摘要 | 第10-12页 |
Abstract | 第12-14页 |
第一章 创伤弧菌的生物学特征及致病因子 | 第15-47页 |
1 创伤弧菌的生化特征 | 第16-20页 |
2 创伤弧菌的分布 | 第20-21页 |
3 创伤弧菌的分离和鉴定 | 第21-29页 |
3.1 创伤弧菌的分离培养基 | 第21-26页 |
3.2 创伤弧菌的生化鉴定 | 第26页 |
3.3 创伤弧菌的分子检测 | 第26-29页 |
4 创伤弧菌的致病特征 | 第29-33页 |
5 致病因子 | 第33-39页 |
5.1 英膜多糖 | 第33-34页 |
5.2 脂多糖 | 第34页 |
5.3 鞭毛 | 第34页 |
5.4 菌毛 | 第34-35页 |
5.5 溶血素 | 第35-36页 |
5.6 金属蛋白酶 | 第36页 |
5.7 RtxA1 | 第36-37页 |
5.8 铁的获取 | 第37-39页 |
参考文献 | 第39-47页 |
第二章 舟山海水产品中创伤弧菌污染状况及其基因分型研究 | 第47-63页 |
1 材料和方法 | 第47-52页 |
1.1 材料 | 第47-48页 |
1.1.1 样本采集 | 第47页 |
1.1.2 样本处理 | 第47页 |
1.1.3 主要试剂、仪器和标准菌株 | 第47-48页 |
1.2 方法 | 第48-52页 |
1.2.1 创伤弧菌定性检测与分离 | 第48页 |
1.2.2 创伤弧菌定量检测 | 第48页 |
1.2.3 PCR核酸检测与基因分型 | 第48-50页 |
1.2.4 药敏试验 | 第50-52页 |
1.2.5 统计分析 | 第52页 |
2 结果与分析 | 第52-59页 |
2.1 舟山市售生食海水产品中创伤弧菌的检出情况 | 第52页 |
2.2 舟山市售生食海水产品中不同季节创伤弧菌的检出情况 | 第52页 |
2.3 不同季节海水产品中创伤弧菌的定量分析 | 第52-55页 |
2.4 创伤弧菌分型 | 第55页 |
2.5 药敏分析 | 第55-59页 |
3 讨论 | 第59-61页 |
参考文献 | 第61-63页 |
第三章 虾中分离创伤弧菌的分子特征和耐药分析 | 第63-80页 |
1 材料和方法 | 第64-67页 |
1.1 样品的采集 | 第64页 |
1.2 创伤弧菌的分离与鉴定 | 第64页 |
1.3 分子分析 | 第64-65页 |
1.4 MLVA分析 | 第65-66页 |
1.5 抗生素药敏试验 | 第66-67页 |
2 结果与分析 | 第67-72页 |
2.1 虾中创伤弧菌的分离鉴定与分布情况 | 第67页 |
2.2 创伤弧菌基因型分布 | 第67-68页 |
2.3 创伤弧菌MLVA系统树状图 | 第68-70页 |
2.4 创伤弧菌抗生素耐药性 | 第70-72页 |
3 讨论 | 第72-75页 |
参考文献 | 第75-80页 |
第四章 腹泻病人粪便样本中创伤弧菌的检测分析 | 第80-87页 |
1 材料和方法 | 第80-82页 |
1.1 腹泻粪便样本 | 第80页 |
1.2 试剂与仪器 | 第80-81页 |
1.3 方法 | 第81-82页 |
1.3.1 菌株的分离鉴定 | 第81-82页 |
1.3.2 基因分型与药敏试验 | 第82页 |
2 结果和分析 | 第82-83页 |
2.1 创伤弧菌的检出情况 | 第82页 |
2.2 基因型别 | 第82-83页 |
2.3 药敏试验 | 第83页 |
3 讨论 | 第83-85页 |
参考文献 | 第85-87页 |
第五章 舟山市腹泻病人粪便中创伤弧菌监测 | 第87-92页 |
1 材料和方法 | 第87-88页 |
1.1 标本来源 | 第87页 |
