| 中文摘要 | 第1-13页 |
| Abstract | 第13-17页 |
| 常用词语缩写 | 第17-18页 |
| 第一章 文献综述 | 第18-40页 |
| ·优质鸡与脂肪性状 | 第18页 |
| ·家禽脂肪组织的发育与代谢调控 | 第18-24页 |
| ·脂肪细胞的分化 | 第18-20页 |
| ·脂肪细胞的分布 | 第20页 |
| ·脂肪代谢的基本过程 | 第20-23页 |
| ·甘油三酯的合成代谢 | 第21-22页 |
| ·甘油三酯的分解代谢 | 第22-23页 |
| ·家禽脂肪代谢调控关键因素 | 第23-24页 |
| ·脂肪合成调控关键点 | 第23-24页 |
| ·脂肪分解调控关键点 | 第24页 |
| ·PAT家族研究进展 | 第24-36页 |
| ·PLIN基因的研究进展 | 第25-32页 |
| ·Perilipin的发现及其三种亚型 | 第25-26页 |
| ·Perilipin的结构与生物学功能 | 第26-29页 |
| ·Perilipin的调控机制 | 第29-30页 |
| ·Perilipin与其它脂滴表面蛋白的关系 | 第30页 |
| ·PLIN基因的多态性研究 | 第30-31页 |
| ·Perilipin与人类疾病 | 第31页 |
| ·Perilipin的研究前景 | 第31-32页 |
| ·ADFP基因研究进展 | 第32-36页 |
| ·脂肪分化相关蛋白 | 第32页 |
| ·ADFP的生物学功能 | 第32-34页 |
| ·ADFP的调控机制 | 第34页 |
| ·ADFP与疾病的关系 | 第34-35页 |
| ·ADFP与Perilipin的关系 | 第35页 |
| ·ADFP的研究前景 | 第35-36页 |
| ·分子遗传标记对优质鸡性状的辅助选择研究 | 第36-38页 |
| ·分子标记概述 | 第37页 |
| ·单链构象多态性(PCR-SSCP)检测技术 | 第37页 |
| ·MAS在家禽育种中的应用与研究简况 | 第37-38页 |
| ·分子标记技术的应用前景与展望 | 第38页 |
| ·本研究的目的和意义 | 第38-40页 |
| 第二章 ADFP和PLIN基因编码区的克隆及生物信息学分析 | 第40-67页 |
| ·引言 | 第40页 |
| ·材料和方法 | 第40-44页 |
| ·试验材料 | 第40-41页 |
| ·试剂与仪器 | 第41-42页 |
| ·试剂与仪器名称 | 第41页 |
| ·主要试剂的配制 | 第41-42页 |
| ·试验方法 | 第42-44页 |
| ·引物设计与合成 | 第42页 |
| ·试验步骤 | 第42-44页 |
| ·结果 | 第44-63页 |
| ·RNA质量 | 第44页 |
| ·ADFP和PLIN基因目的片段的扩增和克隆结果 | 第44-46页 |
| ·RT-PCR结果 | 第44-45页 |
| ·重组质粒的构建 | 第45页 |
| ·重组质粒的鉴定 | 第45-46页 |
| ·目的片段的测序结果 | 第46-48页 |
| ·克隆所得ADFP cDNA序列(EU620700) | 第47页 |
| ·克隆所得PLIN cDNA序列(EU620701) | 第47-48页 |
| ·鸡ADFP基因生物信息学分析 | 第48-56页 |
| ·序列比对结果 | 第48-50页 |
| ·鸡ADFP基因CDS序列的碱基组成 | 第50-51页 |
| ·鸡ADFP基因CDS密码子使用及氨基酸组成 | 第51-52页 |
| ·磷酸化位点预测 | 第52-53页 |
| ·疏水性分析 | 第53页 |
| ·蛋白质的跨膜螺旋特征 | 第53-54页 |
| ·鸡ADFP蛋白质二级结构的预测 | 第54页 |
| ·鸡ADFP蛋白质三级结构的预测 | 第54-55页 |
