| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-10页 |
| 第1章 前言 | 第10-43页 |
| 1 六足总纲线粒体基因组全序列测定的研究概况 | 第10-11页 |
| ·最早测定的六足总纲线粒体基因组序列 | 第10页 |
| ·我国六足总纲线粒体基因组全序列测定研究概况 | 第10-11页 |
| 2 六足总纲线粒体基因组的主要特征 | 第11-21页 |
| ·线粒体基因组的结构特征 | 第11-12页 |
| ·线粒体基因组的遗传及进化特征 | 第12-14页 |
| ·线粒体基因组各组分的特征 | 第14-21页 |
| 3 线粒体基因组在进化研究中的应用价值 | 第21-22页 |
| 4 线粒体基因组全序列测序的方法学 | 第22-33页 |
| ·DNA测序的方法学 | 第22-24页 |
| ·较大DNA片段的测序策略 | 第24-26页 |
| ·线粒体基因组全序列测定的策略 | 第26-29页 |
| ·线粒体基因组测序片段的拼接 | 第29-30页 |
| ·基于生物信息学技术对线粒体基因组进行注释 | 第30-32页 |
| ·线粒体基因组全序列的递交 | 第32-33页 |
| ·线粒体基因组信息的网络资源 | 第33页 |
| 5 线粒体比较基因组学 | 第33页 |
| 6 线粒体谱系基因组学 | 第33-36页 |
| ·线粒体谱系基因组学研究方法 | 第34-35页 |
| ·线粒体谱系基因组学分析过程 | 第35页 |
| ·线粒体谱系基因组学研究概况 | 第35-36页 |
| 7 直翅目高级阶元分类系统 | 第36-41页 |
| ·螽亚目分类系统 | 第37-39页 |
| ·蝗亚目分类系统 | 第39-41页 |
| 8 直翅目分子系统学研究现状 | 第41页 |
| 9 本项研究的意义 | 第41-43页 |
| 第2章 材料与方法 | 第43-58页 |
| 1 实验材料 | 第43-44页 |
| ·实验标本的采集、保存与鉴定 | 第43页 |
| ·实验仪器及试剂 | 第43-44页 |
| ·生物信息学软件 | 第44页 |
| 2 实验方法 | 第44-58页 |
| ·线粒体基因组全序列测定 | 第45-51页 |
| ·线粒体基因组全序列的生物信息学分析 | 第51-52页 |
| ·直翅目线粒体谱系基因组学研究 | 第52-58页 |
| 第3章 线粒体基因组全序列测定 | 第58-104页 |
| 1 总DNA提取结果 | 第58页 |
| 2 PCR扩增 | 第58-59页 |
| ·L-PCR扩增结果 | 第59页 |
| ·Sub-PCR扩增结果 | 第59页 |
| 3 Sub-PCR扩增片段测序 | 第59-60页 |
| ·PCR法直接测序 | 第59-60页 |
| ·克隆测序 | 第60页 |
| 4 疑钩额螽线粒体基因组全序列 | 第60-71页 |
| ·线粒体基因组的基本组成特征 | 第60-63页 |
| ·蛋白质编码基因 | 第63-64页 |
| ·tRNA基因 | 第64-67页 |
| ·rRNA基因 | 第67-70页 |
| ·A+T丰富区 | 第70-71页 |
| 5 斑翅草螽线粒体基因组全序列 | 第71-78页 |
| ·线粒体基因组的基本组成特征 | 第71-74页 |
| ·蛋白质编码基因 | 第74页 |
| ·tRNA基因 | 第74页 |
| ·rRNA基因 | 第74页 |
| ·A+T丰富区 | 第74-78页 |
| 6 优雅蝈螽线粒体基因组全序列 | 第78-84页 |
| ·线粒体基因组的基本组成特征 | 第78-81页 |
| ·蛋白质编码基因 | 第81页 |
| ·tRNA基因 | 第81页 |
| ·rRNA基因 | 第81页 |
| ·A+T丰富区 | 第81-84页 |
| 7 北方棘螽线粒体基因组全序列 | 第84-90页 |
| ·线粒体基因组的基本组成特征 | 第84-87页 |
| ·蛋白质编码基因 | 第87页 |
| ·tRNA基因 | 第87页 |
| ·rRNA基因 | 第87页 |
| ·A+T丰富区 | 第87-90页 |
| 8 陈氏掩耳螽线粒体基因组全序列 | 第90-100页 |
| ·线粒体基因组的基本组成特征 | 第90-92页 |
| ·蛋白质编码基因 | 第92-93页 |
| ·tRNA基因 | 第93页 |
| ·rRNA基因 | 第93页 |
| ·A+T丰富区 | 第93-100页 |
| 9 讨论 | 第100-104页 |
| ·线粒体基因组的基本组成特征 | 第100页 |
| ·蛋白质编码基因 | 第100-102页 |
| ·tRNA基因 | 第102页 |
| ·rRNA基因 | 第102页 |
| ·A+T丰富区 | 第102-104页 |
| 第4章 直翅目昆虫的线粒体谱系基因组学研究 | 第104-118页 |
| 1 数据集序列组成分析 | 第104-105页 |
| 2 碱基替换饱和性分析 | 第105-106页 |
| 3 gl检验和PTP检验 | 第106页 |
| 4 系统发育关系重建 | 第106-116页 |
| ·简约法建树 | 第106-109页 |
| ·距离法建树 | 第109-111页 |
| ·最大似然法建树 | 第111-113页 |
| ·贝叶斯系统发育推论 | 第113-116页 |
| 5 讨论 | 第116-118页 |
| 结论 | 第118-120页 |
| 参考文献 | 第120-134页 |
| 附录Ⅰ 已测定的六足总纲线粒体基因组全序列种类 | 第134-140页 |
| 附录Ⅱ 六足总纲线粒体基因组全序列测定涉及的L-PCR引物 | 第140-146页 |
| 附录Ⅲ 本研究所涉及的Sub-PCR引物序列 | 第146-148页 |
| 攻读博士学位期间科研成果 | 第148-149页 |
| 致谢 | 第149页 |