1.2 菌株分离 | 第87页 |
1.3 PCR核酸检测与基因分型 | 第87-88页 |
2 结果与分析 | 第88-90页 |
2.1 创伤弧菌的检出情况 | 第88页 |
2.2 生化鉴定 | 第88页 |
2.3 创伤弧菌药敏试验 | 第88-89页 |
2.4 PCR核酸鉴定与基因分型 | 第89-90页 |
3 讨论 | 第90-91页 |
参考文献 | 第91-92页 |
第六章 一株新MLST型创伤弧菌的分离鉴定 | 第92-100页 |
1 材料和方法 | 第92-95页 |
1.1 材料 | 第92-93页 |
1.1.1 菌株来源 | 第92页 |
1.1.2 培养基与试剂 | 第92-93页 |
1.1.3 仪器 | 第93页 |
1.2 检测方法 | 第93页 |
1.2.1 生化鉴定 | 第93页 |
1.2.2 药敏试验 | 第93页 |
1.2.3 基因组DNA提取与PCR检测 | 第93页 |
1.3 MLST分析 | 第93-95页 |
1.3.1 PCR扩增和测序 | 第93-94页 |
1.3.2 等位基因序列提交和ST命名 | 第94-95页 |
2 结果与分析 | 第95-97页 |
2.1 生化鉴定与药敏试验 | 第95-96页 |
2.2 PCR检测和基因分型 | 第96-97页 |
2.3 MLST分型 | 第97页 |
3 讨论 | 第97-99页 |
参考文献 | 第99-100页 |
第七章 创伤弧菌多位点序列分析 | 第100-138页 |
1 材料和方法 | 第100-106页 |
1.1 创伤弧菌菌株和培养基 | 第100-104页 |
1.2 DNA提取和PCR扩增 | 第104页 |
1.3 多位点序列分型 | 第104-105页 |
1.4 核酸序列的多序列比对 | 第105页 |
1.5 eBurst分析 | 第105页 |
1.6 核酸多态性和系统发育分析 | 第105-106页 |
2 结果与分析 | 第106-132页 |
2.1 vcg和16S rRNA基因分型及pilF基因分布情况 | 第106-107页 |
2.2 MLST等位基因profile | 第107-108页 |
2.3 克隆群,group和singletons | 第108-112页 |
2.4 核酸多态性和重组分析 | 第112-127页 |
2.5 系统发育分析 | 第127-132页 |
3 讨论 | 第132-136页 |
参考文献 | 第136-138页 |
第八章 创伤弧菌脉冲场凝胶电泳分子分型 | 第138-150页 |
1 材料与方法 | 第138-142页 |
1.1 材料 | 第138-140页 |
1.1.1 菌株来源 | 第138-140页 |
1.1.2 菌株培养 | 第140页 |
1.1.3 主要试剂盒仪器 | 第140页 |
1.2 脉冲场凝胶电泳实验方法 | 第140-142页 |
1.2.1 胶块制备 | 第141页 |
1.2.2 细胞裂解 | 第141页 |
1.2.3 染色体DNA的酶切 | 第141页 |
1.2.4 加样和电泳 | 第141页 |
1.2.5 染色、脱色和成像 | 第141-142页 |
2 结果 | 第142-143页 |
2.1 创伤弧菌PFGE方法的建立与验证 | 第142-143页 |
2.2 不同来源创伤弧菌的PFGE分型分析 | 第143页 |
3 讨论 | 第143-148页 |
参考文献 | 第148-150页 |
总结和展望 | 第150-152页 |
1、研究结果 | 第150-151页 |
2、展望 | 第151-152页 |
中英文缩写对照表 | 第152-154页 |
攻读学位期间的科研成果 | 第154-156页 |
致谢 | 第156页 |