| 摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-8页 |
| 第1章 文献综述 | 第14-30页 |
| 1.1 前言 | 第14-30页 |
| 1.1.1 结核病的防治现状 | 第14-16页 |
| 1.1.2 结核分枝杆菌的耐药情况 | 第16-18页 |
| 1.1.3 基因敲除技术在结核分枝杆菌中的应用 | 第18-22页 |
| 1.1.4 生物信息学在微生物研究中的应用 | 第22-25页 |
| 1.1.5 生物信息学常用的分析方法 | 第25-30页 |
| 第2章 基于VNTR分型的结核病分子流行病学调查 | 第30-54页 |
| 2.1 引言 | 第30-32页 |
| 2.1.1 基因分型的种类 | 第30-32页 |
| 2.2 实验方法 | 第32-38页 |
| 2.2.1 实验菌株 | 第32页 |
| 2.2.2 实验仪器和试剂 | 第32-33页 |
| 2.2.3 引物设计 | 第33-34页 |
| 2.2.4 菌种复苏 | 第34页 |
| 2.2.5 Tris法提取结核分枝杆菌DNA | 第34-35页 |
| 2.2.6 PCR反应体系 | 第35-36页 |
| 2.2.7 琼脂糖凝胶电泳 | 第36页 |
| 2.2.8 VNTR拷贝数的计算 | 第36-37页 |
| 2.2.9 菌株间亲缘关系分析 | 第37-38页 |
| 2.2.10 数据统计 | 第38页 |
| 2.3 实验结果 | 第38-52页 |
| 2.3.1 长春地区多重耐药结核分枝杆菌的流行病调查 | 第38-40页 |
| 2.3.2 VNTR分型电泳结果图 | 第40-47页 |
| 2.3.3 重复序列拷贝数 | 第47-48页 |
| 2.3.4 基因分型结果 | 第48-52页 |
| 2.4 讨论 | 第52-54页 |
| 第3章 基于生物信息学挖掘潜在的结核分枝杆菌细胞壁相关基因 | 第54-71页 |
| 3.1 引言 | 第54-59页 |
| 3.1.1 结核细胞壁的研究进展 | 第54-56页 |
| 3.1.2 聚类分析的特点及分类 | 第56-59页 |
| 3.2. 数据处理及方法 | 第59-63页 |
| 3.2.1 数据的收集和整理 | 第59-61页 |
| 3.2.2 基因表达数据的聚类分析 | 第61页 |
| 3.2.3 构建共表达网络和模型 | 第61-62页 |
| 3.2.4 多因素二分类回归分析细胞壁相关基因 | 第62页 |
| 3.2.5 Motif预测分析 | 第62-63页 |
| 3.2.6 统计学分析 | 第63页 |
| 3.3 技术路线 | 第63页 |
| 3.4 结果 | 第63-68页 |
| 3.4.1 结核分枝杆菌中细胞壁相关模体分析 | 第63-65页 |
| 3.4.2 细胞壁相关模块多因素二分类回归分析 | 第65-67页 |
| 3.4.3 细胞壁相关模块的motif分析 | 第67-68页 |
| 3.5 讨论 | 第68-71页 |
| 第4章 结合异烟肼对人体的副作用预测结核分枝杆菌中异烟肼的作用靶点 | 第71-88页 |
| 4.1 引言 | 第71-75页 |
| 4.1.1 结核分枝杆菌药物靶点的研究 | 第71-73页 |
| 4.1.2 药物副作用得研究进展 | 第73-75页 |
| 4.2 技术路线 | 第75页 |
| 4.3 材料和方法 | 第75-76页 |
| 4.3.1 数据的获取 | 第75-76页 |
| 4.3.2 构建共表达网络 | 第76页 |
| 4.3.3 统计学分析 | 第76页 |
| 4.4 结果 | 第76-87页 |
| 4.4.1.筛选异烟肼影响的基因 | 第76-78页 |
| 4.4.2.差异基因的重点分析 | 第78-79页 |
| 4.4.3.差异基因表达值的因子分析 | 第79-80页 |
| 4.4.4.提取结核分枝杆菌的目的基因片段 | 第80-82页 |
| 4.4.5.利用文献富集法提取异烟肼对于人体的副反应 | 第82-83页 |
| 4.4.6.结合两个物种分析作为药物靶点的目的片段 | 第83-84页 |
| 4.4.7. motif预测结果 | 第84-85页 |
| 4.4.8. 对于异烟肼敏感株和耐药株结核分枝杆菌酰基转移系统的差异 | 第85-87页 |
| 4.5 讨论 | 第87-88页 |
| 第5章 结论 | 第88-90页 |
| 第6章 参考文献 | 第90-103页 |
| 附录 | 第103-116页 |
| 作者简介 | 第116-118页 |
| 致谢 | 第118页 |
