| 摘要 | 第4-6页 |
| ABSTRACT | 第6-9页 |
| 英文缩略表 | 第14-15页 |
| 1 前言 | 第15-28页 |
| 1.1 甘蔗重要性及其育种现状 | 第15-16页 |
| 1.2 甘蔗野生种质资源概述 | 第16页 |
| 1.3 甘蔗野生种质远缘杂交利用及意义 | 第16-19页 |
| 1.3.1 割手密 | 第16-17页 |
| 1.3.2 大茎野生种 | 第17页 |
| 1.3.3 蔗茅属 | 第17页 |
| 1.3.4 穗茅属 | 第17页 |
| 1.3.5 芒属 | 第17页 |
| 1.3.6 河八王属 | 第17-18页 |
| 1.3.7 甘蔗野生种质资源利用的困境与思考 | 第18-19页 |
| 1.4 甘蔗杂交利用中的染色体传递行为 | 第19-20页 |
| 1.5 AFLP在遗传分析中的应用 | 第20-22页 |
| 1.6 MSAP在DNA甲基化研究中的应用 | 第22-24页 |
| 1.6.1 DNA甲基化及作用 | 第22-23页 |
| 1.6.2 MSAP是研究植物DNA甲基化的有效方法 | 第23-24页 |
| 1.7 转录组研究 | 第24-26页 |
| 1.7.1 转录组技术 | 第24-25页 |
| 1.7.2 转录组技术在干旱研究上的应用 | 第25-26页 |
| 1.8 研究的目的意义 | 第26-27页 |
| 1.9 研究的技术路线 | 第27-28页 |
| 2 河八王资源遗传多样性分析及分子身份证构建 | 第28-40页 |
| 2.1 材料与方法 | 第28-32页 |
| 2.1.1 试验材料 | 第28页 |
| 2.1.2 主要试剂 | 第28页 |
| 2.1.3 主要仪器设备 | 第28-31页 |
| 2.1.4 试验方法 | 第31-32页 |
| 2.1.5 毛细管电泳检测 | 第32页 |
| 2.1.6 数据统计分析 | 第32页 |
| 2.2 结果与分析 | 第32-38页 |
| 2.2.1 扩增多态性分析 | 第32-34页 |
| 2.2.2 河八王无性系间遗传相似系数 | 第34页 |
| 2.2.3 聚类分析 | 第34-35页 |
| 2.2.4 主效应分析 | 第35-36页 |
| 2.2.5 河八王无性系间的地域分布 | 第36页 |
| 2.2.6 构建分子身份证 | 第36-38页 |
| 2.3 讨论 | 第38-39页 |
| 2.3.1 AFLP标记结合毛细管电泳技术在河八王遗传多样性研究中的运用 | 第38页 |
| 2.3.2 河八王资源的采集与应用 | 第38-39页 |
| 2.3.3 河八王种质资源的数字化身份证构建 | 第39页 |
| 2.4 小结 | 第39-40页 |
| 3 河八王F_1、BC_1染色体传递行为及亲本特异位点在后代中的遗传 | 第40-56页 |
| 3.1 材料与方法 | 第40-42页 |
| 3.1.1 植物材料 | 第40-41页 |
| 3.1.2 试剂耗材 | 第41页 |
| 3.1.3 主要仪器设备 | 第41页 |
| 3.1.4 试验方法 | 第41-42页 |
| 3.1.5 数据统计分析 | 第42页 |
| 3.2 结果 | 第42-53页 |
| 3.2.1 河八王F_1、BC_1染色体数观察及染色体传递行为 | 第42-44页 |
| 3.2.2 杂交种F_1、BC_1及其亲本的AFLP扩增 | 第44-46页 |
| 3.2.3 亲本特异位点在F_1中的遗传分析 | 第46-48页 |
| 3.2.4 亲本特异位点在BC_1后代中的遗传分析 | 第48-53页 |
| 3.2.5 河八王特异位点在F_1、BC_1中的遗传 | 第53页 |
| 3.3 讨论 | 第53-55页 |
| 3.3.1 杂交利用中河八王其后代的染色体“不平衡遗传”行为 | 第53-54页 |
| 3.3.2 河八王遗传位点在杂交利用中的传递 | 第54页 |
| 3.3.3 对甘蔗常规育种中有效利用河八王的思考 | 第54-55页 |
| 3.4 小结 | 第55-56页 |
| 4 杂交种F_1、BC_1及其亲本DNA甲基化水平和模式变化 | 第56-82页 |
| 4.1 材料与方法 | 第56-59页 |
| 4.1.1 试验材料 | 第56-57页 |
| 4.1.2 甘蔗基因组DNA提取与纯化 | 第57页 |
| 4.1.3 甲基化敏感扩增片段长度多态性(MSAP)分析 | 第57-59页 |
| 4.2 结果与分析 | 第59-79页 |
| 4.2.1 杂交种F_1、BC_1及其亲本的DNA甲基化水平 | 第60-63页 |
| 4.2.2 杂交种F_1、BC_1及其亲本的甲基化类型 | 第63-69页 |
| 4.2.3 亲本和后代F_1、BC_1的甲基化类型遗传分析 | 第69-79页 |
| 4.3 讨论 | 第79-81页 |
| 4.3.1 甘蔗与河八王杂交的基因组DNA甲基化水平 | 第79-80页 |
| 4.3.2 甘蔗与河八王杂交的不同世代个体间甲基化修饰的遗传稳定性 | 第80-81页 |
| 4.4 小结 | 第81-82页 |
| 5 河八王干旱胁迫下的转录组分析及耐甲基因挖掘 | 第82-103页 |
| 5.1 材料与方法 | 第82-85页 |
| 5.1.1 植物材料及胁迫处理 | 第82页 |
| 5.1.2 总RNA提取 | 第82-83页 |
| 5.1.3 转录组及表达谱文库构建与测序 | 第83页 |
| 5.1.4 De novo分析和转录组注释 | 第83-84页 |
| 5.1.5 GO和KEGG通路注释 | 第84页 |
| 5.1.6 基因表达分析 | 第84页 |
| 5.1.7 差异基因表达分析 | 第84页 |
| 5.1.8 功能分析 | 第84页 |
| 5.1.9 实时荧光定量PCR | 第84-85页 |
| 5.2 结果与分析 | 第85-100页 |
| 5.2.1 河八王叶片转录组数据组装 | 第85-86页 |
| 5.2.2 基因注释 | 第86-89页 |
| 5.2.3 基因表达分析 | 第89-90页 |
| 5.2.4 差异表达分析 | 第90-91页 |
| 5.2.5 功能分析 | 第91-95页 |
| 5.2.6 水分缺失下河八王基因应答 | 第95-99页 |
| 5.2.7 实时荧光定量PCR | 第99-100页 |
| 5.3 讨论 | 第100-101页 |
| 5.4 小结 | 第101-103页 |
| 6 结论 | 第103-106页 |
| 6.1 全文总结 | 第103-104页 |
| 6.2 创新点 | 第104-105页 |
| 6.3 问题与展望 | 第105-106页 |
| 参考文献 | 第106-119页 |
| 致谢 | 第119-120页 |
| 攻读学位期间发表的论文 | 第120页 |
