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寨卡病毒两种蛋白质的结构和功能研究

摘要第4-5页
Abstract第5页
第1章 引言第11-37页
    1.1 选题背景及意义第11-13页
    1.2 寨卡病毒的研究简史、特点第13-26页
        1.2.1 寨卡病毒的研究简史第13-14页
        1.2.2 黄病毒科及寨卡病毒的进化第14-16页
        1.2.3 寨卡病毒的传播途径第16-17页
        1.2.4 寨卡病毒的生活周期第17-18页
        1.2.5 寨卡病毒的症状、诊断、治疗及防治第18-20页
        1.2.6 寨卡病毒的生物学特征第20-26页
    1.3 寨卡病毒NS1的研究意义第26-33页
        1.3.1 NS1在病毒复制中的重要作用第27-28页
        1.3.2 NS1与宿主蛋白以及补体的相互作用第28-29页
        1.3.3 NS1作为疾病治疗和检测中的作用第29-30页
        1.3.4 NS1行使功能的重要结构特征第30-33页
    1.4 寨卡病毒MTase的研究意义第33-35页
        1.4.1 加帽反应第33-35页
        1.4.2 甲基转移酶功能的重要性第35页
    1.5 本课题的研究内容与意义第35页
    1.6 论文结构安排第35-37页
第2章 ZIKV NS1_(172-352) 的晶体制备第37-57页
    2.1 实验材料第37-40页
        2.1.1 实验仪器及耗材第37页
        2.1.2 实验菌种与载体第37-38页
        2.1.3 实验酶及试剂第38页
        2.1.4 培养基与缓冲液配制第38-40页
    2.2 实验原理第40-45页
        2.2.1 包涵体变复性原理第40-41页
        2.2.2 离子交换层析原理第41-42页
        2.2.3 凝胶过滤层析原理第42-43页
        2.2.4 蛋白的结晶学原理第43-45页
    2.3 实验方法第45-50页
        2.3.0 ZIKV NS1_(172-352) 基本信息第45-46页
        2.3.1 ZIKV NS1_(172-352) 表达载体的构建第46-48页
        2.3.2 ZIKV NS1_(172-352) 的试表达第48页
        2.3.3 ZIKV NS1_(172-352) 的表达第48-49页
        2.3.4 ZIKV NS1_(172-352) 包涵体蛋白的洗涤及变复性第49页
        2.3.5 ZIKV NS1_(172-352) 可溶性蛋白的纯化第49-50页
        2.3.6 ZIKV NS1_(172-352) 蛋白的结晶第50页
    2.4 实验结果第50-57页
        2.4.1 ZIKV NS1_(172-352) 表达载体的构建第50-51页
        2.4.2 ZIKV NS1_(172-352) 蛋白的试表达第51-52页
        2.4.3 ZIKV NS1_(172-352) 蛋白的纯化第52-54页
        2.4.4 ZIKV NS1_(172-352) 蛋白的结晶第54-57页
第3章 ZIKV NS1_(172-352) 的结构功能研究第57-77页
    3.1 结构解析原理简介第57-64页
        3.1.1 晶体X衍射基本原理第57-59页
        3.1.2 求解相位问题的方法第59-61页
        3.1.3 分子置换法第61-64页
    3.2 ZIKV NS1_(172-352) 的晶体衍射数据收集和处理第64-66页
        3.2.1 ZIKV NS1_(172-352) 的晶体衍射数据收集第64-65页
        3.2.2 ZIKV NS1_(172-352) 的晶体衍射数据处理第65-66页
    3.3 分子置换法解析ZIKV NS1_(172-352)的晶体结构第66-68页
        3.3.1 ZIKV NS1_(172-352) 的结构解析,搭建与修正第66-67页
        3.3.2 最终结构模型的质量评估第67-68页
    3.4 ZIKV NS1_(172-352) 的结构及与同种属病毒NS1结构的比较第68-70页
    3.5 ZIKV NS1_(172-352) 二聚体的差异性与自身进化及病毒毒力的关系第70-71页
    3.6 ZIKV NS1_(172-352) 电荷性质的差异性与宿主蛋白、保护性抗体结合的关系第71-72页
    3.7 基于结构筛选与优化ZIKV NS1的中和性抗体第72-73页
    3.8 ZIKV NS1整体结构以及 β-ladder在其中的功能第73-75页
    3.9 本章小结第75-77页
第4章 基于结构研究突变对ZIKV NS1聚合的影响第77-105页
    4.1 实验原理第77-80页
        4.1.1 分析型超速离心第77-78页
        4.1.2 昆虫系统表达蛋白原理第78-80页
    4.2 实验方法第80-88页
        4.2.1 ZIKV NS1_(172-352) T233A突变体的载体构建、表达及纯化第80-81页
        4.2.2 ZIKV NS1_(172-352) 以及ZIKV NS1_(172-352) T233A突变体分子筛实验第81页
        4.2.3 ZIKV NS1_(172-352) 和ZIKV NS1_(172-352) T233A突变体沉降速率实验第81-82页
        4.2.4 ZIKV NS1的pFastBac载体构建第82-83页
        4.2.5 ZIKV NS1的重组bacmid的获取第83-84页
        4.2.6 ZIKV NS1重组bacmid转染sf9昆虫细胞及病毒扩增第84-85页
        4.2.7 ZIKV NS1四种构建蛋白的试表达第85-86页
        4.2.8 ZIKV Op64-NS1蛋白的大量表达、纯化第86-87页
        4.2.9 ZIKV NS1以及ZIKV NS1 T233A突变体的分子筛实验第87-88页
    4.3 实验结果第88-102页
        4.3.0 ZIKV NS1_(172-352) T233A突变体的载体构建、表达及纯化第88-91页
        4.3.1 ZIKV NS1_(172-352) 浓度依赖性实验第91-93页
        4.3.2 ZIKV NS1_(172-352) T233A突变体分子筛实验以及与母体蛋白的比较第93-95页
        4.3.3 ZIKV NS1_(172-352) 以及ZIKV NS1_(172-352) T233A突变体沉降速率实验第95-97页
        4.3.4 ZIKV NS1 p Fast Bac载体构建以及重组bacmid的获取第97-98页
        4.3.5 ZIKV NS1试表达第98-100页
        4.3.6 ZIKV NS1蛋白的大量表达、纯化第100页
        4.3.7 ZIKV NS1 T233A重组bacmid获得以及蛋白的大量表达、纯化第100-102页
        4.3.8 ZIKV NS1以及ZIKV NS1 T233A突变体蛋白的聚集状态比较第102页
    4.4 本章小结第102-105页
第5章 ZIKV甲基转移酶与抑制剂的结构第105-117页
    5.1 背景介绍第105-106页
    5.2 实验方法第106-109页
        5.2.1 ZIKV MTase基本信息第106-107页
        5.2.2 ZIKV MTase表达载体的构建第107-108页
        5.2.3 ZIKV MTase的表达与纯化第108页
        5.2.4 ZIKV MTase与抑制剂复合物的结晶第108-109页
        5.2.5 ZIKV MTase与抑制剂复合物晶体数据收集和处理第109页
    5.3 实验结果第109-117页
        5.3.1 ZIKV MTase的载体构建、表达、纯化第109-111页
        5.3.2 ZIKV MTase与抑制剂复合物的结晶与数据收集第111-113页
        5.3.3 ZIKV MTase与抑制剂复合物的结构及相互作用第113-117页
第6章 结论与展望第117-119页
参考文献第119-135页
发表论文第135-137页
致谢第137-138页

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