| ·鸡ADFP保守结构域预测 | 第55-56页 |
| ·鸡PLIN基因生物信息学分析 | 第56-63页 |
| ·序列比对结果 | 第56-57页 |
| ·鸡PLIN基因CDS序列的碱基组成 | 第57-58页 |
| ·鸡PLIN基因CDS密码子使用及氨基酸组成 | 第58-60页 |
| ·磷酸化位点预测 | 第60页 |
| ·疏水性分析 | 第60-61页 |
| ·蛋白质的跨膜螺旋特征 | 第61-62页 |
| ·鸡PLIN蛋白质二级结构的预测 | 第62页 |
| ·鸡PLIN蛋白质三级结构的预测 | 第62页 |
| ·PLIN保守结构域预测 | 第62-63页 |
| ·鸡PAT家族成员间序列分析 | 第63页 |
| ·讨论 | 第63-67页 |
| ·克隆cDNA序列分析 | 第63页 |
| ·蛋白质功能的确定 | 第63-67页 |
| ·通过相似序列的序列比对确定功能 | 第63-64页 |
| ·确定序列特性:疏水性、跨膜螺旋、磷酸化位点等 | 第64-65页 |
| ·鸡PAT家族成员间序列分析和保守域分析 | 第65页 |
| ·蛋白质三维结构预测 | 第65-67页 |
| 第三章 鸡ADFP和PLIN基因mRNA水平定量研究 | 第67-89页 |
| ·引言 | 第67-68页 |
| ·材料和方法 | 第68-73页 |
| ·材料 | 第68-69页 |
| ·四川山地乌骨鸡 | 第68-69页 |
| ·四川"大恒"优质鸡 | 第69页 |
| ·藏鸡 | 第69页 |
| ·试剂和仪器 | 第69-70页 |
| ·试剂 | 第69页 |
| ·仪器 | 第69-70页 |
| ·试剂的配制 | 第70页 |
| ·试验方法 | 第70-72页 |
| ·引物设计与合成 | 第70页 |
| ·组织总RNA的提取 | 第70-71页 |
| ·目的片断的扩增和标准品的制备 | 第71-72页 |
| ·实时荧光定量PCR | 第72页 |
| ·统计分析 | 第72-73页 |
| ·结果 | 第73-85页 |
| ·常规PCR及测序结果 | 第73页 |
| ·目的基因与管家基因的标准曲线及熔解曲线 | 第73-75页 |
| ·ADFP基因和PLIN基因表达的品种差异 | 第75页 |
| ·ADFP基因在1日龄四川山地乌骨鸡和藏鸡中的表达差异 | 第75页 |
| ·PLIN基因在1日龄四川山地乌骨鸡和藏鸡中的表达差异 | 第75页 |
| ·ADFP基因在70日龄四川山地乌骨鸡和优质鸡S01系中的表达差异 | 第75页 |
| ·PLIN基因在70日龄四川山地乌骨鸡和优质鸡S01系中的表达差异 | 第75页 |
| ·ADFP基因和PLIN基因表达的组织差异 | 第75-79页 |
| ·ADFP基因的组织表达差异 | 第75-76页 |
| ·PLIN基因的组织表达差异 | 第76-79页 |
| ·ADFP和PLIN基因表达的发育性变化 | 第79-83页 |
| ·ADFP基因表达的发育性变化 | 第79页 |
| ·PLIN基因表达的发育性变化 | 第79-83页 |
| ·四川山地乌骨鸡各性状累积生长值 | 第83页 |
| ·ADFP和PLIN基因的相对表达量与性状的相关分析 | 第83-85页 |
| ·ADFP基因的相对表达量与性状的相关分析 | 第83-84页 |
| ·PLIN基因的相对表达量与性状的相关分析 | 第84-85页 |
| ·ADFP与PLIN基因表达量的倍比关系 | 第85页 |
| ·讨论 | 第85-89页 |
| ·ADFP基因和PLIN基因表达量的品种差异 | 第85-86页 |
| ·ADFP基因相对定量结果及其与性状的相关分析 | 第86-87页 |
| ·PLIN基因相对定量结果及其与性状的相关分析 | 第87-88页 |
