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解淀粉芽孢杆菌PEBA20与细菌群体行为相关基因研究

中文摘要第1-11页
Abstract第11-13页
1 引言第13-24页
   ·群体感应系统(quorum sensing,QS)第13页
   ·aiiA 基因第13-17页
     ·aiiA 基因的作用第13-15页
     ·AiiA 蛋白在生物防治方面的研究第15-17页
   ·生物膜简介第17-18页
   ·两种群体行为的联系第18-21页
     ·群体感应与生物膜关系第18-20页
     ·aiiA 与生物膜关系第20-21页
   ·生物膜相关基因第21-22页
   ·基因打靶技术第22-23页
     ·同源重组技术第22-23页
     ·以抗性基因为筛选标记的双交换同源重组第23页
     ·结合了反向筛选标记的两步但交换同源重组第23页
   ·实验目的和意义第23-24页
2 材料与方法第24-39页
   ·材料第24-27页
     ·菌株与质粒第24页
     ·酶和生化试剂第24页
     ·溶液及培养基配制第24-26页
       ·培养基配制第24页
       ·溶液配制第24-26页
     ·仪器第26页
     ·引物设计第26-27页
   ·方法第27-33页
     ·Bacillus. amyloliquefaciens PEBA20 aiiA 基因克隆第27-31页
       ·基因组DNA 的提取第27页
       ·B.amyloliquefaciens PEBA20 的aiiA 基因扩增第27-28页
       ·PCR 产物回收第28-29页
       ·aiiA 基因扩增产物和pMD18-T 克隆载体的连接第29页
       ·大肠杆菌DH5α感受态的制备(采用CaC12法)第29-30页
       ·连接产物转化入大肠杆菌DH5α感受态细胞第30页
       ·菌落PCR 检测第30页
       ·质粒提取及重组克隆质粒的酶切鉴定第30-31页
       ·序列测定第31页
     ·序列分析第31页
     ·AiiA 融合蛋白的原核表达第31-32页
       ·表达载体的构建第31页
       ·阳性重组子的鉴定第31-32页
       ·IPTG 诱导表达第32页
       ·SDS-PAGE 电泳第32页
     ·AiiA 蛋白对胡萝卜欧文氏杆菌抗病性测定第32-33页
       ·胡萝卜块的制备第32-33页
       ·AiiA 蛋白样品的制备第33页
       ·感染样品第33页
   ·tasA-sipW-yqxM 操纵子的克隆第33-34页
     ·tasA 基因和sipw-yqxM 基因的扩增第33页
     ·PCR 产物回收与连接第33页
     ·连接产物的转化与验证第33页
     ·yqxM 操纵子的序列分析第33-34页
   ·sinR 基因突变株的构建第34-39页
     ·卡那霉素抗性质粒pMD18-T-kna 的构建第34-35页
       ·pEASY-T1 空载体的构建第34页
       ·卡纳抗性基因的扩增第34-35页
       ·pMD18-T-kna 的构建第35页
     ·pMD18-T-kna-sinR-Front 的构建第35-36页
       ·sinR 基因同源前臂的扩增第35-36页
       ·质粒pMD18-T-kna 以及同源前臂sinR F 的双酶切反应第36页
       ·PCR 酶切产物与质粒酶切产物连接第36页
       ·连接产物的转化及验证第36页
     ·pMD18-T-kna-sinR 的构建第36-38页
       ·sinR 基因同源后臂的扩增第36-37页
       ·质粒pMD18-T-kna-sinRF 以及同源后臂sinRB 的双酶切反应第37页
       ·PCR 酶切产物与质粒酶切产物连接第37-38页
       ·连接接产物的转化及验证第38页
     ·B.amyloliquefaciensPEBA20 的电转化第38-39页
       ·B.amyloliquefaciensPEBA20 感受态的制备第38页
       ·电转化第38页
       ·sinR 基因缺失菌株的筛选及PCR 检测第38-39页
       ·sinR 基因缺失菌株的形态学测定第39页
3 结果与分析第39-59页
   ·aiiA 基因克隆第39-44页
     ·B.amyloliquefaciens PEBA20 染色体DNA 的提取第39页
     ·aiiA 基因的克隆第39-40页
     ·aiiA 基因的序列分析第40-44页
   ·aiiA 基因的表达第44-48页
     ·重组表达质粒pEASY-E1/aiiA 的构建第44-46页
     ·AiiA 蛋白的功能分析第46-48页
   ·yqxM 操纵子的克隆与分析第48-51页
     ·yqxM 操纵子的克隆第48-49页
     ·yqxM 操纵子分析第49-51页
   ·sinR 基因突变株构建第51-59页
     ·pMD18-T-kna 载体的构建第51页
     ·同源前臂sinR-front 的克隆第51-52页
     ·同源后臂sinR-back 的克隆第52页
     ·sinR 基因打靶载体的构建第52-55页
     ·sinR 基因缺失菌株的筛选及PCR 检测第55-56页
     ·sinR 基因缺失株的形态学测定第56-59页
       ·固体培养基表面的生物膜形态第56-57页
       ·液体培养基表面的生物膜形态第57-59页
4 讨论第59-63页
   ·aiiA 基因的鉴定与功能第59页
   ·yqxM 操纵子的克隆和分析第59页
   ·sinR 基因突变株的构建第59-63页
     ·sinR 基因的确定第59-60页
     ·打靶载体骨架质粒的选择第60页
     ·靶基因同源序列的克隆第60-61页
     ·外源DNA 导入宿主细胞第61页
     ·同源重组转化子的筛选和鉴定第61-62页
     ·sinR 基因对生物膜形成的影响第62-63页
5 结论第63-64页
参考文献第64-70页
致谢第70-71页
攻读学位期间发表论文情况第71-72页
硕士学位论文内容简介及自评第72页

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