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浙江沿海创伤弧菌的分布特征及其种群结构研究

摘要第10-12页
Abstract第12-14页
第一章 创伤弧菌的生物学特征及致病因子第15-47页
    1 创伤弧菌的生化特征第16-20页
    2 创伤弧菌的分布第20-21页
    3 创伤弧菌的分离和鉴定第21-29页
        3.1 创伤弧菌的分离培养基第21-26页
        3.2 创伤弧菌的生化鉴定第26页
        3.3 创伤弧菌的分子检测第26-29页
    4 创伤弧菌的致病特征第29-33页
    5 致病因子第33-39页
        5.1 英膜多糖第33-34页
        5.2 脂多糖第34页
        5.3 鞭毛第34页
        5.4 菌毛第34-35页
        5.5 溶血素第35-36页
        5.6 金属蛋白酶第36页
        5.7 RtxA1第36-37页
        5.8 铁的获取第37-39页
    参考文献第39-47页
第二章 舟山海水产品中创伤弧菌污染状况及其基因分型研究第47-63页
    1 材料和方法第47-52页
        1.1 材料第47-48页
            1.1.1 样本采集第47页
            1.1.2 样本处理第47页
            1.1.3 主要试剂、仪器和标准菌株第47-48页
        1.2 方法第48-52页
            1.2.1 创伤弧菌定性检测与分离第48页
            1.2.2 创伤弧菌定量检测第48页
            1.2.3 PCR核酸检测与基因分型第48-50页
            1.2.4 药敏试验第50-52页
            1.2.5 统计分析第52页
    2 结果与分析第52-59页
        2.1 舟山市售生食海水产品中创伤弧菌的检出情况第52页
        2.2 舟山市售生食海水产品中不同季节创伤弧菌的检出情况第52页
        2.3 不同季节海水产品中创伤弧菌的定量分析第52-55页
        2.4 创伤弧菌分型第55页
        2.5 药敏分析第55-59页
    3 讨论第59-61页
    参考文献第61-63页
第三章 虾中分离创伤弧菌的分子特征和耐药分析第63-80页
    1 材料和方法第64-67页
        1.1 样品的采集第64页
        1.2 创伤弧菌的分离与鉴定第64页
        1.3 分子分析第64-65页
        1.4 MLVA分析第65-66页
        1.5 抗生素药敏试验第66-67页
    2 结果与分析第67-72页
        2.1 虾中创伤弧菌的分离鉴定与分布情况第67页
        2.2 创伤弧菌基因型分布第67-68页
        2.3 创伤弧菌MLVA系统树状图第68-70页
        2.4 创伤弧菌抗生素耐药性第70-72页
    3 讨论第72-75页
    参考文献第75-80页
第四章 腹泻病人粪便样本中创伤弧菌的检测分析第80-87页
    1 材料和方法第80-82页
        1.1 腹泻粪便样本第80页
        1.2 试剂与仪器第80-81页
        1.3 方法第81-82页
            1.3.1 菌株的分离鉴定第81-82页
            1.3.2 基因分型与药敏试验第82页
    2 结果和分析第82-83页
        2.1 创伤弧菌的检出情况第82页
        2.2 基因型别第82-83页
        2.3 药敏试验第83页
    3 讨论第83-85页
    参考文献第85-87页
第五章 舟山市腹泻病人粪便中创伤弧菌监测第87-92页
    1 材料和方法第87-88页
        1.1 标本来源第87页
        1.2 菌株分离第87页
        1.3 PCR核酸检测与基因分型第87-88页
    2 结果与分析第88-90页
        2.1 创伤弧菌的检出情况第88页
        2.2 生化鉴定第88页
        2.3 创伤弧菌药敏试验第88-89页
        2.4 PCR核酸鉴定与基因分型第89-90页
    3 讨论第90-91页
    参考文献第91-92页
第六章 一株新MLST型创伤弧菌的分离鉴定第92-100页
    1 材料和方法第92-95页
        1.1 材料第92-93页
            1.1.1 菌株来源第92页
            1.1.2 培养基与试剂第92-93页
            1.1.3 仪器第93页
        1.2 检测方法第93页
            1.2.1 生化鉴定第93页
            1.2.2 药敏试验第93页
            1.2.3 基因组DNA提取与PCR检测第93页
        1.3 MLST分析第93-95页
            1.3.1 PCR扩增和测序第93-94页
            1.3.2 等位基因序列提交和ST命名第94-95页
    2 结果与分析第95-97页
        2.1 生化鉴定与药敏试验第95-96页
        2.2 PCR检测和基因分型第96-97页
        2.3 MLST分型第97页
    3 讨论第97-99页
    参考文献第99-100页
第七章 创伤弧菌多位点序列分析第100-138页
    1 材料和方法第100-106页
        1.1 创伤弧菌菌株和培养基第100-104页
        1.2 DNA提取和PCR扩增第104页
        1.3 多位点序列分型第104-105页
        1.4 核酸序列的多序列比对第105页
        1.5 eBurst分析第105页
        1.6 核酸多态性和系统发育分析第105-106页
    2 结果与分析第106-132页
        2.1 vcg和16S rRNA基因分型及pilF基因分布情况第106-107页
        2.2 MLST等位基因profile第107-108页
        2.3 克隆群,group和singletons第108-112页
        2.4 核酸多态性和重组分析第112-127页
        2.5 系统发育分析第127-132页
    3 讨论第132-136页
    参考文献第136-138页
第八章 创伤弧菌脉冲场凝胶电泳分子分型第138-150页
    1 材料与方法第138-142页
        1.1 材料第138-140页
            1.1.1 菌株来源第138-140页
            1.1.2 菌株培养第140页
            1.1.3 主要试剂盒仪器第140页
        1.2 脉冲场凝胶电泳实验方法第140-142页
            1.2.1 胶块制备第141页
            1.2.2 细胞裂解第141页
            1.2.3 染色体DNA的酶切第141页
            1.2.4 加样和电泳第141页
            1.2.5 染色、脱色和成像第141-142页
    2 结果第142-143页
        2.1 创伤弧菌PFGE方法的建立与验证第142-143页
        2.2 不同来源创伤弧菌的PFGE分型分析第143页
    3 讨论第143-148页
    参考文献第148-150页
总结和展望第150-152页
    1、研究结果第150-151页
    2、展望第151-152页
中英文缩写对照表第152-154页
攻读学位期间的科研成果第154-156页
致谢第156页

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