| 摘要 | 第5-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 第1章 绪论 | 第10-25页 |
| 1.1 简单重复序列概述 | 第10-15页 |
| 1.1.1 简单重复序列的类型及特征 | 第10-11页 |
| 1.1.2 简单重复序列的分布及组成 | 第11-12页 |
| 1.1.3 简单重复序列的进化及突变机制 | 第12-13页 |
| 1.1.4 简单重复序列与疾病 | 第13-14页 |
| 1.1.5 简单重复序列的应用及研究现状 | 第14-15页 |
| 1.2 腺病毒概述 | 第15-18页 |
| 1.2.1 腺病毒的分类及结构 | 第15-16页 |
| 1.2.2 腺病毒的感染及致病性 | 第16-17页 |
| 1.2.3 抗腺病毒治疗 | 第17-18页 |
| 1.2.4 腺病毒载体的研究现状 | 第18页 |
| 1.3 生物信息学数据库及查询 | 第18-21页 |
| 1.3.1 NCBI数据库 | 第19-20页 |
| 1.3.2 DDBJ数据库 | 第20页 |
| 1.3.3 EMBL数据库 | 第20-21页 |
| 1.4 常用分析软件 | 第21-23页 |
| 1.4.1 IMEx | 第21-22页 |
| 1.4.2 FASTA | 第22页 |
| 1.4.3 BLAST | 第22-23页 |
| 1.4.4 DNAMAN | 第23页 |
| 1.4.5 SPSS | 第23页 |
| 1.5 本研究工作的目的和意义 | 第23-25页 |
| 第2章 材料与方法 | 第25-33页 |
| 2.1 人腺病毒B、D亚种基因序列信息 | 第25-28页 |
| 2.2 简单重复序列筛选原理 | 第28-30页 |
| 2.3 全基因组简单重复序列分析 | 第30-32页 |
| 2.4 纤毛、五邻体、六邻体基因组简单重复序列分析 | 第32-33页 |
| 第3章 结果分析与讨论 | 第33-43页 |
| 3.1 简单重复序列在全基因组中的分布特点 | 第33-35页 |
| 3.1.1 待测序列碱基组成 | 第33-34页 |
| 3.1.2 各型SSR均值比较 | 第34页 |
| 3.1.3 平均相对丰度及平均相对密度 | 第34页 |
| 3.1.4 最普遍的SSR | 第34-35页 |
| 3.1.5 同亚中间多序列比对分析 | 第35页 |
| 3.2 简单重复序列在纤毛、五邻体、六邻体基因组中的分布特点 | 第35-39页 |
| 3.2.1 纤毛、五邻体、六邻体基因组大小及位置比较 | 第35-36页 |
| 3.2.2 各结构中SSR的平均相对丰度、平均相对密度及总体标准差 | 第36-37页 |
| 3.2.3 各结构中SSR出现的次数 | 第37页 |
| 3.2.4 同结构间多序列比对及表达蛋白间的比对 | 第37-38页 |
| 3.2.5 各结构中最显著的SSR | 第38页 |
| 3.2.6 各结构中SSR及其生物学功能探究 | 第38-39页 |
| 3.3 讨论 | 第39-43页 |
| 总结 | 第43-44页 |
| 参考文献 | 第44-53页 |
| 附录A 攻读硕士学位期间所发表的学术论文目录 | 第53-54页 |
| 致谢 | 第54页 |
