| 致谢 | 第6-7页 |
| 摘要 | 第7-9页 |
| Abstract | 第9-10页 |
| 缩略词汇总 | 第17-18页 |
| 1 绪论 | 第18-36页 |
| 1.1 噬肺军团菌 | 第18-23页 |
| 1.1.1 军团菌分类 | 第18-19页 |
| 1.1.2 嗜肺军团菌的生物学特性 | 第19页 |
| 1.1.3 嗜肺军团菌致病过程 | 第19-20页 |
| 1.1.4 噬肺军团菌流行病学 | 第20页 |
| 1.1.5 噬肺军团菌检测方法研究进展 | 第20-23页 |
| 1.2 沙门氏菌 | 第23-27页 |
| 1.2.1 沙门氏菌分类 | 第23页 |
| 1.2.2 沙门氏菌的生物学特征 | 第23-24页 |
| 1.2.3 沙门氏菌致病机理 | 第24页 |
| 1.2.4 沙门氏菌流行病学 | 第24-25页 |
| 1.2.5 沙门氏菌检测方法研究进展 | 第25-27页 |
| 1.3 重组酶聚合酶扩增技术(RPA)概述 | 第27-34页 |
| 1.3.1 重组酶聚合酶扩增技术(RPA)的原理 | 第27-28页 |
| 1.3.2 重组酶聚合酶扩增技术(RPA)引物设计 | 第28-29页 |
| 1.3.3 重组酶聚合酶扩增技术(RPA)的特点 | 第29-30页 |
| 1.3.4 重组酶聚合酶扩增技术(RPA)反应产物鉴定 | 第30-33页 |
| 1.3.5 重组酶聚合酶扩增技术(RPA)应用现状 | 第33-34页 |
| 1.4 研究内容及意义 | 第34-36页 |
| 1.4.1 研究内容 | 第34-35页 |
| 1.4.2 本论文研究意义 | 第35-36页 |
| 2 噬肺军团菌的RPA-LFD方法的建立 | 第36-57页 |
| 2.1 实验材料 | 第36-37页 |
| 2.1.1 菌株 | 第36页 |
| 2.1.2 仪器设备 | 第36页 |
| 2.1.3 主要试剂 | 第36-37页 |
| 2.2 试验方法 | 第37-46页 |
| 2.2.1 样本的制备 | 第37-38页 |
| 2.2.2 PCR引物、RPA引物和qPCR引物设计 | 第38-39页 |
| 2.2.3 目的片段的PCR扩增 | 第39-40页 |
| 2.2.4 PCR产物回收及纯化 | 第40页 |
| 2.2.5 标准质粒构建 | 第40-43页 |
| 2.2.6 RPA体系的建立与优化 | 第43-44页 |
| 2.2.7 琼脂糖凝胶电泳 | 第44页 |
| 2.2.8 侧向流动免疫层析 | 第44页 |
| 2.2.9 qPCR体系建立 | 第44页 |
| 2.2.10 RPA反应与反应的qPCR特异性比对 | 第44-45页 |
| 2.2.11 RPA反应与qPCR反应的灵敏度比对 | 第45页 |
| 2.2.12 实际样品的检测 | 第45-46页 |
| 2.3 结果与分析 | 第46-55页 |
| 2.3.1 噬肺军团菌标准质粒构建与鉴定 | 第46-47页 |
| 2.3.2 噬肺军团菌RPA体系优化和建立 | 第47-52页 |
| 2.3.3 噬肺军团菌RPA和qPCR分析方法特异性比较 | 第52-53页 |
| 2.3.4 噬肺军团菌RPA和qPCR分析方法灵敏度比较 | 第53-55页 |
| 2.3.5 RPA-LFD检测方法检测水样品中噬肺军团菌的应用 | 第55页 |
| 2.4 小结 | 第55-57页 |
| 3 沙门氏菌的RPA-LFD方法的建立 | 第57-74页 |
| 3.1 实验材料 | 第57页 |
| 3.1.1 实验菌株 | 第57页 |
| 3.1.2 仪器设备 | 第57页 |
| 3.1.3 主要试剂 | 第57页 |
| 3.2 实验方法 | 第57-62页 |
| 3.2.1 样本的制备 | 第57-58页 |
| 3.2.2 PCR引物、RPA引物、qPCR引物设计 | 第58页 |
| 3.2.3 目的片段的PCR扩增 | 第58页 |
| 3.2.4 PCR产物回收与纯化 | 第58页 |
| 3.2.5 构建标准质粒 | 第58-60页 |
| 3.2.6 RPA体系的建立与优化 | 第60-61页 |
| 3.2.7 琼脂糖凝胶电泳 | 第61页 |
| 3.2.8 侧向流动免疫层析 | 第61页 |
| 3.2.9 qPCR体系建立 | 第61页 |
| 3.2.10 RPA反应与qPCR反应的特异性比对 | 第61页 |
| 3.2.11 RPA反应与qPCR反应的灵敏度比对 | 第61页 |
| 3.2.12 实际样品的检测 | 第61-62页 |
| 3.3 结果与分析 | 第62-72页 |
| 3.3.1 标准质粒构建与鉴定 | 第62-63页 |
| 3.3.2 沙门氏菌RPA体系建立与优化 | 第63-68页 |
| 3.3.3 RPA和qPCR分析方法特异性比较 | 第68-70页 |
| 3.3.4 RPA和qPCR分析方法灵敏度比较 | 第70-72页 |
| 3.3.5 RPA-LFD检测方法检测水样品中沙门氏菌的应用 | 第72页 |
| 3.4 小结 | 第72-74页 |
| 4 讨论 | 第74-76页 |
| 4.1 RPA引物设计 | 第74页 |
| 4.2 RPA-LFD的初步探索 | 第74页 |
| 4.3 军团菌的培养与基因组DNA提取 | 第74-76页 |
| 5 总结、创新与展望 | 第76-77页 |
| 5.1 总结 | 第76页 |
| 5.2 创新点 | 第76页 |
| 5.3 展望 | 第76-77页 |
| 参考文献 | 第77-84页 |
| 作者简历 | 第84页 |
