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聚胞嘧啶结合蛋白1调控肠道病毒71型基因表达和复制的分子机制研究

论文创新点第5-6页
中文摘要第6-8页
Abstract第8-9页
引言第14页
第一部分 研究背景第14-50页
    第一章 EV71简介第14-32页
        1.1 EV71的流行病毒学第14-15页
        1.2 EV71的分子病毒学第15-24页
            1.2.1 EV71的理化特征第15-16页
            1.2.2 EV71的基因组第16-18页
            1.2.3 EV71的生活周期第18-24页
        1.3 EV71的感染及发病机理第24-27页
            1.3.1 EV71的传播途径第24-25页
            1.3.2 EV71相关的病症机理第25-27页
        1.4 EV71的预防及治疗第27-32页
            1.4.1 EV71传播的监管和隔离措施第27页
            1.4.2 EV71疫苗的开发第27-28页
            1.4.3 EV71抗病毒药物的开发第28-32页
    第二章 PCBP1蛋白简介第32-39页
        2.1 PCBP1的发现和定义第32-33页
        2.2 PCBP1的结构第33-34页
        2.3 PCBP1的定位第34页
        2.4 PCBP1的功能第34-39页
            2.4.1 转录激活第34-35页
            2.4.2 衰减选择性剪接调节第35页
            2.4.3 mRNA稳定第35-36页
            2.4.4 翻译调节第36页
            2.4.5 促进肿瘤发生和癌症进程第36-37页
            2.4.6 铁转运和储存第37-39页
    第三章 宿主蛋白与RNA病毒复制的关系第39-50页
        3.1 特异性IRES反式转录因子(ITAFs)第39-41页
            3.1.1 hnRNP A1第39-40页
            3.1.2 FBP1和FBP2第40页
            3.1.3 hnRNP K第40-41页
        3.2 其他宿主蛋白第41-44页
            3.2.1 RTN3第41-42页
            3.2.2 CstF-64第42-44页
        3.3 病毒复制复合体第44-50页
            3.3.1 结构第44-47页
            3.3.2 功能第47-48页
            3.3.3 重排过程第48-50页
第二部分 研究内容第50-91页
    第四章 PCBP1与EV715'UTR RNA特异性结合的研究第50-62页
        4.1 引言第50页
        4.2 实验材料及仪器第50-52页
            4.2.0 细胞第50页
            4.2.1 病毒第50-51页
            4.2.2 引物第51页
            4.2.3 工具酶第51页
            4.2.4 生物试剂第51页
            4.2.5 化学试剂及仪器第51-52页
        4.3 实验方法第52-57页
            4.3.1 哺乳动物细胞培养第52-53页
            4.3.2 病毒扩增及滴度测定第53-54页
            4.3.3 Trizol法提取细胞总RNA第54-55页
            4.3.4 免疫沉淀及RT-PCR第55-56页
            4.4.5 RNA体外转录第56页
            4.4.6 非变性凝胶迁移试验(Native gel mobility shift assay)第56-57页
            4.4.7 生物素标记RNA pull-down第57页
        4.4 实验结果和讨论第57-62页
            4.4.1 PCBP1蛋白在体外能特异性结合EV71 5'UTR第57-59页
            4.4.2 PCBP1蛋白在细胞水平特异性结合EV71 5'UTR第59-62页
    第五章 PCBP1与EV71 5'UTR结合结构域的分析第62-71页
        5.1 引言第62页
        5.2 实验材料和仪器第62-64页
            5.2.1 细胞和菌株第62-63页
            5.2.3 引物第63页
            5.2.4 工具酶第63页
            5.2.5 生物试剂第63页
            5.2.6 化学试剂及实验仪器第63-64页
        5.3 实验方法第64-68页
            5.3.1 高纯度质粒提取(以Qiagen试剂盒为例)第64-65页
            5.3.2 DNA目的片段回收(以Axygen试剂盒为例)第65页
