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马铃薯疮痂病的分离和检测体系构建

摘要第7-8页
Abstract第8页
缩略词表第9-10页
1 引言第10-16页
    1.1 马铃薯疮痂病简介第10-11页
        1.1.1 马铃薯疮痂病的危害与分布第10页
        1.1.2 马铃薯疮痂病的症状及发病原因分析第10-11页
    1.2 马铃薯疮痂病菌致病因子的研究第11-12页
        1.2.1 马铃薯疮痂病菌的致病毒素第11页
        1.2.2 马铃薯疮痂病菌毒素合成相关基因第11-12页
    1.3 马铃薯疮痂病原菌的分离鉴定第12-14页
        1.3.1 马铃薯疮痂病原菌的分离第12页
        1.3.2 马铃薯疮痂病原菌鉴定第12-13页
        1.3.3 马铃薯疮痂病致病种的多样性第13-14页
    1.4 分子技术与病原菌检测第14-16页
        1.4.1 PCR检测技术检测病原菌第14-15页
        1.4.2 RPA检测技术检测病原菌第15-16页
    1.5 研究的目的和意义第16页
    1.6 研究创新点第16页
2 试验材料和方法第16-23页
    2.1 供试材料与培养基第16-18页
        2.1.1 供试材料第16-17页
        2.1.2 供试培养基第17页
        2.1.3 药品与试剂第17页
        2.1.4 实验仪器第17-18页
    2.2 实验方法第18-23页
        2.2.1 马铃薯疮痂病菌的分离与纯化第18页
            2.2.1.1 第一次分离培养第18页
            2.2.1.2 第二次分离培养第18页
            2.2.1.3 第三次分离培养第18页
        2.2.2 核酸抽提第18-19页
            2.2.2.1 链霉菌的DNA提取第18页
            2.2.2.2 块茎样品的DNA提取第18-19页
        2.2.3 马铃薯疮痂病病原菌的鉴定第19页
        2.2.4 最低致病浓度的确定第19-20页
        2.2.5 马铃薯疮痂病普通PCR体系建立第20-22页
            2.2.5.1 txtA基因序列的收集比对、设计第20页
            2.2.5.2 特异引物的Touchdown扩增和产物测序与比对第20页
            2.2.5.3 PCR体系的优化第20-21页
            2.2.5.4 PCR引物的特异性检测第21页
            2.2.5.5 PCR引物的灵敏性检测第21页
            2.2.5.6 三种不同感病程度的马铃薯块茎的检测第21页
            2.2.5.7 田间材料的PCR检测第21-22页
        2.2.6 马铃薯块茎样品的RPA体系构建第22-23页
            2.2.6.1 RPA引物的设计第22页
            2.2.6.2 RPA检测体系步骤第22页
            2.2.6.3 RPA检测体系特异性第22页
            2.2.6.4 RPA检测方法的灵敏性第22页
            2.2.6.5 田间材料的RPA反应与PCR反应的对比第22-23页
3 结果分析第23-55页
    3.1 广东、湖北省五个地区马铃薯疮痴病的主要症状第23-27页
    3.2 马铃薯疮痂病病原菌的分离第27-39页
        3.2.1 第一次分离培养第27-33页
            3.2.1.1 高氏一号培养基接种两周后菌的生长状况第27-28页
            3.2.1.2 高氏一号培养基接种两月后菌的生长状况第28-33页
            3.2.1.3 芽孢杆菌的抑制作用第33页
        3.2.2 第二次分离培养第33-34页
        3.2.3 第三次分离培养第34-37页
        3.2.4 最低致病浓度的确定第37-39页
    3.3 马铃薯块茎样品的普通PCR体系构建第39-49页
        3.3.1 txtA基因序列的收集比对第39-41页
        3.3.2 Touchdown PCR第41-42页
        3.3.3 特异引物的PCR产物测序与比对第42-43页
        3.3.4 体系的优化第43-45页
            3.3.4.1 退火温度的优化第43页
            3.3.4.2 模板浓度和引物浓度的优化第43-44页
            3.3.4.3 最优化的PCR体系第44-45页
        3.3.5 特异性检测第45-46页
        3.3.6 灵敏性检测第46页
        3.3.7 三种不同感病程度的马铃薯块茎的检测第46-48页
        3.3.8 田间材料的PCR检测第48-49页
    3.4 马铃薯块茎样品的RPA体系构建第49-55页
        3.4.1 txtA基因序列的收集比对第49-52页
        3.4.2 RPA引物的特异性检验第52-53页
        3.4.3 RPA反应的灵敏性检验第53页
        3.4.4 田间材料的RPA反应与PCR反应的对比第53-55页
4 讨论第55-57页
    4.1 马铃薯疮痂病菌的分离第55页
    4.2 马铃薯疮痂病的检测第55-56页
    4.3 生防菌的筛选第56页
    4.4 展望第56-57页
参考文献第57-63页
附录 菌株XY-1216SrDNA序列第63-64页
致谢第64页

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