| ·ADFP基因与PLIN基因表达量的倍比关系 | 第88-89页 |
| 第四章 鸡ADFP和PLIN基因的多态位点筛选及其遗传效应分析 | 第89-123页 |
| ·引言 | 第89-90页 |
| ·材料与方法 | 第90-99页 |
| ·材料 | 第90页 |
| ·试验鸡群 | 第90页 |
| ·试剂和仪器 | 第90-92页 |
| ·试剂 | 第90-91页 |
| ·仪器与设备 | 第91页 |
| ·缓冲液与常用试剂的配制 | 第91-92页 |
| ·主要分子生物学软件 | 第92-93页 |
| ·试验方法 | 第93-98页 |
| ·屠宰性状、生长发育性能和肉质性能数据测定 | 第93-94页 |
| ·引物的设计与合成 | 第94-95页 |
| ·血样的采集及基因组DNA提取 | 第95-97页 |
| ·PCR-SSCP分析 | 第97-98页 |
| ·统计分析 | 第98-99页 |
| ·基因型频率和基因频率 | 第98页 |
| ·多态信息含量(PIC) | 第98-99页 |
| ·多态性位点的遗传效应统计分析模型 | 第99页 |
| ·单倍型的构建 | 第99页 |
| ·结果 | 第99-119页 |
| ·基因组DNA提取结果 | 第99-100页 |
| ·鸡ADFP基因的多态性及遗传效应 | 第100-110页 |
| ·ADFP基因多态位点的检测 | 第100-101页 |
| ·ADFP基因多态位点的基因型频率和等位基因频率 | 第101-102页 |
| ·ADFP基因各位点多态信息含量(PIC) | 第102-104页 |
| ·数据的正态分布检验及非正态分布数据的转换 | 第104-105页 |
| ·ADFP基因单突变位点对16个群体屠宰性状的遗传效应 | 第105页 |
| ·ADFP基因单倍型构建及其对16个群体屠宰性状的遗传效应 | 第105-107页 |
| ·ADFP基因单位点突变对四川山地乌骨鸡生长发育性能和肉质性状的遗传效应 | 第107页 |
| ·ADFP基因单倍型构建及其对四川山地乌骨鸡生长发育性能和肉质性状的遗传效应 | 第107-110页 |
| ·鸡PLIN基因的多态性及遗传效应 | 第110-119页 |
| ·PLIN基因多态位点的检测 | 第110-112页 |
| ·PLIN基因多态位点的基因型频率和等位基因频率 | 第112页 |
| ·PLIN基因各位点多态信息含量(PIC) | 第112-114页 |
| ·数据的正态分布检验及非正态分布数据的转换 | 第114页 |
| ·PLIN基因单突变位点对16个群体屠宰性状的遗传效应 | 第114页 |
| ·PLIN基因单倍型构建及其对16个群体屠宰性状的遗传效应 | 第114-115页 |
| ·PLIN基因单突变位点对四川山地乌骨鸡生长发育性能和肉质性状的遗传效应 | 第115页 |
| ·PLIN基因单倍型构建及其对四川山地乌骨鸡生长性能和肉质性状的遗传效应 | 第115-119页 |
| ·讨论 | 第119-123页 |
| ·鸡ADFP基因的多态性及遗传效应 | 第119-121页 |
| ·ADFP基因变异的鉴定 | 第119-120页 |
| ·ADFP基因与表型性状间的连锁分析 | 第120-121页 |
| ·鸡PLIN基因的多态性及遗传效应 | 第121-123页 |
| ·PLIN基因变异的鉴定 | 第121页 |
| ·PLIN基因与表型性状间的连锁分析 | 第121-123页 |
| 第五章 结论 | 第123-125页 |
| 参考文献 | 第125-137页 |
| 致谢 | 第137-138页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文目录 | 第138页 |
