| 摘要 | 第1-10页 |
| ABSTRACT | 第10-12页 |
| 论文使用的符号和縮写词 | 第12-13页 |
| 第一章 文献综述 | 第13-25页 |
| 1 引言 | 第13-16页 |
| ·我国畜禽养殖业污染的现状 | 第13-15页 |
| ·水源污染 | 第13页 |
| ·土壤污染 | 第13-14页 |
| ·大气污染 | 第14页 |
| ·兽药残留污染 | 第14页 |
| ·疾病传播 | 第14-15页 |
| ·畜禽污染的处理技术 | 第15-16页 |
| ·粪便综合利用 | 第15页 |
| ·环保饲料技术 | 第15-16页 |
| ·畜禽业防臭剂开发 | 第16页 |
| 2 生物发酵床养猪技术 | 第16-20页 |
| ·生物发酵床养猪技术的概念 | 第16页 |
| ·生物发酵床养猪技术的原理 | 第16-17页 |
| ·生物发酵床技术的研究进展 | 第17-18页 |
| ·生物发酵床养猪技术的缺点 | 第18-20页 |
| ·垫料来源困难,圈舍建造成本高 | 第19页 |
| ·实施严格的消毒防疫程序比较困难 | 第19页 |
| ·疾病控制比较困难 | 第19-20页 |
| ·菌种效率低且供应困难 | 第20页 |
| ·夏天温度过高 | 第20页 |
| 3 微生物多样性的研究方法 | 第20-24页 |
| ·传统培养法 | 第20-21页 |
| ·分子杂交技术 | 第21页 |
| ·磷脂脂肪酸分析(PLFA) | 第21页 |
| ·基于16SrRNA基因微生物多样性研究技术 | 第21-24页 |
| ·PCR-DGGE在微生物学研究中的应用 | 第22页 |
| ·限制性片段长度多态性分析(RFLP) | 第22-24页 |
| 4 研究的目的与意义 | 第24-25页 |
| 第二章 材料和方法 | 第25-37页 |
| 1 材料 | 第25-30页 |
| ·试验材料 | 第25页 |
| ·培养基 | 第25-26页 |
| ·常规试剂药品及试剂盒 | 第26-27页 |
| ·常用的试剂药品 | 第26页 |
| ·酶及试剂盒 | 第26-27页 |
| ·常用缓冲液及试剂的配制 | 第27-29页 |
| ·主要的试验仪器 | 第29-30页 |
| 2 试验方法 | 第30-37页 |
| ·采样 | 第30页 |
| ·微生物的分离、纯化及保存 | 第30-31页 |
| ·分离菌株的有机物筛选 | 第31页 |
| ·筛选菌株的生理生化鉴定 | 第31-32页 |
| ·筛选细菌16SrRNA分子生物学鉴定 | 第32-34页 |
| ·细菌基因组DNA的提取 | 第32页 |
| ·细菌16SrRNA片段的扩增 | 第32页 |
| ·PCR产物的纯化 | 第32页 |
| ·PCR产物的连接与转化 | 第32-33页 |
| ·阳性克隆子的筛选 | 第33-34页 |
| ·PCR-RFLP法分析猪生物发酵床细菌多样性 | 第34-37页 |
| ·猪生物发酵床细菌总基因组DNA的提取 | 第34页 |
| ·细菌V5-V9区16SrRNA基因PCR扩增 | 第34页 |
| ·PCR产物纯化 | 第34-35页 |
| ·猪生物发酵床16SrRNA基因文库的构建 | 第35页 |
| ·阳性克隆子的筛选 | 第35页 |
| ·猪生物发酵床细菌RFLP酶切分型分析 | 第35-36页 |
| ·系统发育树分析 | 第36-37页 |
| 第三章 结果与分析 | 第37-58页 |
| 1 微生物的分离结果 | 第37页 |
| 2 分离菌株的有机物筛选 | 第37-40页 |
| ·淀粉水解试验 | 第37-38页 |
| ·明胶液化试验 | 第38页 |
| ·油脂水解试验 | 第38页 |
| ·纤维素降解试验 | 第38-40页 |
| 3 筛选菌株的生理生化鉴定 | 第40-41页 |
| 4 细菌基因组总DNA的提取 | 第41页 |
| 5 细菌的16SrDNA的扩增 | 第41-42页 |
| ·细菌近全长16SrDNA的扩增 | 第41-42页 |
| ·细菌总基因组V5-V9区16SrDAN的扩增 | 第42页 |
| 7 RFLP分析 | 第42-44页 |
| 8 序列和系统进化分析 | 第44-58页 |
| ·保育期不同年限样品16SrDNA序列和系统进化分析 | 第44-51页 |
| ·保育期不同年限样品的16SrDNA序列比对结果 | 第44-47页 |
| ·保育期不同年限样品的系统发育分析 | 第47-51页 |
| ·育成期不同年限样品16SrDNA序列和系统进化分析 | 第51-58页 |
| ·育成期不同年限样品16SrDNA序列序列分析 | 第51-54页 |
| ·育成期不同年限样品系统发育分析 | 第54-58页 |
| 第四章 讨论 | 第58-63页 |
| 1 微生物的鉴定方法 | 第58页 |
| 2 生物发酵床样品基因组总DNA的提取 | 第58-59页 |
| 3 生物发酵床样品高质量基因文库的构建 | 第59页 |
| 4 RFLP分析 | 第59-61页 |
| ·保育期样品16SrDNA的RFLP分析 | 第60-61页 |
| ·育成期样品16SrDNA的RFLP分析 | 第61页 |
| 5 分子发育分析 | 第61-63页 |
| 第五章 小结 | 第63-65页 |
| 参考文献 | 第65-71页 |
| 附录(获得的菌株16SrDNA基因序列) | 第71-75页 |
| 致谢 | 第75页 |