            5.3.3 大肠杆菌感受态细胞的制备第65页
            5.3.4 大肠杆菌常规转化方法(Yc法)第65-66页
            5.3.5 哺乳动物细胞转染第66页
            5.3.6 蛋白质免疫印迹(Western Blot)第66-68页
        5.4 实验结果和讨论第68-71页
            5.4.1 PCBP1结合在EV71 5'UTR的茎环结构Ⅰ和Ⅳ区域第68-69页
            5.4.2 PCBP1的KH1结构域参与EV71 5'UTR的结合第69-71页
    第六章 EV71对PCBP1亚细胞定位的影响第71-76页
        6.1 引言第71页
        6.2 实验材料和仪器第71-72页
            6.2.1 细胞第71页
            6.2.2 EV71病毒感染第71页
            6.2.3 生物试剂第71-72页
            6.2.4 化学试剂及实验仪器第72页
        6.3 实验方法第72-73页
            6.3.1 免疫荧光第72-73页
            6.3.2 细胞核蛋白抽提第73页
            6.3.3 其他实验方法第73页
        6.4 实验结果和讨论第73-76页
            6.4.1 EV71感染引起PCBP1在细胞质中的重分布第73-75页
            6.4.2 EV71感染增加PCBP1在细胞质中分布第75-76页
    第七章 PCBP1定位于内质网膜相关EV71病毒复制复合体第76-80页
        7.1 引言第76页
        7.2 实验材料及仪器第76-77页
            7.2.1 细胞和病毒感染第76页
            7.2.2 生物试剂第76页
            7.2.3 实验材料及仪器第76-77页
        7.3 实验方法第77-78页
            7.3.1 免疫荧光第77页
            7.3.2 膜分离及溶解试验(Membrane flotation and detergent solubilizationassays)第77页
            7.3.3 Western blot第77-78页
        7.4 实验结果和讨论第78-80页
            7.4.1 PCBP1,内质网来源膜结构和病毒RNA的共定位第78-79页
            7.4.2 PCBP1定位于EV71病毒复制膜复合体第79-80页
    第八章 PCBP1蛋白促进EV71病毒蛋白翻译和病毒产量第80-86页
        8.1 引言第80页
        8.2 实验材料和仪器第80页
            8.2.1 细胞和病毒第80页
            8.2.2 生物试剂及仪器第80页
        8.3 实验方法第80-82页
            8.3.1 哺乳动物细胞瞬时转染第80-81页
            8.3.2 免疫印迹第81页
            8.3.3 MTT法测定细胞活性实验第81页
            8.3.4 TCID50法测定病毒滴度第81页
            8.3.5 统计学分析第81-82页
        8.4 实验结果和讨论第82-86页
            8.4.1 PCBP1蛋白在真核细胞中的表达效率第82-83页
            8.4.2 PCBP1促进EV71病毒蛋白的翻译第83-84页
            8.4.3 PCBP1促进EV71子代病毒的产量第84-86页
    第九章 PCBP1从翻译和RNA复制水平促进EV71复制第86-91页
        9.1 引言第86页
        9.2 实验材料和仪器第86-87页
            9.2.1 细胞和病毒第86页
            9.2.2 质粒第86页
            9.2.3 引物第86-87页
            9.2.4 生物试剂第87页
            9.2.5 实验仪器第87页
        9.3 实验方法第87-88页
            9.3.1 哺乳动物细胞的转染(见第五章)第87页
            9.3.2 荧光素酶报告基因检测第87-88页
            9.3.3 Trizol法提取细胞内RNA(见第四章)第88页
            9.3.4 Real-time RT-PCR检测病毒+/-链RNA第88页
        9.4 实验结果和讨论第88-91页
            9.4.1 PCBP1增强EV71 IRES的翻译活性第88-89页
            9.4.2 PCBP1增强EV71 RNA的合成第89-91页
总论第91-94页
附表I 本研究中涉及的引物序列信息第94-96页
附表II 常用试剂配方第96-97页
参考文献第97-113页
攻博期间发表和待发表的论文第113-114页
致谢第114页

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