摘要 | 第3-4页 |
Abstract | 第4页 |
第1章 引言 | 第8-18页 |
1.1 LncRNA的概述 | 第8-12页 |
1.1.1 非编码RNA的简介 | 第8-9页 |
1.1.2 长链非编码RNA概述 | 第9页 |
1.1.3 长链非编码RNA的分类 | 第9-10页 |
1.1.4 极长基因间非编码RNA的简介 | 第10-11页 |
1.1.5 长链非编码RNA的生物学功能 | 第11页 |
1.1.6 长链非编码RNA与癌症的研究进展 | 第11-12页 |
1.2 DNA损伤的概述 | 第12-16页 |
1.2.1 DNA损伤的来源和类型 | 第12-13页 |
1.2.2 DNA损伤修复 | 第13-15页 |
1.2.3 DNA损伤与癌症的研究进展 | 第15-16页 |
1.3 论文研究的基本思路 | 第16-18页 |
第2章 实验材料与方法 | 第18-28页 |
2.1 实验材料 | 第18-21页 |
2.1.1 细胞株 | 第18-19页 |
2.1.2 主要试剂 | 第19-20页 |
2.1.3 主要仪器与设备 | 第20页 |
2.1.4 主要药物 | 第20-21页 |
2.2 实验方法 | 第21-28页 |
2.2.1 溶液配制 | 第21页 |
2.2.2 细胞复苏、培养及传代 | 第21-22页 |
2.2.3 细胞的冻存 | 第22页 |
2.2.4 药物细胞实验 | 第22-23页 |
2.2.5 TRIzol法提取全RNA | 第23页 |
2.2.6 测样品浓度 | 第23-24页 |
2.2.7 RNA纯化 | 第24页 |
2.2.8 cDNA的合成 | 第24-26页 |
2.2.9 qPCR实验 | 第26-28页 |
第3章 单分子测序 | 第28-36页 |
3.1 Heliscope单分子测序仪 | 第28-30页 |
3.1.1 主要组成 | 第28-29页 |
3.1.2 主要原理 | 第29-30页 |
3.1.3 主要试剂 | 第30页 |
3.2 测序前的样品准备 | 第30-32页 |
3.2.1 加Poly-A尾巴 | 第30-31页 |
3.2.2 3’端的阻断反应 | 第31-32页 |
3.3 样品加载 | 第32页 |
3.4 填充和锁定 | 第32-33页 |
3.5 测序过程 | 第33-34页 |
3.5.1 化学循环 | 第33页 |
3.5.2 成像循环 | 第33-34页 |
3.5.3 数据的处理量 | 第34页 |
3.6 HeliScope单分子测序的特点 | 第34-36页 |
第4章 数据处理与分析 | 第36-74页 |
4.1 常用筛选工具 | 第36页 |
4.2 VlincRNA筛选方法 | 第36-37页 |
4.3 GO term分析方法及两组数据库 | 第37-38页 |
4.4 筛选出的vlincRNAs | 第38-74页 |
4.4.1 Vlinc KVURN1 | 第40-50页 |
4.4.2 Vlinc KVDRN2 | 第50-61页 |
4.4.3 Vlinc KVURN3和Vlinc KVDRN4 | 第61-74页 |
第5章 结论 | 第74-76页 |
参考文献 | 第76-80页 |
致谢 | 第80-82页 |
附录 | 第82-84页 |
个人简历 | 第84页 |