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联合靶向HIV-1保守区域以及细胞受体基因的多靶点RNA干扰元件的制备

中文目录第1-8页
英文目录第8-11页
中文摘要第11-13页
英文摘要第13-15页
缩略词第15-17页
前言第17页
1.人免疫缺陷病毒及其治疗的研究进展第17-25页
   ·艾滋病的流行概况第17-18页
   ·人免疫缺陷病毒的分子生物学特征第18-21页
     ·HIV的基因组结构第18-19页
     ·HIV的病毒结构特征第19-20页
     ·HIV的生活周期第20-21页
     ·HIV的致病机制第21页
   ·人免疫缺陷病毒的体外培养及动物模型第21-23页
     ·人免疫缺陷病毒的体外培养第21-22页
     ·人免疫缺陷病毒的动物模型第22-23页
   ·人免疫缺陷病毒治疗的研究进展第23-25页
     ·HIV治疗药物的研究进展第23-24页
     ·HIV病毒疫苗的研究进展第24-25页
2.人免疫缺陷病毒的基因治疗第25-29页
   ·HIV基因治疗策略第26-27页
   ·基因治疗靶细胞第27-29页
     ·T淋巴细胞第27-28页
     ·造血干细胞第28-29页
3.RNA干扰的发现及其抗病毒应用第29-34页
   ·RNA干扰的发现及其作用机理第29-30页
   ·RNA干扰的特点第30-31页
   ·RNA干扰应用研究进展第31-32页
   ·siRNA基因治疗所面临的挑战第32-34页
     ·siRNA脱靶效应第32-33页
     ·RNA干扰元件的细胞导入难题第33-34页
     ·病毒的逃逸突变第34页
4.慢病毒载体介导的RNA干扰在HIV-1治疗中的应用第34-45页
   ·慢病毒载体系统第34-38页
     ·包装系统的改造第35-36页
     ·慢病毒包膜蛋白的改进第36-37页
     ·基因转移载体的改造第37-38页
   ·慢病毒载体介导的RNA干扰第38-40页
   ·慢病毒载体介导的RNAi应用于HIV-1治疗——进展与挑战第40-43页
   ·miRNA基因簇的应用第43-44页
   ·本研究的思路、目的与意义第44-45页
材料与方法第45-60页
 1.材料第45-49页
   ·主要仪器第45-46页
   ·菌株、质粒、细胞株、病毒株第46-47页
     ·E.coli菌株第46页
     ·质粒第46页
     ·细胞株第46页
     ·实验动物第46-47页
   ·试剂第47页
   ·常用溶液及培养基配制第47-49页
     ·大肠杆菌培养基的配制第47页
     ·抗生素储备液的配制第47-48页
     ·分子生物学实验用液的配制第48页
     ·细胞生物学实验用液的配制第48-49页
 2.方法第49-60页
   ·分子生物学实验方法第49-51页
     ·碱裂解法小量提取质粒第49页
     ·质粒小量提取试剂盒操作第49页
     ·酶切第49-50页
       ·制备型酶切第49-50页
       ·小量酶切鉴定第50页
     ·目的片段回收第50页
       ·小量胶回收DNA片段第50页
       ·乙醇沉淀法回收线性化质粒第50页
     ·引物退火第50页
     ·连接第50页
     ·E.coli感受态细胞的大量制备第50-51页
     ·连接物转化第51页
     ·质粒转化第51页
     ·DNA浓度的测定第51页
   ·细胞生物学实验方法第51-54页
     ·哺乳动物细胞常规培养第51-52页
       ·细胞复苏第51页
       ·换液第51-52页
       ·传代第52页
       ·细胞冻存第52页
       ·细胞计数第52页
     ·哺乳动物细胞的脂质体转染第52-53页
     ·倒置荧光显微镜观察荧光第53页
     ·重组慢病毒的生产第53页
     ·慢病毒滴度鉴定第53页
     ·重组慢病毒感染MT-4细胞及慢病毒稳定整合的细胞株制备第53-54页
     ·HIV-1病毒的生产及滴度鉴定第54页
       ·HIV-1病毒的生产第54页
       ·HIV-1病毒的滴度鉴定第54页
     ·HIV-1病毒对MT4-miRNA细胞株的感染第54页
   ·生化及细胞学检测方法第54-60页
     ·酶联免疫吸附分析(ELISA)测定HIV-1 p24抗原活性第54-55页
     ·荧光定量PCR检测第55-58页
       ·细胞总RNA提取第55页
       ·miRNA表达水平检测第55-57页
       ·IFN反应检测第57-58页
     ·细胞增殖和毒性检测第58页
       ·细胞毒性检测第58页
       ·细胞增殖检测第58页
     ·Dual-Luciferase(?)双萤光素酶报告基因检测系统第58页
     ·TZM-b1细胞检测HIV滴度第58-60页
结果与分析第60-86页
 1.靶向HIV-1 miRNA的设计第60-64页
   ·靶向HIV-1基因组siRNA的抑制效率及保守性分析第60-61页
   ·将表达siRNA的shRNA结构替换为miRNA结构的设计思路第61-64页
 2.靶向CCR5 miRNA的设计第64-65页
 3.miRNA表达载体的构建第65页
 4.融合有miRNA靶点序列的报告基因表达载体的构建第65-68页
 5.miRNA抑制靶点序列的效果验证第68-70页
   ·靶向HIV-1 miRNA抑制效果验证第68-69页
   ·靶向CCR5 miRNA抑制效果验证第69-70页
 6.Multi-miRNA表达元件的设计和构建第70-76页
   ·Multi-miRNA表达元件的设计思路第70-72页
   ·Linker序列的设计思路第72-73页
   ·pcDNA3.1+(Bgl Ⅱ-)的构建第73-74页
   ·miRNA-linker融合表达载体的构建第74-75页
   ·pcDNA3.1-miRNAL表达载体上miRNA表达活性的验证第75页
   ·多靶点miRNA表达载体的构建第75-76页
 7.miCVPP元件的二级结构分析第76-77页
 8.pLLK~K-miCVPP慢病毒转移载体的构建第77-79页
 9.pLLK~K-miCVPP对不同亚型HIV-1抑制效果的验证第79页
 10.pLLK~K-miCVPP对膜受体基因CCR5抑制效果的验证第79-80页
 11.pLLK~K-miCVPP抑制特异性分析第80页
 12.Lenti-miCVPP重组慢病毒的组装与鉴定第80-81页
 13.稳定表达miCVPP的MT-4细胞的制备第81-83页
 14.MT4-miCVPP细胞株中miRNA元件的表达分析第83-84页
 15.miCVPP的细胞毒性及细胞增殖分析第84页
 16.miCVPP的干扰素效应分析第84-85页
 17.重组慢病毒介导的miCVPP在MT-4细胞中的抗HIV-1保护性效果第85-86页
讨论第86-90页
 1.多靶点RNAi联合抑制HIV-1的优势第86页
 2.RNAi抑制HIV-1的靶点选择第86-87页
 3.人工miRNA的设计方法第87-88页
 4.多靶点RNAi元件的构建方法第88页
 5.慢病毒载体的优势第88-90页
总结与展望第90-92页
参考文献第92-111页
致谢第111页

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