| 摘要 | 第8-10页 |
| Abstract | 第10-11页 |
| 1 前言 | 第12-29页 |
| 1.1 寄主植物的抗性途径 | 第13-14页 |
| 1.2 R蛋白与AVR蛋白的互作模型 | 第14-18页 |
| 1.2.1 基因对基因的互作模型 | 第15-17页 |
| 1.2.1.1 受体配体模型(Ligand-Receptor Model) | 第15页 |
| 1.2.1.2 防卫模型(Guard Mode1) | 第15-16页 |
| 1.2.1.3 诱饵模型(Decoy Model) | 第16-17页 |
| 1.2.2 非R/V基因互作模式 | 第17-18页 |
| 1.3 稻瘟病菌无毒基因的克隆方法 | 第18-19页 |
| 1.4 稻瘟病菌无毒基因的结构及其功能 | 第19-25页 |
| 1.4.1 PWL基因家族的介绍 | 第19-20页 |
| 1.4.2 AVR-pita基因家族的介绍 | 第20页 |
| 1.4.3 AVR1-CO39的介绍 | 第20-21页 |
| 1.4.4 ACE1的介绍 | 第21-22页 |
| 1.4.5 AVRPiz-t的介绍 | 第22页 |
| 1.4.6 AVR-Pia、AVR-Pii和AVR-Pik/km/kp的介绍 | 第22-25页 |
| 1.5 稻瘟病菌无毒基因的遗传进化 | 第25-26页 |
| 1.6 无毒基因克隆的展望 | 第26-27页 |
| 1.7 本实验的研究意义 | 第27-29页 |
| 2 材料与方法 | 第29-44页 |
| 2.1 实验材料 | 第29-32页 |
| 2.1.1 供试菌株 | 第29页 |
| 2.1.2 供试水稻 | 第29页 |
| 2.1.3 实验载体 | 第29-30页 |
| 2.1.4 主要的生物信息学工具 | 第30-31页 |
| 2.1.5 培养基 | 第31页 |
| 2.1.6 实验试剂 | 第31-32页 |
| 2.2 实验方法 | 第32-44页 |
| 2.2.1 稻瘟病菌致病性鉴定 | 第32-33页 |
| 2.2.1.1 分生孢子培养 | 第32页 |
| 2.2.1.2 育苗和接种 | 第32页 |
| 2.2.1.3 调查和记载 | 第32-33页 |
| 2.2.2 稻瘟病菌菌丝体基因组DNA的精提 | 第33-34页 |
| 2.2.3 无毒池、有毒池的构建 | 第34页 |
| 2.2.4 SSR引物的开发及筛选 | 第34-35页 |
| 2.2.5 PATE(presence or absence ofa transposable element)标记的开发 | 第35页 |
| 2.2.6 遗传图谱及物理图谱的构建 | 第35页 |
| 2.2.7 PCR的扩增及产物检测 | 第35-36页 |
| 2.2.8 聚丙烯酰胺凝胶电泳的制备及PCR产物的检测 | 第36页 |
| 2.2.9 聚丙烯酰胺胶的快速银染 | 第36-37页 |
| 2.2.10 目的片段的回收 | 第37页 |
| 2.2.11 稻瘟病菌菌丝体总RNA的提取 | 第37-38页 |
| 2.2.12 RNA的反转录 | 第38-39页 |
| 2.2.13 T载体与目的片段的连接 | 第39页 |
| 2.2.14 E.coli DH5α感受态细胞的制备 | 第39-40页 |
| 2.2.15 感受态细胞的转化 | 第40页 |
| 2.2.16 验证大肠杆菌克隆子 | 第40页 |
| 2.2.17 SOE的方法构建基因敲除片段 | 第40-41页 |
| 2.2.18 稻瘟病菌原生质体的制备 | 第41-42页 |
| 2.2.19 原生质体的转化及转化子验证 | 第42-43页 |
| 2.2.20 表型鉴定 | 第43-44页 |
| 3 结果与分析 | 第44-70页 |
| 3.1 无毒基因AVR-Pid3的初步定位 | 第44-54页 |
| 3.1.1 亲本菌株GUY11和FJ81278的毒性分析 | 第44-45页 |
| 3.1.2 AVR-Pid3在后代群体中的遗传分析 | 第45页 |
| 3.1.3 SSR标记对AVR-Pid3的连锁分析 | 第45-48页 |
| 3.1.4 AVR-Pid3连锁遗传图谱的构建 | 第48-49页 |
| 3.1.5 AVR-Pid3物理图谱的构建 | 第49-51页 |
| 3.1.6 对AVR-Pid3的定位区域进行分析 | 第51-54页 |
| 3.2 基因MGG_08817、MGG_10531、MGG_03946和MGG_03593功能分析 | 第54-70页 |
| 3.2.1 生物信息学分析结果 | 第54-57页 |
| 3.2.2 基因MGG_08817、MGG_10531、MGG_03946和MGG_03593敲除突变体的获得 | 第57-60页 |
| 3.2.2.1 四个基因敲除片段的构建 | 第57-59页 |
| 3.2.2.2 四个基因敲除转化子的筛选与验证 | 第59-60页 |
| 3.2.3 敲除突变体的表型分析 | 第60-70页 |
| 3.2.3.1 基因MGG_08817敲除突变体的表型分析 | 第60-63页 |
| 3.2.3.2 基因MGG_10531敲除突变体的表型分析 | 第63-66页 |
| 3.2.3.3 基因MGG_03946敲除突变体的表型分析 | 第66-68页 |
| 3.2.3.4 基因MGG_03593敲除突变体的表型分析 | 第68-70页 |
| 4 结论与讨论 | 第70-73页 |
| 4.1 AVR-Pid3的定位分析 | 第70-71页 |
| 4.2 基因MGG_08817、MGG_10531、MGG_03946和MGG_03593的分析 | 第71-73页 |
| 参考文献 | 第73-80页 |
| 附录 | 第80-87页 |
| 附录一 | 第80-81页 |
| 附录二 | 第81-85页 |
| 附录三 | 第85-87页 |
| 致谢 | 第87页 |
