| 摘要 | 第7-8页 |
| Abstract | 第8-9页 |
| 缩略语 | 第10-11页 |
| 1 前言 | 第11-19页 |
| 1.1 花生青枯病 | 第11-12页 |
| 1.1.1 花生 | 第11页 |
| 1.1.2 病原菌 | 第11页 |
| 1.1.3 青枯菌的侵染过程 | 第11-12页 |
| 1.2 植物抗病机制 | 第12-14页 |
| 1.2.1 植物抗病防御模式 | 第12页 |
| 1.2.2 植物抗病基因 | 第12-13页 |
| 1.2.3 植物抗病有关LRR型基因 | 第13-14页 |
| 1.3 抗青枯病研究进展 | 第14-15页 |
| 1.3.1 拟南芥抗青枯病研究 | 第14页 |
| 1.3.2 烟草抗青枯病研究 | 第14页 |
| 1.3.3 番茄抗青枯病研究 | 第14-15页 |
| 1.4 差异表达研究技术 | 第15-17页 |
| 1.4.1 基因芯片 | 第15页 |
| 1.4.2 高通量测序技术 | 第15-16页 |
| 1.4.3 基因芯片与数字基因表达标签谱技术比较 | 第16-17页 |
| 1.5 花生基因表达谱研究现状 | 第17页 |
| 1.6 研究意义 | 第17-19页 |
| 2 实验材料与方法 | 第19-27页 |
| 2.1 材料 | 第19-20页 |
| 2.1.1 花生材料 | 第19页 |
| 2.1.2 菌株 | 第19页 |
| 2.1.3 试剂材料 | 第19页 |
| 2.1.4 培养基 | 第19页 |
| 2.1.5 引物设计 | 第19-20页 |
| 2.2 实验方法与步骤 | 第20-27页 |
| 2.2.1 花生青枯病原菌的活化 | 第20-21页 |
| 2.2.2 样品处理与采集 | 第21页 |
| 2.2.3 Total RNA的提取 | 第21-22页 |
| 2.2.4 基因表达谱的测序分析 | 第22-23页 |
| 2.2.5 cDNA的合成 | 第23页 |
| 2.2.6 实时荧光定量PCR | 第23页 |
| 2.2.7 LRR基因的表达分析 | 第23-24页 |
| 2.2.8 SMART RACE克隆基因全长 | 第24-25页 |
| 2.2.9 基因ORF的克隆 | 第25-26页 |
| 2.2.10 基因克隆测序 | 第26-27页 |
| 3 结果与分析 | 第27-40页 |
| 3.1 Total RNA的定量定性分析 | 第27页 |
| 3.2 测序结果评估 | 第27-29页 |
| 3.2.1 总体reads比对评估 | 第27-28页 |
| 3.2.2 差异表达基因统计评估 | 第28-29页 |
| 3.3 青枯病侵染花生表达谱分析 | 第29-31页 |
| 3.3.1 植物防御信号途径相关基因表达分析 | 第29-30页 |
| 3.3.2 苯基丙烷信号途径相关基因表达情况 | 第30-31页 |
| 3.3.3 类黄酮生物合成途径相关基因 | 第31页 |
| 3.4 real-time PCR验证表达谱差异基因 | 第31-33页 |
| 3.5 NBS-LRR基因在抗感品种间的差异表达分析 | 第33-34页 |
| 3.6 NBS-LRR基因的克隆与分析 | 第34-40页 |
| 3.6.1 Ah_5262的RACE克隆与分析 | 第34-36页 |
| 3.6.2 Ah_17544的克隆与分析 | 第36-40页 |
| 4 讨论 | 第40-44页 |
| 4.1 花生响应青枯菌侵染信号途径 | 第40页 |
| 4.2 花生响应青枯菌侵染相关基因 | 第40-41页 |
| 4.2.1 LRR基因 | 第40-41页 |
| 4.2.2 其他相关基因 | 第41页 |
| 4.3 研究中所存在问题分析 | 第41-43页 |
| 4.3.1 表达谱与参照基因 | 第41-42页 |
| 4.3.2 表达谱测序样品处理 | 第42页 |
| 4.3.3 RACE | 第42-43页 |
| 4.4 小结 | 第43-44页 |
| 参考文献 | 第44-48页 |
| 致谢 | 第48页 |