42页 |
| 2.3.7 时间尺度和假相关性 | 第42-43页 |
| 2.3.8 周期线性相关的问题 | 第43-44页 |
| 2.4 讨论 | 第44页 |
| 2.5 本章小结 | 第44-46页 |
| 第三章 相邻主链二面角相关性研究 | 第46-74页 |
| 3.1 前言 | 第46-47页 |
| 3.2 数据 | 第47-48页 |
| 3.3 方法与结果 | 第48-72页 |
| 3.3.1 近距离多阶相关 | 第49-52页 |
| 3.3.2 二级结构与相关性 | 第52-56页 |
| 3.3.3 相关性的分布 | 第56-59页 |
| 3.3.4 二面角联合分布 | 第59-62页 |
| 3.3.5 联合分布参数化 | 第62-65页 |
| 3.3.6 分布的位置与形状 | 第65-67页 |
| 3.3.7 联合分布聚类 | 第67-72页 |
| 3.4 本章小结 | 第72-74页 |
| 第四章 相关性的拟合 | 第74-84页 |
| 4.1 前言 | 第74-75页 |
| 4.2 数据准备 | 第75-76页 |
| 4.3 方法与结果 | 第76-82页 |
| 4.3.1 离散分布的拟合 | 第76-79页 |
| 4.3.2 二维正态分布拟合 | 第79-82页 |
| 4.4 本章小结 | 第82-84页 |
| 结论 | 第84-86页 |
| 参考文献 | 第86-96页 |
| 附录 | 第96-109页 |
| 作者简介及在学期间所取得的科研成果 | 第109-111页 |
| 作者简介 | 第109-110页 |
| 在校期间取得的科研成果 | 第110-111页 |
| 致谢 | 第111页 |
